44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1739 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1739  transcriptional antiterminator  100 
 
 		 470 aa  945    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000739746  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0194  BglG family transcriptional antiterminator  29.88 
 
 		 639 aa  157  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0235  PRD domain-containing protein  25.67 
 
 		 698 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0229  transcriptional antiterminator, BglG  25.67 
 
 		 698 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2934  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  24.07 
 
 		 714 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1407  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  29.46 
 
 		 709 aa  93.6  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.126789  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2011  transcriptional antiterminator, BglG  29.76 
 
 		 701 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0269  transcriptional antiterminator, BglG  22.98 
 
 		 680 aa  80.5  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0237  transcriptional antiterminator, BglG  35.97 
 
 		 705 aa  79.7  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  21.72 
 
 		 692 aa  77.8  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2189  transcriptional antiterminator, BglG  34.84 
 
 		 710 aa  74.3  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2227  PRD domain-containing protein  34.84 
 
 		 710 aa  74.3  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2796  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  27.27 
 
 		 696 aa  71.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2664  BglG family transcriptional antiterminator  28.37 
 
 		 701 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1484  transcriptional antiterminator  29.3 
 
 		 668 aa  67.4  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.553371  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2984  PTS system, lactose/cellobiose specific IIB subunit  27.52 
 
 		 612 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00361591  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0391  PRD domain-containing protein  20.9 
 
 		 651 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0381  transcriptional antiterminator, BglG  20.9 
 
 		 651 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1846  transcriptional antiterminator, BglG  27.46 
 
 		 685 aa  65.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20170  transcriptional antiterminator, BglG  26.34 
 
 		 741 aa  64.3  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1382  transcriptional antiterminator, BglG  31.47 
 
 		 681 aa  62.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104682  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0134  transcriptional antiterminator, BglG  22.03 
 
 		 688 aa  61.2  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0823  transcriptional antiterminator, BglG  28.83 
 
 		 652 aa  60.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.325703  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0221  transcriptional antiterminator, BglG  26.85 
 
 		 674 aa  60.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3395  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25.53 
 
 		 661 aa  60.1  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1613  transcriptional antiterminator, BglG  31.14 
 
 		 689 aa  58.9  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1204  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  26.06 
 
 		 683 aa  58.2  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3959  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  30.43 
 
 		 696 aa  58.2  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1463  transcriptional antiterminator, BglG  28.46 
 
 		 684 aa  56.2  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1151  transcriptional antiterminator, BglG  23.9 
 
 		 642 aa  55.1  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1587  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25.77 
 
 		 625 aa  53.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3754  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.44 
 
 		 705 aa  52  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1731  transcriptional antiterminator, BglG  19.95 
 
 		 698 aa  49.3  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0038  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  29.66 
 
 		 703 aa  48.9  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.977169  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1683  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.7 
 
 		 646 aa  48.1  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3997  putative PTS regulatory protein  21.12 
 
 		 517 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3633  stationary phase inducible protein CsiE  31.46 
 
 		 421 aa  47.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3187  transcriptional antiterminator, BglG  24.37 
 
 		 685 aa  47  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000270026  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0336  transcriptional antiterminator, BglG  23.28 
 
 		 516 aa  46.2  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373186  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0328  transcriptional antiterminator, BglG  23.53 
 
 		 516 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.341151  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3555  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25.79 
 
 		 712 aa  45.8  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3160  transcriptional antiterminator, BglG  29.52 
 
 		 710 aa  45.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1801  BglG family transcriptional antiterminator  23.94 
 
 		 559 aa  44.7  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2754  transcriptional antiterminator, BglG  25.35 
 
 		 655 aa  43.9  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>