196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3959 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3959  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  100 
 
 
696 aa  1362    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1351  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  39.16 
 
 
670 aa  404  1e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1382  transcriptional antiterminator, BglG  30.59 
 
 
681 aa  315  9.999999999999999e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104682  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3160  transcriptional antiterminator, BglG  31.72 
 
 
710 aa  293  9e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1731  transcriptional antiterminator, BglG  30.31 
 
 
698 aa  282  1e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0038  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  29.11 
 
 
703 aa  270  5.9999999999999995e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.977169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3754  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  30.89 
 
 
705 aa  268  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0237  transcriptional antiterminator, BglG  26.29 
 
 
705 aa  259  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3369  transcriptional antiterminator, BglG  28.9 
 
 
687 aa  257  6e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0134  transcriptional antiterminator, BglG  27.74 
 
 
688 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3555  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  29.33 
 
 
712 aa  243  7e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1463  transcriptional antiterminator, BglG  29.69 
 
 
684 aa  228  3e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3187  transcriptional antiterminator, BglG  28.49 
 
 
685 aa  224  4e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000270026  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3177  transcriptional antiterminator, BglG  27.71 
 
 
557 aa  211  5e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000121797  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1204  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25.76 
 
 
683 aa  208  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0213  transcriptional antiterminator, BglG  27.23 
 
 
678 aa  202  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1613  transcriptional antiterminator, BglG  27.23 
 
 
689 aa  201  5e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2011  transcriptional antiterminator, BglG  24.23 
 
 
701 aa  197  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1407  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  24.76 
 
 
709 aa  196  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.126789  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2934  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  24.34 
 
 
714 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1151  transcriptional antiterminator, BglG  27.03 
 
 
642 aa  189  1e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20170  transcriptional antiterminator, BglG  24.76 
 
 
741 aa  187  8e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  27.81 
 
 
692 aa  171  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2664  BglG family transcriptional antiterminator  23.98 
 
 
701 aa  170  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0381  transcriptional antiterminator, BglG  23.03 
 
 
651 aa  158  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0391  PRD domain-containing protein  23.03 
 
 
651 aa  158  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1484  transcriptional antiterminator  25.4 
 
 
668 aa  153  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.553371  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0823  transcriptional antiterminator, BglG  24.72 
 
 
652 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.325703  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0229  transcriptional antiterminator, BglG  21.97 
 
 
698 aa  139  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0235  PRD domain-containing protein  21.97 
 
 
698 aa  139  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2984  PTS system, lactose/cellobiose specific IIB subunit  24.17 
 
 
612 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00361591  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1169  transcriptional antiterminator, BglG  22.87 
 
 
648 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00649229  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2796  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.54 
 
 
696 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0843  transcription antiterminator, BglG family  25.14 
 
 
646 aa  120  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0686  BigG family transcription antiterminator  25.34 
 
 
646 aa  118  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0952  transcription antiterminator, BglG family  25.43 
 
 
646 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439508  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0881  BigG family transcription antiterminator  25.15 
 
 
643 aa  117  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.441877  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0701  transcriptional antiterminator, BglG  26.1 
 
 
646 aa  117  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0751  BigG family transcription antiterminator  25.34 
 
 
646 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0790  BigG family transcription antiterminator  25.34 
 
 
646 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0883  transcription antiterminator, BglG family  25.34 
 
 
646 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.28346e-33 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0194  BglG family transcriptional antiterminator  23.68 
 
 
639 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2754  transcriptional antiterminator, BglG  25.96 
 
 
655 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0699  BigG family transcription antiterminator  25.34 
 
 
646 aa  115  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4493  transcription antiterminator, BglG family  24.75 
 
 
646 aa  114  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0226696  hitchhiker  0.0000000000157823 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3395  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  20.54 
 
 
661 aa  110  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0269  transcriptional antiterminator, BglG  23.68 
 
 
680 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4372  transcriptional antiterminator, BglG  19.89 
 
 
638 aa  97.8  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180712  normal  0.327197 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3151  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  20.08 
 
 
641 aa  96.3  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1846  transcriptional antiterminator, BglG  25.44 
 
 
685 aa  95.1  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0336  transcriptional antiterminator, BglG  22.35 
 
 
516 aa  94.7  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373186  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2664  transcriptional antiterminator, BglG  21.77 
 
 
624 aa  93.6  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2720  PRD domain-containing protein  21.77 
 
 
624 aa  93.6  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0328  transcriptional antiterminator, BglG  22.05 
 
 
516 aa  92.8  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.341151  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3997  putative PTS regulatory protein  21.9 
 
 
517 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2189  transcriptional antiterminator, BglG  22.54 
 
 
710 aa  89.7  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2227  PRD domain-containing protein  22.54 
 
 
710 aa  89.7  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4828  HTH domain-containing protein  21.02 
 
 
637 aa  89.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4794  transcriptional antiterminator, BglG  21.02 
 
 
637 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4849  transcriptional antiterminator, BglG  21.02 
 
 
637 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4699  transcriptional antiterminator, BglG  21.02 
 
 
637 aa  89  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.613888 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4730  transcriptional antiterminator, BglG  21.02 
 
 
637 aa  89  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.398231  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1464  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  39.13 
 
 
149 aa  88.2  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2259  BglG family transcriptional antiterminator  22.22 
 
 
623 aa  87.8  7e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0196  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25.88 
 
 
628 aa  82  0.00000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0221  transcriptional antiterminator, BglG  18.46 
 
 
674 aa  79  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0232  transcriptional antiterminator  25.05 
 
 
496 aa  78.2  0.0000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1587  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.72 
 
 
625 aa  75.1  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1267  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, EIIA 2  29.08 
 
 
149 aa  74.7  0.000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0108349 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0929  transcriptional antiterminator  25.68 
 
 
663 aa  74.3  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1801  BglG family transcriptional antiterminator  20.88 
 
 
559 aa  74.3  0.000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1737  phosphotransferase system mannitol/fructose-specific IIA domain-containing protein  30.71 
 
 
151 aa  73.9  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.108032  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0129  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  33.33 
 
 
152 aa  73.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2933  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.58 
 
 
147 aa  72.8  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0655  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  21.38 
 
 
645 aa  70.9  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3798  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.14 
 
 
154 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5711  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  30.14 
 
 
154 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1150  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  33.33 
 
 
138 aa  70.5  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4666  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  30.14 
 
 
154 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3188  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  31.47 
 
 
151 aa  68.9  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192348  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3818  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  29.45 
 
 
154 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531551 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3368  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.73 
 
 
143 aa  66.6  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4653  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  29.45 
 
 
154 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4663  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  29.45 
 
 
154 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.9682  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0984  PTS system, IIA component  28.57 
 
 
168 aa  66.6  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4782  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  29.45 
 
 
154 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.34657  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4746  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  29.45 
 
 
154 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4803  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  29.45 
 
 
154 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04062  L-ascorbate-specific enzyme IIA component of PTS  28.08 
 
 
154 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4439  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  28.08 
 
 
154 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4755  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  28.08 
 
 
154 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04024  hypothetical protein  28.08 
 
 
154 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1408  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.34 
 
 
147 aa  65.9  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.808256  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4725  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  28.08 
 
 
154 aa  65.5  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569528  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0290  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.73 
 
 
158 aa  65.1  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0901899  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0103  HTH-type transcriptional regulator  20.94 
 
 
656 aa  64.7  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0686  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  27.78 
 
 
627 aa  64.7  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00026813  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2491  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.94 
 
 
144 aa  64.3  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0779961  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0117  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  23.97 
 
 
158 aa  62.8  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0354562  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1813  PTS system, IIA component  27.43 
 
 
161 aa  62.4  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>