188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1351 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1351  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  100 
 
 
670 aa  1291    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3959  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  39.16 
 
 
696 aa  399  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1382  transcriptional antiterminator, BglG  31.33 
 
 
681 aa  250  7e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104682  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3369  transcriptional antiterminator, BglG  28.43 
 
 
687 aa  216  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3160  transcriptional antiterminator, BglG  28.13 
 
 
710 aa  201  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0213  transcriptional antiterminator, BglG  27.49 
 
 
678 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0134  transcriptional antiterminator, BglG  27.65 
 
 
688 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1731  transcriptional antiterminator, BglG  27.63 
 
 
698 aa  194  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0038  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  27.64 
 
 
703 aa  194  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.977169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1613  transcriptional antiterminator, BglG  27.49 
 
 
689 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0237  transcriptional antiterminator, BglG  24.89 
 
 
705 aa  184  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3754  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  27.71 
 
 
705 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1151  transcriptional antiterminator, BglG  28.78 
 
 
642 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3555  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  27.07 
 
 
712 aa  170  7e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3187  transcriptional antiterminator, BglG  25.62 
 
 
685 aa  164  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000270026  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1204  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  26.64 
 
 
683 aa  160  8e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0381  transcriptional antiterminator, BglG  23.75 
 
 
651 aa  156  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0391  PRD domain-containing protein  23.75 
 
 
651 aa  156  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1407  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  24.2 
 
 
709 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.126789  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2934  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  24.08 
 
 
714 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1463  transcriptional antiterminator, BglG  26.52 
 
 
684 aa  148  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2664  BglG family transcriptional antiterminator  24.85 
 
 
701 aa  144  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3177  transcriptional antiterminator, BglG  28.16 
 
 
557 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000121797  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2011  transcriptional antiterminator, BglG  22.93 
 
 
701 aa  134  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  24.91 
 
 
692 aa  117  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20170  transcriptional antiterminator, BglG  23.79 
 
 
741 aa  116  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2984  PTS system, lactose/cellobiose specific IIB subunit  24.59 
 
 
612 aa  111  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00361591  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1484  transcriptional antiterminator  25.23 
 
 
668 aa  111  5e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.553371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0229  transcriptional antiterminator, BglG  22.01 
 
 
698 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0235  PRD domain-containing protein  22.01 
 
 
698 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4828  HTH domain-containing protein  22.83 
 
 
637 aa  104  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4699  transcriptional antiterminator, BglG  22.47 
 
 
637 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.613888 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4730  transcriptional antiterminator, BglG  22.47 
 
 
637 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.398231  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4849  transcriptional antiterminator, BglG  22.47 
 
 
637 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4794  transcriptional antiterminator, BglG  22.47 
 
 
637 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3395  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  20.03 
 
 
661 aa  99.8  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1169  transcriptional antiterminator, BglG  21.44 
 
 
648 aa  92.8  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00649229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0823  transcriptional antiterminator, BglG  24.05 
 
 
652 aa  92  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.325703  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4372  transcriptional antiterminator, BglG  21.62 
 
 
638 aa  91.7  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180712  normal  0.327197 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0433  transcriptional antiterminator, BglG  21.66 
 
 
636 aa  88.2  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0103  HTH-type transcriptional regulator  21.47 
 
 
656 aa  87.8  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2754  transcriptional antiterminator, BglG  25.92 
 
 
655 aa  83.2  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1846  transcriptional antiterminator, BglG  26.82 
 
 
685 aa  82.8  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0916  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  20.21 
 
 
636 aa  82  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.60605  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3151  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  20.36 
 
 
641 aa  82  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2664  transcriptional antiterminator, BglG  22.57 
 
 
624 aa  81.3  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2720  PRD domain-containing protein  22.57 
 
 
624 aa  81.3  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0701  transcriptional antiterminator, BglG  23.85 
 
 
646 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0952  transcription antiterminator, BglG family  22.32 
 
 
646 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439508  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2259  BglG family transcriptional antiterminator  20.2 
 
 
623 aa  76.3  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0843  transcription antiterminator, BglG family  22.49 
 
 
646 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2796  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  18.86 
 
 
696 aa  75.1  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4493  transcription antiterminator, BglG family  22.32 
 
 
646 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0226696  hitchhiker  0.0000000000157823 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0686  BigG family transcription antiterminator  22.17 
 
 
646 aa  73.9  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0929  transcriptional antiterminator  21.38 
 
 
663 aa  73.2  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0881  BigG family transcription antiterminator  22.18 
 
 
643 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.441877  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1464  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.16 
 
 
149 aa  72  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0290  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  26.43 
 
 
158 aa  72  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0901899  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1801  BglG family transcriptional antiterminator  22 
 
 
559 aa  71.2  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0751  BigG family transcription antiterminator  22.01 
 
 
646 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0790  BigG family transcription antiterminator  22.01 
 
 
646 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0883  transcription antiterminator, BglG family  22.01 
 
 
646 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.28346e-33 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2189  transcriptional antiterminator, BglG  22.55 
 
 
710 aa  70.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2227  PRD domain-containing protein  22.55 
 
 
710 aa  70.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4653  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  36.61 
 
 
154 aa  70.1  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0194  BglG family transcriptional antiterminator  19.81 
 
 
639 aa  70.1  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4663  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  36.61 
 
 
154 aa  70.1  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.9682  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0984  PTS system, IIA component  28.93 
 
 
168 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4782  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  36.61 
 
 
154 aa  70.1  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.34657  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4746  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  36.61 
 
 
154 aa  70.1  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0699  BigG family transcription antiterminator  21.97 
 
 
646 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3798  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  36.54 
 
 
154 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5711  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  36.54 
 
 
154 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4666  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  36.54 
 
 
154 aa  68.6  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4803  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  35.71 
 
 
154 aa  68.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4725  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  34.62 
 
 
154 aa  67.8  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569528  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0117  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  26.27 
 
 
158 aa  67.4  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0354562  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3818  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  35.58 
 
 
154 aa  67.4  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531551 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04062  L-ascorbate-specific enzyme IIA component of PTS  34.62 
 
 
154 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4439  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  34.62 
 
 
154 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4755  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  34.62 
 
 
154 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04024  hypothetical protein  34.62 
 
 
154 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0328  transcriptional antiterminator, BglG  21.31 
 
 
516 aa  64.7  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.341151  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1286  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.54 
 
 
151 aa  64.3  0.000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2491  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  31.11 
 
 
144 aa  63.5  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0779961  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3368  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  26.87 
 
 
143 aa  62.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3633  stationary phase inducible protein CsiE  21.88 
 
 
421 aa  62.4  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673534  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0501  PTS system L-ascorbate family IIA subunit  29.5 
 
 
147 aa  62  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.114156  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0269  transcriptional antiterminator, BglG  25.89 
 
 
680 aa  62.4  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1737  phosphotransferase system mannitol/fructose-specific IIA domain-containing protein  25.87 
 
 
151 aa  62  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.108032  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0196  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  24.08 
 
 
628 aa  61.6  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1813  PTS system, IIA component  23.29 
 
 
161 aa  61.2  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0336  transcriptional antiterminator, BglG  21.95 
 
 
516 aa  60.8  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373186  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1150  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.77 
 
 
138 aa  60.1  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0489  putative PTS system enzyme IIA component protein  28.78 
 
 
147 aa  59.7  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1587  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.56 
 
 
625 aa  58.5  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0686  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  26.34 
 
 
627 aa  59.3  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00026813  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3997  putative PTS regulatory protein  25.54 
 
 
517 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0221  transcriptional antiterminator, BglG  18.48 
 
 
674 aa  57  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2795  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  26.95 
 
 
147 aa  57  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>