57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3633 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3633  stationary phase inducible protein CsiE  100 
 
 		 421 aa  863    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1270  stationary phase inducible protein CsiE  53.76 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00156699  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0443  stationary phase inducible protein CsiE  54.16 
 
 		 448 aa  436  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000142576  hitchhiker  0.00000119159 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1161  stationary phase inducible protein CsiE  53.76 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018222  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3033  stationary phase inducible protein CsiE  45.54 
 
 		 425 aa  335  1e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.129914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2753  stationary phase inducible protein CsiE  42.92 
 
 		 425 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2708  stationary phase inducible protein CsiE  42.69 
 
 		 425 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2794  stationary phase inducible protein CsiE  42.45 
 
 		 425 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2928  stationary phase inducible protein CsiE  42.69 
 
 		 425 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2815  stationary phase inducible protein CsiE  42.45 
 
 		 425 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2821  stationary phase inducible protein CsiE  41.88 
 
 		 426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00197749  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2689  stationary phase inducible protein CsiE  41.88 
 
 		 426 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02391  hypothetical protein  41.65 
 
 		 426 aa  302  9e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.440596  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1142  stationary phase inducible protein CsiE  41.65 
 
 		 426 aa  302  9e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662346  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02427  stationary phase inducible protein  41.65 
 
 		 426 aa  302  9e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.634141  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3768  stationary phase inducible protein CsiE  41.65 
 
 		 426 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.738603  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1133  transcriptional antiterminator, BglG  41.65 
 
 		 426 aa  301  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2911  stationary phase inducible protein CsiE  41.16 
 
 		 431 aa  295  8e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0262062  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2934  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.77 
 
 		 714 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1407  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.94 
 
 		 709 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.126789  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  22.55 
 
 		 692 aa  66.6  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1801  BglG family transcriptional antiterminator  23.15 
 
 		 559 aa  66.6  0.0000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0391  PRD domain-containing protein  22.51 
 
 		 651 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0381  transcriptional antiterminator, BglG  22.51 
 
 		 651 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0823  transcriptional antiterminator, BglG  22.66 
 
 		 652 aa  60.5  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.325703  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0194  BglG family transcriptional antiterminator  24.62 
 
 		 639 aa  60.1  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0235  PRD domain-containing protein  22.53 
 
 		 698 aa  59.7  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0229  transcriptional antiterminator, BglG  22.53 
 
 		 698 aa  59.7  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0213  transcriptional antiterminator, BglG  20.4 
 
 		 678 aa  58.9  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0221  transcriptional antiterminator, BglG  35.96 
 
 		 674 aa  57.4  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2984  PTS system, lactose/cellobiose specific IIB subunit  18.65 
 
 		 612 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00361591  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1204  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  20.89 
 
 		 683 aa  56.6  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1613  transcriptional antiterminator, BglG  21.9 
 
 		 689 aa  55.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2664  BglG family transcriptional antiterminator  17.79 
 
 		 701 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2189  transcriptional antiterminator, BglG  27.5 
 
 		 710 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2227  PRD domain-containing protein  27.5 
 
 		 710 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1351  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  21.25 
 
 		 670 aa  53.5  0.000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0103  HTH-type transcriptional regulator  20.78 
 
 		 656 aa  51.2  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0237  transcriptional antiterminator, BglG  31.18 
 
 		 705 aa  51.2  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1587  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.28 
 
 		 625 aa  48.9  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1739  transcriptional antiterminator  31.46 
 
 		 470 aa  47.8  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000739746  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0196  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  21.34 
 
 		 628 aa  47  0.0006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3369  transcriptional antiterminator, BglG  25.74 
 
 		 687 aa  46.6  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1169  transcriptional antiterminator, BglG  20.13 
 
 		 648 aa  46.6  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00649229  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0742  transcriptional antiterminator, BglG  38.81 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3151  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  21.92 
 
 		 641 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2720  PRD domain-containing protein  26.19 
 
 		 624 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2664  transcriptional antiterminator, BglG  26.19 
 
 		 624 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0978  transcriptional antiterminator, BglG  38.81 
 
 		 313 aa  45.8  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2741  transcriptional antiterminator, BglG  33.33 
 
 		 277 aa  44.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0375985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1756  beta-glucoside operon antiterminator  33.9 
 
 		 282 aa  43.9  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000280002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03551  hypothetical protein  25.24 
 
 		 278 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2325  transcriptional antiterminator, BglG  38.24 
 
 		 279 aa  43.5  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03607  transcriptional antiterminator of the bgl operon  25.24 
 
 		 278 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0269  transcriptional antiterminator, BglG  25.41 
 
 		 680 aa  43.5  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2796  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.17 
 
 		 696 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0916  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.09 
 
 		 636 aa  43.1  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.60605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>