28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2928 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2928  stationary phase inducible protein CsiE  100 
 
 		 425 aa  866    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2708  stationary phase inducible protein CsiE  99.53 
 
 		 425 aa  862    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2794  stationary phase inducible protein CsiE  98.59 
 
 		 425 aa  857    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2815  stationary phase inducible protein CsiE  99.29 
 
 		 425 aa  860    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2753  stationary phase inducible protein CsiE  99.76 
 
 		 425 aa  863    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1133  transcriptional antiterminator, BglG  71.76 
 
 		 426 aa  619  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02391  hypothetical protein  71.53 
 
 		 426 aa  618  1e-176  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.440596  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3768  stationary phase inducible protein CsiE  71.76 
 
 		 426 aa  619  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.738603  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02427  stationary phase inducible protein  71.53 
 
 		 426 aa  618  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.634141  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1142  stationary phase inducible protein CsiE  71.53 
 
 		 426 aa  618  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2821  stationary phase inducible protein CsiE  71.29 
 
 		 426 aa  615  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00197749  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2689  stationary phase inducible protein CsiE  71.53 
 
 		 426 aa  617  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2911  stationary phase inducible protein CsiE  70.93 
 
 		 431 aa  613  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0262062  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3033  stationary phase inducible protein CsiE  65.65 
 
 		 425 aa  567  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.129914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3633  stationary phase inducible protein CsiE  42.69 
 
 		 421 aa  315  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1270  stationary phase inducible protein CsiE  37.02 
 
 		 453 aa  289  6e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00156699  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1161  stationary phase inducible protein CsiE  37.02 
 
 		 453 aa  289  6e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018222  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0443  stationary phase inducible protein CsiE  36.99 
 
 		 448 aa  287  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000142576  hitchhiker  0.00000119159 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1407  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  21.45 
 
 		 709 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.126789  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2934  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  21.88 
 
 		 714 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  23.41 
 
 		 692 aa  56.6  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2984  PTS system, lactose/cellobiose specific IIB subunit  22.35 
 
 		 612 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00361591  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0391  PRD domain-containing protein  19.08 
 
 		 651 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0381  transcriptional antiterminator, BglG  19.08 
 
 		 651 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2011  transcriptional antiterminator, BglG  27.66 
 
 		 701 aa  47.4  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2664  BglG family transcriptional antiterminator  20.59 
 
 		 701 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0699  BigG family transcription antiterminator  23.17 
 
 		 646 aa  43.5  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2796  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  21.59 
 
 		 696 aa  43.5  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>