27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2689 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1133  transcriptional antiterminator, BglG  99.3 
 
 		 426 aa  870    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02391  hypothetical protein  99.06 
 
 		 426 aa  869    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.440596  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3768  stationary phase inducible protein CsiE  99.3 
 
 		 426 aa  870    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.738603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2928  stationary phase inducible protein CsiE  71.53 
 
 		 425 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2708  stationary phase inducible protein CsiE  71.76 
 
 		 425 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2794  stationary phase inducible protein CsiE  71.76 
 
 		 425 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2815  stationary phase inducible protein CsiE  71.76 
 
 		 425 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2821  stationary phase inducible protein CsiE  99.53 
 
 		 426 aa  872    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00197749  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2753  stationary phase inducible protein CsiE  71.76 
 
 		 425 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2911  stationary phase inducible protein CsiE  98.38 
 
 		 431 aa  837    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0262062  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02427  stationary phase inducible protein  99.06 
 
 		 426 aa  869    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.634141  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1142  stationary phase inducible protein CsiE  99.06 
 
 		 426 aa  869    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2689  stationary phase inducible protein CsiE  100 
 
 		 426 aa  875    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3033  stationary phase inducible protein CsiE  64.47 
 
 		 425 aa  563  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.129914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3633  stationary phase inducible protein CsiE  41.88 
 
 		 421 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1270  stationary phase inducible protein CsiE  37.47 
 
 		 453 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00156699  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1161  stationary phase inducible protein CsiE  37.47 
 
 		 453 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018222  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0443  stationary phase inducible protein CsiE  37.67 
 
 		 448 aa  300  4e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000142576  hitchhiker  0.00000119159 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1407  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.08 
 
 		 709 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.126789  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2934  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.19 
 
 		 714 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2984  PTS system, lactose/cellobiose specific IIB subunit  25.66 
 
 		 612 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00361591  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  21.64 
 
 		 692 aa  62.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2664  BglG family transcriptional antiterminator  25 
 
 		 701 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2011  transcriptional antiterminator, BglG  23.84 
 
 		 701 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0235  PRD domain-containing protein  21.45 
 
 		 698 aa  43.9  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0229  transcriptional antiterminator, BglG  21.45 
 
 		 698 aa  43.9  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3997  putative PTS regulatory protein  23.5 
 
 		 517 aa  43.5  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>