More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1826 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  100 
 
 
220 aa  434  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  75.23 
 
 
221 aa  336  2e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  3.38081e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  74.77 
 
 
221 aa  332  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  74.77 
 
 
221 aa  332  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  74.77 
 
 
221 aa  332  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  74.77 
 
 
221 aa  332  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  74.77 
 
 
221 aa  332  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  74.77 
 
 
221 aa  332  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  74.77 
 
 
221 aa  332  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  74.77 
 
 
221 aa  332  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  74.77 
 
 
221 aa  332  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  74.3 
 
 
221 aa  332  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  65.12 
 
 
220 aa  291  6e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  65.12 
 
 
220 aa  291  6e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  65.12 
 
 
219 aa  288  4e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  55.87 
 
 
215 aa  254  5e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  51.16 
 
 
220 aa  237  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.00527e-08  hitchhiker  1.67844e-14 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  55.61 
 
 
217 aa  234  7e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1854  potassium uptake protein  50.92 
 
 
221 aa  234  7e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0461191  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2142  putative potassium uptake protein  50.92 
 
 
221 aa  234  1e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.897368  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  52.61 
 
 
215 aa  231  5e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  2.26197e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  52.58 
 
 
227 aa  229  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  56.02 
 
 
221 aa  222  4e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  49.53 
 
 
217 aa  219  2e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.38787e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  48.61 
 
 
217 aa  213  2e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0416  TrkA domain-containing protein  44.86 
 
 
217 aa  200  1e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.30553e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  42.33 
 
 
221 aa  193  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  44.86 
 
 
232 aa  188  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  44.6 
 
 
233 aa  188  6e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3465  TrkA-N domain-containing protein  43.46 
 
 
231 aa  186  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3209  TrkA-N domain protein  45.07 
 
 
231 aa  185  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0122  TrkA-N domain protein  44.65 
 
 
217 aa  184  1e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00122863  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4804  TrkA-N  43.66 
 
 
231 aa  183  2e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  42.52 
 
 
222 aa  181  5e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1584  TrkA-N  44.39 
 
 
219 aa  182  5e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0458  potassium uptake protein KtrA  44.93 
 
 
220 aa  180  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  41.12 
 
 
222 aa  177  9e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2303  putative cation transporter  41.31 
 
 
222 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0249  TrkA-N domain protein  41.04 
 
 
219 aa  176  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  43.06 
 
 
233 aa  175  4e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01407  hypothetical protein  41.67 
 
 
220 aa  175  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36690  K+ transport system, NAD-binding component  39.53 
 
 
224 aa  175  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164115  normal  0.724398 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004055  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  42.36 
 
 
220 aa  174  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.248543  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0339  TrkA-N domain protein  42.79 
 
 
218 aa  174  8e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00738023  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2828  TrkA-N domain protein  44.6 
 
 
250 aa  171  7e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1557  TrkA domain-containing protein  41.1 
 
 
222 aa  171  8e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.176981  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0523  TrkA-N domain protein  40.74 
 
 
223 aa  171  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3557  TrkA-N domain protein  40.09 
 
 
223 aa  167  9e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.647516  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1585  TrkA-N domain protein  38.57 
 
 
216 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453253  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4052  TrkA-N domain protein  41.78 
 
 
229 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4091  TrkA-N domain protein  41.78 
 
 
229 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0232188  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2841  TrkA-N domain protein  40.28 
 
 
222 aa  164  1e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  0.066626 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0012  TrkA-N domain protein  43.66 
 
 
216 aa  163  2e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3574  TrkA domain-containing protein  40.1 
 
 
230 aa  162  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.458769 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0459  TrkA-N domain protein  39.13 
 
 
231 aa  160  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.821137  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0085  K+ transport systems, NAD-binding component  37.74 
 
 
218 aa  160  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.73294e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0952  TrkA-N domain protein  40.85 
 
 
217 aa  159  3e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1449  putative potassium channel, VIC family  39.55 
 
 
234 aa  158  7e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.286988  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01511  VIC family potassium channel protein  39.55 
 
 
234 aa  158  7e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1659  TrkA-N  37.44 
 
 
217 aa  157  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0583689  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7573  TrkA-N domain protein  36.67 
 
 
224 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00981  VIC family potassium channel protein  38.43 
 
 
234 aa  156  2e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2314  VIC family potassium channel protein  38.79 
 
 
234 aa  156  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.537657  normal  0.229836 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0088  VIC family potassium channel protein  38.43 
 
 
234 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00971  VIC family potassium channel protein  38.43 
 
 
234 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0321337  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0398  TrkA-N  37.2 
 
 
224 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81484  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00951  VIC family potassium channel protein  38.43 
 
 
234 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.304573  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02541  putative potassium channel, VIC family  38.79 
 
 
234 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1513  TrkA-N domain-containing protein  37.98 
 
 
224 aa  152  3e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4249  TrkA-N domain protein  37.62 
 
 
213 aa  151  6e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1392  TrkA-N domain protein  33.63 
 
 
227 aa  151  8e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643107  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1928  TrkA domain-containing protein  37.56 
 
 
223 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0214  TrkA-N  35.68 
 
 
224 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1711  TrkA-N domain protein  38.86 
 
 
220 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382687  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00941  VIC family potassium channel protein  37.5 
 
 
234 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0379  VIC family potassium channel protein  37.5 
 
 
234 aa  149  3e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1273  TrkA-N  37.74 
 
 
224 aa  149  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3347  TrkA domain-containing protein  36.67 
 
 
228 aa  149  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3145  TrkA-N domain protein  36.67 
 
 
228 aa  148  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.436065 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4247  TrkA-N domain protein  35.98 
 
 
225 aa  145  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.61262 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18040  K+ transport system, NAD-binding component  36.67 
 
 
225 aa  146  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0139  TrkA-N domain protein  36.79 
 
 
218 aa  146  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1353  TrkA-N domain protein  38.46 
 
 
217 aa  145  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14840  K+ transport system, NAD-binding component  32.55 
 
 
229 aa  144  9e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.289305  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0428  TrkA-N domain protein  35.71 
 
 
225 aa  143  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0372  TrkA domain-containing protein  36.23 
 
 
222 aa  142  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.849541  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24350  K+ transport system, NAD-binding component  34.76 
 
 
221 aa  142  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6144  TrkA-N  35.41 
 
 
220 aa  141  1e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674267  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0443  TrkA domain-containing protein  36.23 
 
 
222 aa  140  1e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103493 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0627  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 
224 aa  135  3e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4040  TrkA-N domain protein  35.65 
 
 
221 aa  134  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2069  TrkA-N domain protein  36.89 
 
 
228 aa  134  9e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1631  Trk family potassium uptake protein , putative  32.27 
 
 
223 aa  133  2e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1463  TrkA-N domain protein  34.43 
 
 
220 aa  133  2e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00504118  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0750  TrkA domain-containing protein  45.81 
 
 
217 aa  133  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.803573  normal  0.253071 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0566  potassium uptake protein TrkA, putative  35.16 
 
 
218 aa  132  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0519  TrkA-N domain protein  35.48 
 
 
225 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.416454  normal  0.506126 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1541  TrkA-N domain protein  34.88 
 
 
221 aa  132  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1834  TrkA-N  34.08 
 
 
233 aa  132  6e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.423842  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2522  TrkA domain-containing protein  35.02 
 
 
221 aa  130  1e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000136868  normal  0.0316786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>