More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3042 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  100 
 
 
298 aa  604  1e-172  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0439  flagellin-like  65.99 
 
 
294 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4098  flagellar hook-associated protein 3  66.33 
 
 
298 aa  378  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3754  flagellar hook-associated protein 3  37.91 
 
 
306 aa  215  7e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3838  flagellar hook-associated protein 3  38.89 
 
 
306 aa  213  2e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0146959 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3274  flagellar hook-associated protein 3  35.33 
 
 
299 aa  194  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3456  flagellar hook-associated protein 3  35.67 
 
 
295 aa  182  4e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  34.33 
 
 
297 aa  179  3e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  34.29 
 
 
302 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  35.12 
 
 
292 aa  171  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  31.31 
 
 
315 aa  167  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  32.69 
 
 
297 aa  164  2e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  31.17 
 
 
309 aa  162  4e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  30.39 
 
 
305 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  32.01 
 
 
301 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0831  flagellar hook-associated protein 3  32.45 
 
 
298 aa  150  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.995497 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17130  flagellar hook-associated protein 3  29.55 
 
 
301 aa  147  2e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0249  flagellar hook-associated protein FlgL  30.13 
 
 
296 aa  144  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0392  flagellar hook-associated protein 3  30.69 
 
 
298 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31340  flagellar hook-associated protein 3  31.46 
 
 
303 aa  138  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0213605 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  26.3 
 
 
328 aa  137  3e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2042  flagellar hook-associated protein 3  31.6 
 
 
305 aa  135  7e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.75647 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3001  flagellar hook-associated protein 3  30.67 
 
 
294 aa  129  7e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00024747 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0990  flagellar hook-associated protein 3  29.28 
 
 
298 aa  128  1e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4194  flagellar hook-associated protein 3  30.79 
 
 
327 aa  125  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2240  flagellar hook-associated protein 3  28.33 
 
 
310 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1148  flagellar hook-filament junction protein  31 
 
 
296 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1352  flagellar hook-associated protein FlgL  28.96 
 
 
287 aa  122  8e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0021  flagellar hook-associated protein 3  28.57 
 
 
301 aa  122  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  27.92 
 
 
302 aa  119  4e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1759  flagellar hook-associated protein FlgL  28.28 
 
 
287 aa  119  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1815  flagellar hook-associated protein FlgL  28.28 
 
 
287 aa  118  1e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1516  flagellar hook-associated protein FlgL  27.27 
 
 
287 aa  117  2e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1621  flagellar hook-associated protein 3  28.43 
 
 
302 aa  117  2e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1737  flagellar hook-associated protein FlgL  27.27 
 
 
287 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1556  flagellar hook-associated protein FlgL  27.95 
 
 
287 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416222  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0329  flagellar hook-associated protein 3  27.87 
 
 
295 aa  115  7e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  28.53 
 
 
311 aa  115  9e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1705  flagellar hook-associated protein FlgL  27.61 
 
 
287 aa  115  1e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0770  flagellar hook-associated protein 3  30 
 
 
305 aa  114  1e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  30.07 
 
 
317 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  30.07 
 
 
317 aa  112  8e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  30.07 
 
 
317 aa  112  8e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  29.72 
 
 
317 aa  111  1e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  30.07 
 
 
317 aa  111  1e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  4.76574e-07 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  29.37 
 
 
317 aa  110  2e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2358  flagellar hook-associated protein 3  28.19 
 
 
292 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  29.02 
 
 
317 aa  109  4e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  29.37 
 
 
317 aa  109  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0390  flagellar hook-associated protein 3  27.87 
 
 
294 aa  109  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2931  flagellin-like  30.39 
 
 
295 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.763262  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1527  flagellar hook-associated protein FlgL  25.93 
 
 
287 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00165478  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3641  flagellar hook-associated protein FlgL  26.6 
 
 
287 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  27.27 
 
 
317 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  25.82 
 
 
300 aa  105  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1650  flagellar hook-associated protein 3  24.5 
 
 
297 aa  103  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  27.81 
 
 
299 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0865  flagellar hook-associated protein 3  23.4 
 
 
304 aa  103  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  26.99 
 
 
317 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  4.79805e-05 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  26.99 
 
 
317 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  26.99 
 
 
317 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  1.01663e-05 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  26.99 
 
 
317 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  26.99 
 
 
317 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000730  flagellar hook-associated protein FlgL  28.29 
 
 
299 aa  102  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0842  flagellar hook-associated protein 3  23.4 
 
 
304 aa  101  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  31.84 
 
 
420 aa  95.9  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  32.82 
 
 
410 aa  95.5  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2610  flagellar hook-associated protein 3  30.3 
 
 
294 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00831645  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0671  flagellar hook-associated protein 3  25.24 
 
 
305 aa  93.6  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0367286 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2514  flagellar hook-associated protein 3  30.3 
 
 
294 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0170039  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3151  flagellar hook-associated protein FlgL, putative  35.17 
 
 
504 aa  92.4  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1343  flagellar hook-associated protein FlgL  30.3 
 
 
294 aa  92.4  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0130628  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2402  flagellar hook-associated protein 3  34.69 
 
 
594 aa  91.3  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2435  flagellar hook-associated protein 3  31.03 
 
 
438 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2525  flagellar hook-associated protein 3  30.41 
 
 
507 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1766  flagellar hook-associated protein 3  25.64 
 
 
313 aa  88.6  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  26.44 
 
 
326 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  30.73 
 
 
408 aa  87.8  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  26.44 
 
 
326 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0307  flagellar hook-associated protein 3  33.57 
 
 
514 aa  87.8  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  25.72 
 
 
305 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  25.66 
 
 
305 aa  85.9  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1779  flagellin  27.84 
 
 
266 aa  85.1  1e-15  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  25.24 
 
 
305 aa  84.7  2e-15  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3458  flagellar hook-associated protein 3  26.13 
 
 
305 aa  84.3  2e-15  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2562  flagellin domain protein  22.77 
 
 
325 aa  84.3  2e-15  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2588  flagellar hook-associated protein FlgL  23.68 
 
 
317 aa  84.3  2e-15  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  25.16 
 
 
304 aa  84.3  2e-15  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  24.07 
 
 
326 aa  84.3  2e-15  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1834  flagellin  28.23 
 
 
266 aa  83.6  4e-15  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.81567e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1535  flagellar hook-associated protein 3  25.17 
 
 
312 aa  82.8  6e-15  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1725  A-type flagellin  27.21 
 
 
266 aa  82.8  6e-15  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00229604  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2421  flagellar hook-associated protein 3  31.03 
 
 
523 aa  82.4  9e-15  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.303682 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1756  A-type flagellin  27.84 
 
 
264 aa  82.4  9e-15  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  26.12 
 
 
319 aa  81.6  1e-14  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  29.32 
 
 
439 aa  82  1e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0352  flagellar hook-associated protein 3  25.08 
 
 
316 aa  81.6  2e-14  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0560824 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3641  flagellin-like protein  26.77 
 
 
305 aa  81.3  2e-14  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1552  flagellar hook-associated protein  28.09 
 
 
207 aa  80.9  2e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1878  flagellar hook-associated protein FlgL  25 
 
 
318 aa  81.3  2e-14  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>