More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1827 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 531 aa  1100    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  78.65 
 
 		 534 aa  877    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1490  L-aspartate oxidase  61.76 
 
 		 541 aa  676    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000326406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2336  L-aspartate oxidase  78.42 
 
 		 533 aa  880    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  70.11 
 
 		 532 aa  788    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  90.4 
 
 		 531 aa  1006    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1874  L-aspartate oxidase  78.42 
 
 		 533 aa  882    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1736  L-aspartate oxidase  78.34 
 
 		 531 aa  882    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  85.12 
 
 		 531 aa  955    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  59.81 
 
 		 535 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  59.81 
 
 		 535 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  59.81 
 
 		 535 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3159  L-aspartate oxidase  59.92 
 
 		 534 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  57.01 
 
 		 534 aa  620  1e-176  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  57.67 
 
 		 579 aa  619  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  58.16 
 
 		 542 aa  616  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  59.81 
 
 		 535 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4514  L-aspartate oxidase  60.89 
 
 		 527 aa  617  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  56.17 
 
 		 531 aa  606  9.999999999999999e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  56.48 
 
 		 555 aa  607  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  57.72 
 
 		 532 aa  605  9.999999999999999e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  57.76 
 
 		 523 aa  602  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  56.81 
 
 		 534 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  56.9 
 
 		 534 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  55.71 
 
 		 539 aa  598  1e-170  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  56.57 
 
 		 535 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  57.06 
 
 		 537 aa  595  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1472  L-aspartate oxidase  55.74 
 
 		 533 aa  595  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  55.96 
 
 		 538 aa  598  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  56.7 
 
 		 534 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  56.53 
 
 		 538 aa  595  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  56.53 
 
 		 538 aa  595  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  58.85 
 
 		 533 aa  595  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54450  L-aspartate oxidase  55.83 
 
 		 538 aa  596  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883474  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  56.27 
 
 		 537 aa  594  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  55.75 
 
 		 538 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  57.06 
 
 		 537 aa  594  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  57.06 
 
 		 537 aa  594  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3959  L-aspartate oxidase  55.75 
 
 		 538 aa  593  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0145012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  56.67 
 
 		 525 aa  592  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  57.06 
 
 		 537 aa  594  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  56.87 
 
 		 537 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13650  L-aspartate oxidase  54.98 
 
 		 538 aa  592  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  55.77 
 
 		 531 aa  592  1e-168  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  56.27 
 
 		 537 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  56.46 
 
 		 537 aa  594  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  55.58 
 
 		 542 aa  591  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  55.15 
 
 		 532 aa  588  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1360  L-aspartate oxidase  54.88 
 
 		 538 aa  590  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  55.13 
 
 		 536 aa  588  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  57.56 
 
 		 541 aa  588  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  58.06 
 
 		 535 aa  589  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  55.7 
 
 		 536 aa  591  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  56.11 
 
 		 538 aa  590  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  55.89 
 
 		 537 aa  589  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  54.96 
 
 		 536 aa  587  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1466  L-aspartate oxidase  55.45 
 
 		 543 aa  586  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  53.88 
 
 		 533 aa  585  1e-166  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  54.14 
 
 		 550 aa  585  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2467  L-aspartate oxidase  54.02 
 
 		 539 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.997427  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  55.45 
 
 		 537 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  56.05 
 
 		 537 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  55.01 
 
 		 531 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  56.14 
 
 		 529 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  57.31 
 
 		 533 aa  578  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  54.37 
 
 		 537 aa  580  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  57.09 
 
 		 528 aa  579  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  57.12 
 
 		 533 aa  579  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  57.31 
 
 		 533 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  55.26 
 
 		 534 aa  578  1e-164  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  54.25 
 
 		 539 aa  578  1e-164  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  54.98 
 
 		 535 aa  581  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  53.32 
 
 		 531 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  54.14 
 
 		 543 aa  577  1.0000000000000001e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2816  L-aspartate oxidase  56.14 
 
 		 529 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0796143  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2728  L-aspartate oxidase  54.37 
 
 		 540 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.100043  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2233  L-aspartate oxidase  54.93 
 
 		 535 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0976  L-aspartate oxidase  54.93 
 
 		 570 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1024  L-aspartate oxidase  54.93 
 
 		 570 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105043  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2532  L-aspartate oxidase  53.86 
 
 		 538 aa  572  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1061  L-aspartate oxidase  54.05 
 
 		 534 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0980  L-aspartate oxidase  54.93 
 
 		 570 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  54.01 
 
 		 531 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2103  L-aspartate oxidase  54.93 
 
 		 570 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2649  L-aspartate oxidase  54.93 
 
 		 570 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02468  L-aspartate oxidase  54.37 
 
 		 540 aa  569  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1094  L-aspartate oxidase  54.37 
 
 		 540 aa  571  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.527185  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  54.17 
 
 		 540 aa  570  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2730  L-aspartate oxidase  54.37 
 
 		 540 aa  570  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.624821  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2096  L-aspartate oxidase  55.56 
 
 		 541 aa  568  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1134  L-aspartate oxidase  55.27 
 
 		 533 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  53.67 
 
 		 531 aa  570  1e-161  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1097  L-aspartate oxidase  53.88 
 
 		 531 aa  571  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.565133  normal  0.0527143 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0778  L-aspartate oxidase  55.27 
 
 		 533 aa  570  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1103  L-aspartate oxidase  54.28 
 
 		 540 aa  568  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02432  hypothetical protein  54.37 
 
 		 540 aa  569  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.874408  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002490  L-aspartate oxidase  54.23 
 
 		 561 aa  568  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79354  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03543  L-aspartate oxidase  53.46 
 
 		 559 aa  565  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1080  L-aspartate oxidase  55.58 
 
 		 528 aa  565  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  55.27 
 
 		 532 aa  565  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.871756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>