More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0294 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  100 
 
 		 303 aa  623  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  80.27 
 
 		 297 aa  503  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  60.41 
 
 		 300 aa  401  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  60.96 
 
 		 299 aa  386  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  60.62 
 
 		 299 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  57.93 
 
 		 297 aa  360  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  56.8 
 
 		 298 aa  347  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  37.8 
 
 		 298 aa  215  7e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  34.01 
 
 		 304 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  41.7 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  33.94 
 
 		 280 aa  151  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  33.71 
 
 		 280 aa  150  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  35.45 
 
 		 283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  35.91 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  34.39 
 
 		 282 aa  143  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  33.92 
 
 		 282 aa  142  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  29.96 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  33.18 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  30.08 
 
 		 284 aa  138  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  29.08 
 
 		 284 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  31.74 
 
 		 274 aa  136  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  30.6 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  29.46 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  28.74 
 
 		 283 aa  132  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  28.09 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  31.56 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  29.75 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  33.63 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  29.28 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  29.02 
 
 		 286 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  27.48 
 
 		 280 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  28.84 
 
 		 284 aa  122  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  26.84 
 
 		 290 aa  122  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  32.41 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  28.83 
 
 		 427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  26.19 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  29.91 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  25.6 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  31.82 
 
 		 369 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  26.14 
 
 		 291 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  26.4 
 
 		 351 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  25.73 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  30.49 
 
 		 282 aa  116  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  30.84 
 
 		 302 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  27.63 
 
 		 407 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  29.03 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  30.8 
 
 		 287 aa  114  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  25 
 
 		 305 aa  113  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  27.17 
 
 		 718 aa  112  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  27.69 
 
 		 290 aa  112  7.000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  28.38 
 
 		 912 aa  110  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  24.45 
 
 		 505 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  31.22 
 
 		 358 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  27.75 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  27.93 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  24.25 
 
 		 455 aa  106  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2112  metal dependent phosphohydrolase  29.28 
 
 		 282 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  28.09 
 
 		 287 aa  106  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  26.18 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  28.99 
 
 		 352 aa  105  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  29 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  26.9 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  28.52 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  25.82 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  28 
 
 		 397 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  27.5 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  29.67 
 
 		 340 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  29.57 
 
 		 288 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  28.44 
 
 		 275 aa  102  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  29.57 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  29.35 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  27.52 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  26.05 
 
 		 412 aa  101  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  29.57 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  30.16 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  28.63 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1038  metal dependent phosphohydrolase  30.29 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.227118  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  29.6 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  26.45 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  27.85 
 
 		 716 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  28.87 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  27.95 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  23.87 
 
 		 408 aa  99.4  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2028  putative signal transduction protein  27.93 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  28.05 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  26.55 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3139  histidine kinase  30.64 
 
 		 724 aa  99  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  25.52 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  26.43 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  25.93 
 
 		 430 aa  97.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3269  putative signal transduction protein  28.15 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  26.46 
 
 		 281 aa  97.4  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  26.24 
 
 		 274 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  25.34 
 
 		 282 aa  96.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0348  putative signal transduction protein  26.69 
 
 		 285 aa  97.1  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208885 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  26.24 
 
 		 274 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  26.24 
 
 		 274 aa  97.1  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  26.24 
 
 		 274 aa  97.1  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  26.24 
 
 		 274 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  26.24 
 
 		 274 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>