More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3465 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  38.84 
 
 		 840 aa  639    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  39.48 
 
 		 842 aa  645    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  73.53 
 
 		 836 aa  1323    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  100 
 
 		 836 aa  1718    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  70.5 
 
 		 835 aa  1259    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  41.04 
 
 		 830 aa  666    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  39.36 
 
 		 841 aa  644    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  39.16 
 
 		 842 aa  638    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  55.86 
 
 		 842 aa  996    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  73.65 
 
 		 836 aa  1308    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  98.21 
 
 		 836 aa  1693    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  39.28 
 
 		 843 aa  651    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  42.02 
 
 		 828 aa  683    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  69.78 
 
 		 835 aa  1240    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  41.4 
 
 		 835 aa  643    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  81.53 
 
 		 835 aa  1436    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  39.16 
 
 		 842 aa  642    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  39.04 
 
 		 827 aa  631  1e-179  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  39.25 
 
 		 832 aa  619  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  39.98 
 
 		 832 aa  615  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  38.06 
 
 		 827 aa  611  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  36.75 
 
 		 832 aa  589  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  37.4 
 
 		 818 aa  580  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  36.68 
 
 		 833 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  36.96 
 
 		 834 aa  572  1e-161  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  36.05 
 
 		 841 aa  569  1e-161  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  36.13 
 
 		 816 aa  570  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  35.9 
 
 		 828 aa  565  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  35.81 
 
 		 828 aa  565  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  36.94 
 
 		 843 aa  564  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  36.82 
 
 		 828 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  36.7 
 
 		 830 aa  559  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  35.41 
 
 		 820 aa  550  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  33.29 
 
 		 810 aa  548  1e-154  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  35.27 
 
 		 820 aa  544  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  34.09 
 
 		 837 aa  544  1e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  35.48 
 
 		 818 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  35.2 
 
 		 833 aa  521  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  34.34 
 
 		 821 aa  484  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  31.33 
 
 		 776 aa  430  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  28.2 
 
 		 854 aa  423  1e-117  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  29.1 
 
 		 784 aa  393  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  28.38 
 
 		 785 aa  383  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  29.22 
 
 		 784 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  28.86 
 
 		 784 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  29.03 
 
 		 784 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  29.03 
 
 		 784 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  29.22 
 
 		 784 aa  373  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  33.5 
 
 		 784 aa  369  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  33.61 
 
 		 784 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  33.16 
 
 		 784 aa  365  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  32.63 
 
 		 712 aa  363  7.0000000000000005e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  28.38 
 
 		 784 aa  362  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  37.29 
 
 		 370 aa  280  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  37.29 
 
 		 370 aa  279  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  36.46 
 
 		 370 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  37.8 
 
 		 392 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  37.27 
 
 		 399 aa  266  8.999999999999999e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  40.52 
 
 		 343 aa  266  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  37.14 
 
 		 361 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  35.33 
 
 		 361 aa  254  5.000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  37.14 
 
 		 361 aa  253  7e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  37.53 
 
 		 392 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  37.88 
 
 		 348 aa  245  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  37.15 
 
 		 347 aa  238  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  35.57 
 
 		 387 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  35.47 
 
 		 347 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  35.78 
 
 		 349 aa  231  6e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  36.44 
 
 		 346 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  36.13 
 
 		 392 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  33.6 
 
 		 387 aa  221  5e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  31.9 
 
 		 367 aa  219  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  36.08 
 
 		 392 aa  218  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1518  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.9 
 
 		 392 aa  218  4e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02241  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.9 
 
 		 392 aa  218  4e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4603  Nucleotidyl transferase  36.76 
 
 		 329 aa  218  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.726116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01711  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.51 
 
 		 392 aa  216  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.602072  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01691  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.8 
 
 		 392 aa  215  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2404  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.43 
 
 		 392 aa  214  3.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.271478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01801  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.51 
 
 		 392 aa  214  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  32.09 
 
 		 366 aa  214  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  33.88 
 
 		 387 aa  214  5.999999999999999e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0289  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  36 
 
 		 392 aa  212  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  33.91 
 
 		 389 aa  209  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  33.52 
 
 		 381 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01681  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  34.09 
 
 		 392 aa  206  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26731  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  34.47 
 
 		 392 aa  204  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1143  nucleotidyl transferase  33.91 
 
 		 388 aa  199  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149781 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1847  nucleotidyl transferase  32.66 
 
 		 389 aa  196  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.315582  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  30.46 
 
 		 359 aa  196  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0300  nucleotidyl transferase  32.29 
 
 		 397 aa  194  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3422  nucleotidyl transferase  32.09 
 
 		 389 aa  194  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1511  Nucleotidyl transferase  31.16 
 
 		 388 aa  193  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125436 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0952  Nucleotidyl transferase  31.16 
 
 		 388 aa  191  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0925  Nucleotidyl transferase  31.16 
 
 		 388 aa  191  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  30.29 
 
 		 452 aa  191  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0327  putative nucleotidyl transferase  30.66 
 
 		 381 aa  189  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  31.22 
 
 		 370 aa  187  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  27.64 
 
 		 450 aa  187  5e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  30.54 
 
 		 359 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>