More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3046 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  94.42 
 
 
806 aa  1513    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
806 aa  1623    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1177  copper-translocating P-type ATPase  45.94 
 
 
807 aa  615  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  42.66 
 
 
807 aa  610  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1237  heavy metal translocating P-type ATPase  45.44 
 
 
807 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1813  heavy metal translocating P-type ATPase  43.19 
 
 
809 aa  597  1e-169  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1339  heavy metal translocating P-type ATPase  45.07 
 
 
807 aa  594  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527377  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  39.9 
 
 
808 aa  571  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  40.99 
 
 
818 aa  563  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  39.43 
 
 
814 aa  558  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  42.6 
 
 
793 aa  503  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  40.79 
 
 
794 aa  501  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  34.72 
 
 
807 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  40.87 
 
 
814 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  35.48 
 
 
799 aa  486  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  35.8 
 
 
795 aa  488  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  34.03 
 
 
793 aa  484  1e-135  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  32.48 
 
 
817 aa  483  1e-135  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1819  heavy metal translocating P-type ATPase  33.83 
 
 
806 aa  484  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543484  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  36.8 
 
 
743 aa  481  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  37.45 
 
 
798 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
797 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  34.62 
 
 
803 aa  481  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  34.9 
 
 
803 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  35.28 
 
 
799 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1420  copper-translocating P-type ATPase  33.92 
 
 
789 aa  478  1e-133  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  37.86 
 
 
752 aa  479  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  35.28 
 
 
799 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  38.59 
 
 
803 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  34.28 
 
 
803 aa  479  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  33.66 
 
 
828 aa  476  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  38.61 
 
 
837 aa  473  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  35.4 
 
 
799 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  35.18 
 
 
794 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  35.72 
 
 
815 aa  472  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  33.99 
 
 
805 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  37.36 
 
 
817 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  34.28 
 
 
799 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  33.78 
 
 
813 aa  469  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  38.48 
 
 
799 aa  467  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  35.35 
 
 
799 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  36.41 
 
 
796 aa  463  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  35.44 
 
 
818 aa  463  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  34.73 
 
 
794 aa  464  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  35.28 
 
 
799 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  35.9 
 
 
753 aa  462  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  34.87 
 
 
790 aa  462  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  36.49 
 
 
750 aa  462  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  38.05 
 
 
821 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  33.66 
 
 
797 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  39.97 
 
 
817 aa  458  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  37.55 
 
 
839 aa  458  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  35.2 
 
 
837 aa  458  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  45.68 
 
 
824 aa  457  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000374704  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  35.48 
 
 
759 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  35.14 
 
 
889 aa  458  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  35.48 
 
 
759 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2452  copper-translocating P-type ATPase  39.27 
 
 
797 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.7313  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  36.84 
 
 
759 aa  455  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0385  copper-transporter ATPase CopA  35.59 
 
 
744 aa  455  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  36.34 
 
 
806 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  36.7 
 
 
839 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  35.58 
 
 
812 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  36.95 
 
 
831 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  33.94 
 
 
802 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  34.84 
 
 
797 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  35.14 
 
 
889 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  36.2 
 
 
806 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  39.38 
 
 
748 aa  449  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.972303  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  37.85 
 
 
757 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.66102  normal  0.575194 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  39.7 
 
 
790 aa  450  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  39.81 
 
 
800 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1259  heavy metal translocating P-type ATPase  38.84 
 
 
834 aa  450  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499676  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  34.42 
 
 
802 aa  452  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  39.94 
 
 
804 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  34.42 
 
 
802 aa  452  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  34.28 
 
 
792 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  34.43 
 
 
815 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2772  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  38.35 
 
 
798 aa  449  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 
813 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  39.31 
 
 
840 aa  447  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0418  heavy metal translocating P-type ATPase  37.98 
 
 
816 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  39.64 
 
 
799 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  36.47 
 
 
838 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  36.42 
 
 
786 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  36.65 
 
 
846 aa  449  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  38.6 
 
 
836 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  39.53 
 
 
799 aa  446  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0267  copper-translocating P-type ATPase  33.21 
 
 
797 aa  445  1e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.594062  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  33.74 
 
 
805 aa  444  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  33.74 
 
 
805 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  37.93 
 
 
798 aa  443  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  35.66 
 
 
805 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  39.95 
 
 
816 aa  444  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  33.87 
 
 
806 aa  442  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  35.17 
 
 
758 aa  444  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  35.86 
 
 
798 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  33.62 
 
 
805 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  33.62 
 
 
805 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  35.86 
 
 
798 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>