More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0849 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  92.24 
 
 
338 aa  635  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
336 aa  685  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  71.99 
 
 
339 aa  494  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  66.57 
 
 
330 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0767  glycosyl transferase family 2  41.06 
 
 
340 aa  253  2e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0444656  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0212  glycosyl transferase family 2  45.21 
 
 
334 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0210  glycosyl transferase family protein  45.81 
 
 
334 aa  245  7e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.640164  normal  0.0425626 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0201  glycosyl transferase family 2  44.91 
 
 
334 aa  245  8e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0190  glycosyl transferase family protein  45.81 
 
 
334 aa  245  1e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  43.7 
 
 
344 aa  243  4e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4485  glycosyl transferase family 2  42.17 
 
 
336 aa  238  8e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0112223  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3612  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.13 
 
 
349 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2831  glycosyl transferase family protein  42.6 
 
 
345 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.242472  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2620  glycosyl transferase family 2  42.34 
 
 
337 aa  227  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1763  glycosyl transferase family 2  40.18 
 
 
333 aa  226  5e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0266  glycosyl transferase family protein  41 
 
 
341 aa  220  2e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2182  glycosyl transferase family 2  38.8 
 
 
356 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  43.84 
 
 
347 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  43.84 
 
 
353 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  37.67 
 
 
352 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  41.01 
 
 
361 aa  141  2e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.43 
 
 
367 aa  134  1e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  34.7 
 
 
365 aa  131  1e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  37.26 
 
 
1250 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  38.07 
 
 
327 aa  129  8e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.7 
 
 
341 aa  129  9e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  35.78 
 
 
338 aa  128  1e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  39.25 
 
 
305 aa  127  4e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  36.49 
 
 
373 aa  126  4e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  39.7 
 
 
363 aa  126  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 
334 aa  125  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  32.72 
 
 
332 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3267  glycosyl transferase family protein  35.93 
 
 
364 aa  122  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0803351  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  37.62 
 
 
306 aa  122  1e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  33.65 
 
 
321 aa  118  2e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
280 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 
321 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  34.19 
 
 
336 aa  117  4e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  33.03 
 
 
351 aa  115  1e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 
308 aa  115  1e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
336 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.85438e-20 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  35.21 
 
 
322 aa  112  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  35.4 
 
 
347 aa  113  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 
280 aa  111  2e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.95 
 
 
377 aa  109  7e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  37.22 
 
 
364 aa  109  8e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
277 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  5.84386e-06 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  36.23 
 
 
323 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  35.07 
 
 
663 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
330 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  1.20628e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
341 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  33.33 
 
 
340 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
294 aa  104  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6398  glycosyl transferase family 2  35.07 
 
 
262 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.855353 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 
274 aa  103  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  35.2 
 
 
334 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  33.85 
 
 
367 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  37.63 
 
 
384 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0695  glycosyl transferase family 2  33.65 
 
 
270 aa  100  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  34.39 
 
 
342 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
376 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.47 
 
 
312 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2728  glycosyl transferase family protein  34.98 
 
 
286 aa  99.8  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
398 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
321 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  36.02 
 
 
276 aa  98.2  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  34.56 
 
 
321 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  32.44 
 
 
320 aa  97.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0628  glycosyl transferase family 2  34.31 
 
 
280 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2704  glycosyl transferase family 2  34.4 
 
 
278 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00294002 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.44 
 
 
294 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 
1035 aa  96.7  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
316 aa  96.3  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 
333 aa  95.9  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  31 
 
 
294 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5383  glycosyl transferase family 2  34.27 
 
 
304 aa  95.9  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0309  glycosyltransferase  36.32 
 
 
318 aa  95.1  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 
373 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2943  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 
332 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1923  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 
273 aa  94.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0969327 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  28.89 
 
 
272 aa  94.4  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 
299 aa  94  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2415  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
279 aa  92.8  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.5495e-05  normal  0.849916 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1917  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 
317 aa  92.8  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.795527 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
310 aa  92.4  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  29.38 
 
 
244 aa  92  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 
327 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  30.63 
 
 
341 aa  91.3  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  32.29 
 
 
1032 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
318 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 
1739 aa  90.9  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  25.35 
 
 
300 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
311 aa  90.1  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  25.61 
 
 
299 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  9.37683e-12 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0404  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 
283 aa  90.1  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.032023  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  33.03 
 
 
300 aa  89.7  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08760  glycosyl transferase  33.94 
 
 
296 aa  89.7  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0855056  normal  0.752756 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 
338 aa  89.4  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.62 
 
 
466 aa  89.4  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 
303 aa  89.4  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>