55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5610 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5610  methyltransferase type 12  100 
 
 		 613 aa  1210    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194335  hitchhiker  0.000698076 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0931  hypothetical protein  60.67 
 
 		 620 aa  668    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5277  methyltransferase type 12  44.09 
 
 		 625 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1217  Methyltransferase type 12  38.56 
 
 		 607 aa  330  4e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.861271  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1188  methyltransferase type 12  46.43 
 
 		 303 aa  236  8e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.222476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3474  Methyltransferase type 12  40.47 
 
 		 371 aa  218  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1190  hypothetical protein  40.46 
 
 		 330 aa  139  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  22.92 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  25.51 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  28.46 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1484  glycosyl transferase WecB/TagA/CpsF  28.57 
 
 		 574 aa  68.2  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000853936  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  31.78 
 
 		 303 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  25.62 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  23.4 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  30.16 
 
 		 314 aa  63.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  26.52 
 
 		 309 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  25.65 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  29.76 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  33.33 
 
 		 305 aa  57  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2291  Methyltransferase type 11  30.15 
 
 		 251 aa  56.2  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  22.56 
 
 		 286 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  26.83 
 
 		 273 aa  55.1  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  26.9 
 
 		 214 aa  54.7  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  24.73 
 
 		 353 aa  54.3  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  24.73 
 
 		 353 aa  54.3  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 323 aa  53.9  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  27.33 
 
 		 285 aa  53.9  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 323 aa  53.9  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  22.59 
 
 		 303 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  35.37 
 
 		 311 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  28.63 
 
 		 342 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  34.07 
 
 		 310 aa  52.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  20.5 
 
 		 267 aa  52  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  25.9 
 
 		 310 aa  52.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  24 
 
 		 287 aa  51.6  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  28.87 
 
 		 298 aa  51.6  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 1094 aa  50.8  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1277  Methyltransferase type 11  20.74 
 
 		 572 aa  47.8  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  26.9 
 
 		 312 aa  47.4  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31991  3,4-dihydroxy-5-hexaprenylbenzoate methyltransferase  33.59 
 
 		 280 aa  47.4  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.751734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  25.59 
 
 		 330 aa  46.2  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  31.55 
 
 		 380 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 1085 aa  45.4  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  25.45 
 
 		 303 aa  45.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 1037 aa  44.7  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  26.85 
 
 		 383 aa  44.7  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  30.41 
 
 		 369 aa  44.7  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 360 aa  44.3  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 355 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 355 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 355 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0955  methyltransferase type 12  36.62 
 
 		 313 aa  43.9  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.978097  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1243  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.89 
 
 		 329 aa  43.9  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5773  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 303 aa  43.5  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  26.53 
 
 		 310 aa  43.9  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>