79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5208 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5208  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  616  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00169383  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1247  hypothetical protein  73.63 
 
 
312 aa  466  1e-130  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0984474 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1737  hypothetical protein  64.24 
 
 
306 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226503  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1722  hypothetical protein  63.25 
 
 
306 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.000637714 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5325  protein of unknown function DUF75  51.18 
 
 
298 aa  289  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0926  hypothetical protein  50.17 
 
 
313 aa  285  5e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2427  protein of unknown function DUF75  51.16 
 
 
315 aa  285  6e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2446  hypothetical protein  51.07 
 
 
329 aa  285  7e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.211453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3951  hypothetical protein  50 
 
 
330 aa  282  5e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1658  protein of unknown function DUF75  50.17 
 
 
304 aa  281  7e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6868  hypothetical protein  49.17 
 
 
302 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0028  hypothetical protein  47.4 
 
 
310 aa  280  3e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4966  protein of unknown function DUF75  48.01 
 
 
304 aa  278  7e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14850  ATP-grasp superfamily enzyme  47.65 
 
 
307 aa  276  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2219  hypothetical protein  47.86 
 
 
334 aa  274  2e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.849197  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3749  hypothetical protein  46.93 
 
 
301 aa  273  2e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0709366  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2173  hypothetical protein  47.86 
 
 
334 aa  274  2e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2162  hypothetical protein  47.86 
 
 
334 aa  274  2e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530975  hitchhiker  0.00210211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2326  hypothetical protein  46.05 
 
 
301 aa  273  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.402322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1579  protein of unknown function DUF75  48.73 
 
 
314 aa  265  9e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5648  protein of unknown function DUF75  46.73 
 
 
307 aa  264  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.424673 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1509  protein of unknown function DUF75  48.53 
 
 
311 aa  262  4e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0466221  normal  0.187119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12728  hypothetical protein  50.53 
 
 
324 aa  262  6e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22940  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  45.34 
 
 
312 aa  261  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.15902 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2852  hypothetical protein  46.8 
 
 
311 aa  261  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2232  protein of unknown function DUF75  46.51 
 
 
342 aa  249  6e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0798  protein of unknown function DUF75  44.26 
 
 
319 aa  244  1e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2127  protein of unknown function DUF75  51.24 
 
 
316 aa  243  2e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1266  protein of unknown function DUF75  46.29 
 
 
312 aa  240  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.825703  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1825  protein of unknown function DUF75  44.98 
 
 
311 aa  236  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1614  hypothetical protein  41.53 
 
 
312 aa  224  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125325  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1608  protein of unknown function DUF75  40.66 
 
 
312 aa  217  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.05047e-11 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1060  protein of unknown function DUF75  40.2 
 
 
310 aa  216  3e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419014  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10660  Protein of unknown function DUF75  40.69 
 
 
325 aa  207  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.120435  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16730  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  36.91 
 
 
348 aa  194  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13300  Protein of unknown function DUF75  34.74 
 
 
318 aa  180  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00661171  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15610  Protein of unknown function DUF75  30.34 
 
 
353 aa  138  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  31.62 
 
 
299 aa  113  4e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2143  protein of unknown function DUF75  29.25 
 
 
301 aa  105  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0211773  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5919  hypothetical protein  29.31 
 
 
284 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2444  protein of unknown function DUF75  30.18 
 
 
288 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5826  protein of unknown function DUF75  28.37 
 
 
297 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22756  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3475  hypothetical protein  30.17 
 
 
296 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2785  protein of unknown function DUF75  27.7 
 
 
286 aa  99.4  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  7.87132e-05  hitchhiker  7.05422e-05 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3052  hypothetical protein  30.17 
 
 
292 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  28.01 
 
 
281 aa  98.2  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2210  protein of unknown function DUF75  26.94 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2670  protein of unknown function DUF75  30.04 
 
 
286 aa  95.9  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361609  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2290  protein of unknown function DUF75  31.29 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1855  hypothetical protein  28.27 
 
 
284 aa  94  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.982924 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  25.83 
 
 
311 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12157  hypothetical protein  29.11 
 
 
292 aa  92  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00120164  normal  0.853503 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2324  hypothetical protein  27.84 
 
 
289 aa  92  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.102651  decreased coverage  0.000172466 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  28.32 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2170  hypothetical protein  27.49 
 
 
289 aa  90.9  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260059  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4500  hypothetical protein  27.02 
 
 
282 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00701907 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1548  protein of unknown function DUF75  28.97 
 
 
279 aa  90.1  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3162  hypothetical protein  29.69 
 
 
296 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3150  hypothetical protein  29.69 
 
 
296 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0142521  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3212  hypothetical protein  29.69 
 
 
296 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.550185  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22220  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  27.33 
 
 
290 aa  89.7  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.737687 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1173  hypothetical protein  27.61 
 
 
283 aa  87  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16230  Protein of unknown function DUF75  29.22 
 
 
269 aa  85.9  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1842  protein of unknown function DUF75  27.14 
 
 
294 aa  85.5  1e-15  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  29.96 
 
 
283 aa  85.1  1e-15  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2630  hypothetical protein  26.74 
 
 
282 aa  84  3e-15  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2246  protein of unknown function DUF75  27.18 
 
 
283 aa  82.8  7e-15  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640776  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5396  protein of unknown function DUF75  28.57 
 
 
302 aa  82.8  7e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13900  ATP-grasp superfamily enzyme  26.56 
 
 
286 aa  77.8  2e-13  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331595  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2640  hypothetical protein  28.69 
 
 
280 aa  78.2  2e-13  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512604  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1837  protein of unknown function DUF75  27.53 
 
 
284 aa  73.6  4e-12  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20950  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  28.28 
 
 
306 aa  72  1e-11  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4890  hypothetical protein  25.86 
 
 
280 aa  69.3  7e-11  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  26.32 
 
 
296 aa  62.8  7e-09  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0447  hypothetical protein  22.14 
 
 
277 aa  61.2  2e-08  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  1.6468e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2169  hypothetical protein  25.45 
 
 
301 aa  57.8  2e-07  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0362139  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11820  ATP-grasp superfamily enzyme  27.21 
 
 
316 aa  57  4e-07  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485047  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1912  protein of unknown function DUF75  25 
 
 
301 aa  56.6  5e-07  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83665e-10 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3209  hypothetical protein  24.58 
 
 
312 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>