88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2128 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2128  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6498  hypothetical protein  88.04 
 
 		 184 aa  336  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.188707  normal  0.480601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3352  hypothetical protein  38.04 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0400145  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0557  hypothetical protein  38.25 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2991  protein of unknown function DUF820  37.8 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0645262  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3383  protein of unknown function DUF820  37.43 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0149444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0380  hypothetical protein  34.25 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1153  hypothetical protein  36.41 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2224  hypothetical protein  34.55 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8443  protein of unknown function DUF820  37.86 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0498606 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2097  protein of unknown function DUF820  32.05 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5162  protein of unknown function DUF820  33.53 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1672  protein of unknown function DUF820  31.16 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158982 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  33.09 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4246  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  35.16 
 
 		 203 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3648  protein of unknown function DUF820  30.23 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6884  hypothetical protein  31.68 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  34.65 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7645  protein of unknown function DUF820  32.81 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  31.76 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  33.86 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  26.9 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2118  protein of unknown function DUF820  32.76 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0006  hypothetical protein  31.93 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3647  protein of unknown function DUF820  29.07 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0632204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  30.3 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8829  protein of unknown function DUF820  29.44 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  32.37 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1625  hypothetical protein  30 
 
 		 189 aa  51.6  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6783  hypothetical protein  32.2 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  31.25 
 
 		 186 aa  51.6  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  29.32 
 
 		 204 aa  51.2  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5079  protein of unknown function DUF820  29.76 
 
 		 214 aa  51.2  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.581399 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  26.88 
 
 		 218 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1503  hypothetical protein  28.04 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000135867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0863  protein of unknown function DUF820  28.68 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000768463  decreased coverage  0.000000790424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  30.95 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  31.3 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  29.58 
 
 		 253 aa  48.1  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4511  protein of unknown function DUF820  27.7 
 
 		 195 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  32.35 
 
 		 184 aa  47.8  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2158  protein of unknown function DUF820  34.62 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0002  protein of unknown function DUF820  27.7 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  25.32 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2162  hypothetical protein  30.08 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  26.77 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4366  protein of unknown function DUF820  25.95 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.353862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0820  protein of unknown function DUF820  26.92 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0980811 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0890  protein of unknown function DUF820  34.17 
 
 		 203 aa  45.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.288036  normal  0.0388608 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1865  hypothetical protein  27.75 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.978149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1720  protein of unknown function DUF820  29.66 
 
 		 210 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00000927877  decreased coverage  0.000371214 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2159  protein of unknown function DUF820  35.4 
 
 		 189 aa  45.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  28.3 
 
 		 190 aa  45.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  30.64 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  28.74 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  35.9 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2885  hypothetical protein  32.5 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1522  hypothetical protein  27.74 
 
 		 209 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.793245  hitchhiker  0.00163452 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  31.93 
 
 		 203 aa  44.3  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  28.31 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  33.62 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0685  hypothetical protein  28.91 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142193  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  25.86 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2157  protein of unknown function DUF820  34.51 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  23.2 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  29.86 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  23.97 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0371  hypothetical protein  30.4 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4350  protein of unknown function DUF820  29.46 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2404  hypothetical protein  28.49 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4621  protein of unknown function DUF820  24.14 
 
 		 188 aa  42.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  25.54 
 
 		 227 aa  42.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2202  hypothetical protein  28.33 
 
 		 217 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4308  protein of unknown function DUF820  26.43 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.254676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0819  protein of unknown function DUF820  25.31 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0957178 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  27.38 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  25.53 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  27.97 
 
 		 193 aa  42  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3083  hypothetical protein  27.82 
 
 		 195 aa  42  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.439197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0094  hypothetical protein  26.26 
 
 		 193 aa  42  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000049462  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  26.45 
 
 		 180 aa  42  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0217  hypothetical protein  30.09 
 
 		 233 aa  41.6  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  normal  0.202334 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  28.91 
 
 		 189 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1348  hypothetical protein  36.36 
 
 		 124 aa  41.6  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0417426  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  28 
 
 		 197 aa  41.2  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0721  protein of unknown function DUF820  27.94 
 
 		 254 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00402744  normal  0.197954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1327  protein of unknown function DUF820  25.93 
 
 		 223 aa  41.6  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621558  normal  0.19062 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>