34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1522 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1522  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  414  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.793245  hitchhiker  0.00163452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6884  hypothetical protein  56.93 
 
 
200 aa  224  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3939  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.117459  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  29.17 
 
 
186 aa  61.6  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8040  hypothetical protein  29.31 
 
 
197 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4494  hypothetical protein  36.84 
 
 
159 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8121  hypothetical protein  29.67 
 
 
182 aa  51.6  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  29.89 
 
 
191 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  29.29 
 
 
257 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7645  protein of unknown function DUF820  34.81 
 
 
198 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2097  protein of unknown function DUF820  26.88 
 
 
191 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  29.23 
 
 
182 aa  48.1  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  29.32 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  30.82 
 
 
202 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  27.39 
 
 
187 aa  45.8  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  31.2 
 
 
197 aa  45.1  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5079  protein of unknown function DUF820  27.63 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.581399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6498  hypothetical protein  29.33 
 
 
184 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.188707  normal  0.480601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2128  hypothetical protein  27.74 
 
 
184 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578066  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1616  hypothetical protein  33.72 
 
 
108 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00151219  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  29.88 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  30.26 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  25.35 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  31.25 
 
 
184 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8829  protein of unknown function DUF820  24.4 
 
 
225 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  30.65 
 
 
197 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  27.12 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  28.77 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0380  hypothetical protein  28.4 
 
 
224 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  28.9 
 
 
207 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  26.29 
 
 
187 aa  42.4  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4366  protein of unknown function DUF820  29.59 
 
 
194 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.353862 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  27.82 
 
 
218 aa  41.6  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1615  protein of unknown function DUF820  26.99 
 
 
197 aa  41.2  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.852341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>