More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2111 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2111  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 511 aa  1011    Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0054618  normal  0.499354 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3372  monooxygenase FAD-binding protein  46.49 
 
 		 553 aa  295  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  35.04 
 
 		 544 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  39.35 
 
 		 461 aa  220  6e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  42.57 
 
 		 511 aa  214  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2975  monooxygenase FAD-binding protein  39.94 
 
 		 506 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0868842  hitchhiker  0.000653809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  40.74 
 
 		 493 aa  209  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  40.49 
 
 		 486 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  37.99 
 
 		 486 aa  204  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  38.12 
 
 		 548 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  38.12 
 
 		 548 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  38.46 
 
 		 548 aa  203  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  40.05 
 
 		 549 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  38.96 
 
 		 489 aa  201  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  34.55 
 
 		 500 aa  199  9e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  39.94 
 
 		 518 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  38.23 
 
 		 550 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  37.95 
 
 		 550 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  38.69 
 
 		 546 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  33.77 
 
 		 574 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  34.03 
 
 		 574 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  38.38 
 
 		 506 aa  189  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  38.24 
 
 		 414 aa  188  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  37.96 
 
 		 546 aa  187  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  36.77 
 
 		 537 aa  187  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  40.18 
 
 		 553 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  36.49 
 
 		 537 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  36.49 
 
 		 537 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  40.76 
 
 		 481 aa  183  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  38.1 
 
 		 506 aa  183  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  35.91 
 
 		 548 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  35.91 
 
 		 548 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  36.71 
 
 		 511 aa  182  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  34.22 
 
 		 571 aa  181  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  35.36 
 
 		 548 aa  180  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  35.91 
 
 		 548 aa  181  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  35.91 
 
 		 548 aa  181  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  35.91 
 
 		 611 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  35.39 
 
 		 388 aa  179  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  37.01 
 
 		 552 aa  179  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  34.62 
 
 		 512 aa  179  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  35.46 
 
 		 538 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  35.46 
 
 		 538 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  34.46 
 
 		 505 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  39.41 
 
 		 498 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  35.78 
 
 		 511 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  31.67 
 
 		 535 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  35.67 
 
 		 502 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  37.68 
 
 		 529 aa  171  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  35.96 
 
 		 502 aa  170  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  35.85 
 
 		 501 aa  168  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  35.67 
 
 		 502 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3485  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases-like  31.59 
 
 		 557 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5297  monooxygenase, FAD-binding protein  37.03 
 
 		 515 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.85745  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5676  monooxygenase, FAD-binding  37.03 
 
 		 515 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  33.71 
 
 		 540 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5386  monooxygenase, FAD-binding  37.03 
 
 		 515 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.416517 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  39.12 
 
 		 508 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  35.38 
 
 		 502 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  34.62 
 
 		 477 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  36.34 
 
 		 479 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  34.75 
 
 		 547 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  33.79 
 
 		 531 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  36.39 
 
 		 480 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  34.07 
 
 		 968 aa  158  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  35.67 
 
 		 494 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  34.29 
 
 		 477 aa  157  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9228  hypothetical protein  37.65 
 
 		 504 aa  156  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  28.43 
 
 		 566 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  34.55 
 
 		 486 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  30.64 
 
 		 485 aa  154  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  37.59 
 
 		 510 aa  153  5.9999999999999996e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  33.2 
 
 		 489 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  31.01 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  35.71 
 
 		 493 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  34.73 
 
 		 478 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  31.9 
 
 		 486 aa  147  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  34.81 
 
 		 522 aa  146  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  32.05 
 
 		 505 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2454  regulatory proteins, IclR  32.28 
 
 		 575 aa  143  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.283629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  31.81 
 
 		 475 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  32.05 
 
 		 477 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  30.93 
 
 		 475 aa  141  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  31.19 
 
 		 586 aa  141  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  34.26 
 
 		 478 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  34.26 
 
 		 478 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  31.07 
 
 		 569 aa  140  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  31.76 
 
 		 558 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  31.47 
 
 		 559 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  35.19 
 
 		 503 aa  138  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  31.5 
 
 		 555 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  31.47 
 
 		 559 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  32.38 
 
 		 537 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  31.23 
 
 		 553 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 541 aa  137  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  30.97 
 
 		 553 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  30.97 
 
 		 553 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 561 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  33.42 
 
 		 594 aa  136  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  31.23 
 
 		 555 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>