25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0092 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0092  hypothetical protein  100 
 
 		 1202 aa  2271    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7212  HSP90 family heat shock protein  56.2 
 
 		 1315 aa  949    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.735343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3292  hypothetical protein  37.47 
 
 		 985 aa  491  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162566 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0820  hypothetical protein  39.51 
 
 		 1034 aa  490  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0237  hypothetical protein  37.3 
 
 		 1029 aa  445  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8899  hypothetical protein  36.35 
 
 		 1043 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7241  hypothetical protein  36.09 
 
 		 1067 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3837  hypothetical protein  37.88 
 
 		 1030 aa  328  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0486  hypothetical protein  34.12 
 
 		 942 aa  278  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4183  ATP-binding region ATPase domain protein  34.66 
 
 		 1084 aa  231  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0748  hypothetical protein  42.73 
 
 		 1026 aa  227  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0425394 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33990  hypothetical protein  31.09 
 
 		 946 aa  221  7e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0701256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4727  hypothetical protein  36.56 
 
 		 1012 aa  182  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2928  hypothetical protein  32.21 
 
 		 1284 aa  176  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0850  hypothetical protein  30.72 
 
 		 1017 aa  161  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0172935 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3582  hypothetical protein  38.56 
 
 		 985 aa  117  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198252  normal  0.225494 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1240  hypothetical protein  33.57 
 
 		 940 aa  115  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.181323  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0830  hypothetical protein  34.86 
 
 		 847 aa  100  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0995213  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3709  hypothetical protein  36.76 
 
 		 1306 aa  63.2  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5338  hypothetical protein  29.77 
 
 		 1934 aa  58.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625438  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2987  ATP-binding region ATPase domain protein  36.36 
 
 		 622 aa  55.1  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0695  HSP90 family protein  30.41 
 
 		 643 aa  46.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1719  heat shock protein 90  33.33 
 
 		 656 aa  45.4  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3901  heat shock protein 90  27.27 
 
 		 653 aa  45.4  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.795746  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1538  heat shock protein 90  29.85 
 
 		 637 aa  45.1  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0309955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>