91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_R0046 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_R0046  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000910848  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0053  tRNA-Val  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000250607  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0045  tRNA-Val  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0043  tRNA-Val  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000282186  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0045  tRNA-Val  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0065  tRNA-Val  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0059636  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0059  tRNA-Val  94.2 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000382947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0043  tRNA-Val  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000221825  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0043  tRNA-Val  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.174816  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0040  tRNA-Val  91.07 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288253  hitchhiker  0.000507453 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0039  tRNA-Val  91.07 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00107403  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0043  tRNA-Val  91.07 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0177605  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0047  tRNA-Val  91.07 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00873766  hitchhiker  0.00896999 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0021  tRNA-Val  97.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0022  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0036  tRNA-Val  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0258762  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0021  tRNA-Val  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Val-3  tRNA-Val  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0063  tRNA-Val  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00355332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0024  tRNA-Val  86.96 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.415553  normal  0.401158 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0057  tRNA-Val  93.18 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.700226  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0038  tRNA-Val  95 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00268365  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0020  tRNA-Val  87.3 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0014  tRNA-Val  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0026  tRNA-Val  88.89 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0265977  hitchhiker  0.000432959 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14034  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0041  tRNA-Val  94.74 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000505895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0037  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605152  normal  0.0106326 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0014  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0026  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0029  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0018  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0014  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0015  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0817161  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0046  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467185  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0041  tRNA-Val  92.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.424139  normal  0.210105 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0029  tRNA-Val  96.97 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0042  tRNA-Val  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288324  hitchhiker  0.00194275 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0029  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.23403e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0045  tRNA-Val  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.218137  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0042  tRNA-Val  86.84 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000949792  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0021  tRNA-Val  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0144657  normal  0.36354 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Val-1  tRNA-Val  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0049359  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2615  tRNA-Val  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.71269  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0027  tRNA-Val  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.480715 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0065  tRNA-Val  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0028  tRNA-Val  90.7 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.278514 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0050  tRNA-Val  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0024  tRNA-Val  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.198375  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0058  tRNA-Val  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0008  tRNA-Val  90.7 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0028  tRNA-Val  94.29 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0026  tRNA-Val  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411365 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0953  tRNA-Val  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0027  tRNA-Val  90.7 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0757548  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0008  tRNA-Val  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.190638  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0029  tRNA-Val  94.29 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.575368 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0027  tRNA-Val  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.60657 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0093  tRNA-Val  88 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07210  tRNA-Val  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000170104  normal  0.87743 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0029  tRNA-Val  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0245746  normal  0.0651884 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09530  tRNA-Val  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0129641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0033  tRNA-Val  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0037  tRNA-Val  96.55 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0031  tRNA-Val  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0020  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000127781  normal  0.601367 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0049  tRNA-Val  83.82 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.193583  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0037  tRNA-Val  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00626142  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0044  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00403684  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0032  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14860  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303289  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t15  tRNA-Val  83.82 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0047  tRNA-Val  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.561657  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0028  tRNA-Val  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.464795  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0043  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0037  tRNA-Val  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0052    83.1 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0014  tRNA-Val  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.629466 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0041  tRNA-Val  83.1 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345856  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0053  tRNA-Val  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.694322  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0046  tRNA-Val  83.1 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0030  tRNA-Val  88.24 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000000857099  normal  0.523891 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07570  tRNA-Val  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.10137  normal  0.977811 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0056  tRNA-Val  83.1 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15510  tRNA-Val  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00141573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0046  tRNA-Val  83.1 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.26227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0020  tRNA-Val  83.1 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0049  tRNA-Val  83.1 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.507561 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0038  tRNA-Val  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.978426  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0046  tRNA-Val  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0191389  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0061  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.272807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>