75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1332 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1332  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  426  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1625  hypothetical protein  40.85 
 
 
217 aa  153  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.109704  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0285  hypothetical protein  39.91 
 
 
217 aa  149  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0013  hypothetical protein  45.45 
 
 
213 aa  145  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0013  hypothetical protein  45.45 
 
 
213 aa  145  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0788  hypothetical protein  36.79 
 
 
212 aa  125  5e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1146  Putitive phosphate transport regulator  26.67 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.266401  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3884  hypothetical protein  26.99 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5953  hypothetical protein  25.23 
 
 
225 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  25.58 
 
 
205 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0036  Putitive phosphate transport regulator  29.09 
 
 
218 aa  63.5  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0618  hypothetical protein  28.12 
 
 
226 aa  63.2  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.357102  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68800  hypothetical protein  25.23 
 
 
225 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0369  hypothetical protein  29.07 
 
 
222 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000496164  unclonable  0.0000000000477389 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  25.58 
 
 
205 aa  62.4  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2044  hypothetical protein  28.9 
 
 
228 aa  62  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000405279  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3320  hypothetical protein  24.89 
 
 
225 aa  60.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0717  hypothetical protein  27.08 
 
 
226 aa  60.1  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000253337  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  26.13 
 
 
205 aa  59.7  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0351  hypothetical protein  24.77 
 
 
225 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3843  hypothetical protein  26.56 
 
 
226 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000724256  hitchhiker  0.0000000283379 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  24.65 
 
 
205 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3224  hypothetical protein  23.7 
 
 
222 aa  55.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0618  hypothetical protein  26.29 
 
 
223 aa  55.5  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  25.84 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0634  hypothetical protein  26.34 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3487  hypothetical protein  26.56 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126131  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1336  protein of unknown function DUF47  23.85 
 
 
211 aa  50.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2470  hypothetical protein  23.63 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1052  hypothetical protein  22.16 
 
 
224 aa  49.7  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170442  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  23.36 
 
 
205 aa  49.7  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2673  hypothetical protein  25 
 
 
226 aa  49.7  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  24.42 
 
 
206 aa  48.9  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1521  hypothetical protein  21.36 
 
 
219 aa  48.9  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.393422  normal  0.128307 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0262  Putitive phosphate transport regulator  23.6 
 
 
240 aa  47.8  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  23.7 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2827  hypothetical protein  21.97 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245918  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3638  hypothetical protein  22.83 
 
 
226 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1465  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0711  hypothetical protein  24.68 
 
 
226 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  25.6 
 
 
219 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0565  hypothetical protein  24.26 
 
 
226 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  22.73 
 
 
205 aa  46.2  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0181  hypothetical protein  21.47 
 
 
226 aa  45.8  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  24.85 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000112514  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004528  phosphate transport regulator  22.75 
 
 
195 aa  45.4  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.327148  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0692  hypothetical protein  24.2 
 
 
226 aa  45.4  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130211  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00863  hypothetical protein  22.75 
 
 
228 aa  45.1  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0138  putative pit accessory protein  28.7 
 
 
238 aa  44.3  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0822  hypothetical protein  24.62 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000109083  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0853  hypothetical protein  24.62 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000459273  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3119  hypothetical protein  24.62 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000717729  normal  0.542025 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0054  Putitive phosphate transport regulator  25.31 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  23 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3096  hypothetical protein  24.62 
 
 
226 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000106475  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  23.26 
 
 
208 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  25 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0907  protein of unknown function DUF47  24.48 
 
 
226 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000556938  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  23.26 
 
 
208 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  26.35 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0917  hypothetical protein  24.48 
 
 
226 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00343614  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0883  hypothetical protein  24.48 
 
 
226 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3455  hypothetical protein  24.48 
 
 
226 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000227297  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  24.24 
 
 
209 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3770  hypothetical protein  23.08 
 
 
226 aa  43.5  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  23.57 
 
 
205 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2681  hypothetical protein  25 
 
 
226 aa  42.7  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0612362  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  22.22 
 
 
205 aa  42.4  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  21.56 
 
 
217 aa  42.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0299  protein of unknown function DUF47  21.52 
 
 
206 aa  42  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686471  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2188  hypothetical protein  28.7 
 
 
226 aa  42.4  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.839701  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1647  hypothetical protein  23.03 
 
 
211 aa  42  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  20.19 
 
 
208 aa  42  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0141  Putitive phosphate transport regulator  22.54 
 
 
226 aa  42  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.572504  normal  0.330321 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  22.86 
 
 
205 aa  42  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  25.6 
 
 
208 aa  41.6  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.80224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>