53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2673 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2673  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3487  hypothetical protein  80.09 
 
 		 226 aa  379  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126131  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0692  hypothetical protein  80.44 
 
 		 226 aa  378  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130211  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3843  hypothetical protein  80.53 
 
 		 226 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000724256  hitchhiker  0.0000000283379 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0717  hypothetical protein  79.65 
 
 		 226 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000253337  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0618  hypothetical protein  78.32 
 
 		 226 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.357102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0565  hypothetical protein  78.22 
 
 		 226 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0917  hypothetical protein  76.55 
 
 		 226 aa  363  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00343614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0883  hypothetical protein  76.55 
 
 		 226 aa  363  1e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0907  protein of unknown function DUF47  76.55 
 
 		 226 aa  363  1e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000556938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3455  hypothetical protein  76.55 
 
 		 226 aa  363  1e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000227297  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3119  hypothetical protein  76.11 
 
 		 226 aa  360  1e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000717729  normal  0.542025 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0853  hypothetical protein  76.11 
 
 		 226 aa  360  1e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000459273  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0822  hypothetical protein  76.11 
 
 		 226 aa  360  1e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000109083  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3770  hypothetical protein  75.22 
 
 		 226 aa  359  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3096  hypothetical protein  75.66 
 
 		 226 aa  359  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2019  hypothetical protein  64.44 
 
 		 228 aa  313  9.999999999999999e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582127  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00863  hypothetical protein  63.56 
 
 		 228 aa  310  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3638  hypothetical protein  64.89 
 
 		 226 aa  308  2.9999999999999997e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1465  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2681  hypothetical protein  63.56 
 
 		 226 aa  308  5.9999999999999995e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0612362  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3320  hypothetical protein  62.05 
 
 		 225 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0181  hypothetical protein  64 
 
 		 226 aa  302  4.0000000000000003e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1190  phosphate transport regulator  57.33 
 
 		 226 aa  278  6e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.967179  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0351  hypothetical protein  54.22 
 
 		 225 aa  265  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004528  phosphate transport regulator  62.89 
 
 		 195 aa  263  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.327148  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68800  hypothetical protein  53.33 
 
 		 225 aa  260  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5953  hypothetical protein  52.89 
 
 		 225 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0634  hypothetical protein  52.02 
 
 		 223 aa  250  1e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0618  hypothetical protein  51.57 
 
 		 223 aa  250  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2827  hypothetical protein  48.17 
 
 		 224 aa  233  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0138  putative pit accessory protein  48.42 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2188  hypothetical protein  48.42 
 
 		 226 aa  226  2e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.839701  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2470  hypothetical protein  50.89 
 
 		 226 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0141  Putitive phosphate transport regulator  48.66 
 
 		 226 aa  222  4e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.572504  normal  0.330321 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0711  hypothetical protein  48.43 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1052  hypothetical protein  45.16 
 
 		 224 aa  198  6e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170442  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0228  hypothetical protein  42.67 
 
 		 227 aa  174  8e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.775061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1146  Putitive phosphate transport regulator  30.45 
 
 		 227 aa  122  6e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.266401  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0063  hypothetical protein  28.24 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2044  hypothetical protein  30.94 
 
 		 228 aa  105  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000405279  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3224  hypothetical protein  26.7 
 
 		 222 aa  92.4  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0788  hypothetical protein  27.49 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1625  hypothetical protein  27.01 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.109704  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0285  hypothetical protein  28.44 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0036  Putitive phosphate transport regulator  27.68 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0013  hypothetical protein  27.48 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0013  hypothetical protein  27.48 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1923  hypothetical protein  27.4 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00116502  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0688  hypothetical protein  25.15 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000115743  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0664  hypothetical protein  24.55 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000019589  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3780  phosphate transport regulator-like  24.56 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0493  hypothetical protein  23.47 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000213235  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1332  hypothetical protein  25 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>