18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3884 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3884  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0369  hypothetical protein  70.72 
 
 		 222 aa  304  6e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000496164  unclonable  0.0000000000477389 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0788  hypothetical protein  31.01 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0013  hypothetical protein  25.12 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0013  hypothetical protein  25.12 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1625  hypothetical protein  29.27 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.109704  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0285  hypothetical protein  28.05 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1332  hypothetical protein  26.99 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0228  hypothetical protein  26.67 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.775061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  27.11 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  26.35 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0351  hypothetical protein  26.4 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  25.75 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1190  phosphate transport regulator  39.33 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.967179  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  22.94 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3224  hypothetical protein  24.28 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0711  hypothetical protein  27.01 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  23.49 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>