55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004528 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004528  phosphate transport regulator  100 
 
 		 195 aa  394  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.327148  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00863  hypothetical protein  98.46 
 
 		 228 aa  390  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2019  hypothetical protein  91.28 
 
 		 228 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582127  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2681  hypothetical protein  83.59 
 
 		 226 aa  335  2.9999999999999997e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0612362  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3843  hypothetical protein  69.07 
 
 		 226 aa  285  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000724256  hitchhiker  0.0000000283379 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0717  hypothetical protein  68.56 
 
 		 226 aa  278  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000253337  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3770  hypothetical protein  67.53 
 
 		 226 aa  278  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3455  hypothetical protein  66.49 
 
 		 226 aa  276  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000227297  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0917  hypothetical protein  66.49 
 
 		 226 aa  276  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00343614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0883  hypothetical protein  66.49 
 
 		 226 aa  276  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0907  protein of unknown function DUF47  66.49 
 
 		 226 aa  276  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000556938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0565  hypothetical protein  66.67 
 
 		 226 aa  276  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3096  hypothetical protein  65.46 
 
 		 226 aa  274  7e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000106475  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3119  hypothetical protein  65.46 
 
 		 226 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000717729  normal  0.542025 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0822  hypothetical protein  65.46 
 
 		 226 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000109083  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0853  hypothetical protein  65.46 
 
 		 226 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000459273  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0618  hypothetical protein  67.01 
 
 		 226 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.357102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0692  hypothetical protein  65.13 
 
 		 226 aa  270  8.000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130211  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3487  hypothetical protein  65.98 
 
 		 226 aa  269  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126131  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1190  phosphate transport regulator  64.1 
 
 		 226 aa  266  1e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.967179  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2673  hypothetical protein  62.89 
 
 		 226 aa  263  8.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3638  hypothetical protein  60.82 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1465  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0181  hypothetical protein  59.49 
 
 		 226 aa  252  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3320  hypothetical protein  60.62 
 
 		 225 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0351  hypothetical protein  56.7 
 
 		 225 aa  229  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68800  hypothetical protein  53.09 
 
 		 225 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5953  hypothetical protein  52.06 
 
 		 225 aa  218  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0618  hypothetical protein  51.03 
 
 		 223 aa  214  4e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0634  hypothetical protein  51.03 
 
 		 223 aa  214  5.9999999999999996e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2827  hypothetical protein  48.45 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2470  hypothetical protein  47.12 
 
 		 226 aa  184  7e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1052  hypothetical protein  48.44 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170442  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2188  hypothetical protein  45.88 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.839701  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0138  putative pit accessory protein  45.36 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0711  hypothetical protein  44.1 
 
 		 226 aa  173  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0141  Putitive phosphate transport regulator  42.93 
 
 		 226 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.572504  normal  0.330321 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0228  hypothetical protein  40.1 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.775061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1146  Putitive phosphate transport regulator  30 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.266401  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2044  hypothetical protein  28.81 
 
 		 228 aa  93.2  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000405279  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0063  hypothetical protein  26.04 
 
 		 224 aa  90.5  1e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3224  hypothetical protein  28.82 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1625  hypothetical protein  26.04 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.109704  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0664  hypothetical protein  26.74 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000019589  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0788  hypothetical protein  24.48 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0688  hypothetical protein  24.42 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000115743  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0285  hypothetical protein  24.6 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0493  hypothetical protein  24.71 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000213235  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0013  hypothetical protein  27.59 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0013  hypothetical protein  27.59 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1923  hypothetical protein  26.34 
 
 		 223 aa  52  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00116502  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0036  Putitive phosphate transport regulator  26.86 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3780  phosphate transport regulator-like  25.42 
 
 		 226 aa  48.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1332  hypothetical protein  22.75 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  24.71 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  24.71 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>