43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3780 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3780  phosphate transport regulator-like  100 
 
 
226 aa  471  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3224  hypothetical protein  30.22 
 
 
222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1146  Putitive phosphate transport regulator  28.51 
 
 
227 aa  105  4e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.266401  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2044  hypothetical protein  24.65 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000405279  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3455  hypothetical protein  28.06 
 
 
226 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000227297  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0907  protein of unknown function DUF47  28.06 
 
 
226 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000556938  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0917  hypothetical protein  28.06 
 
 
226 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00343614  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0883  hypothetical protein  28.06 
 
 
226 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3770  hypothetical protein  26.62 
 
 
226 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3487  hypothetical protein  25.11 
 
 
226 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126131  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3119  hypothetical protein  27.34 
 
 
226 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000717729  normal  0.542025 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0822  hypothetical protein  27.34 
 
 
226 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000109083  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0853  hypothetical protein  27.34 
 
 
226 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000459273  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3096  hypothetical protein  27.34 
 
 
226 aa  59.7  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000106475  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2673  hypothetical protein  24.56 
 
 
226 aa  59.3  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1190  phosphate transport regulator  27.27 
 
 
226 aa  58.9  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.967179  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0063  hypothetical protein  21.82 
 
 
224 aa  58.9  0.00000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2827  hypothetical protein  26.24 
 
 
224 aa  57.4  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245918  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3843  hypothetical protein  24.23 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000724256  hitchhiker  0.0000000283379 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3638  hypothetical protein  25.35 
 
 
226 aa  56.2  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1465  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2681  hypothetical protein  29.91 
 
 
226 aa  55.1  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0612362  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0692  hypothetical protein  24.65 
 
 
226 aa  55.1  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130211  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0493  hypothetical protein  25.2 
 
 
224 aa  54.3  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000213235  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0618  hypothetical protein  22.91 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.357102  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0717  hypothetical protein  22.91 
 
 
226 aa  52.8  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000253337  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0181  hypothetical protein  22.27 
 
 
226 aa  52.8  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0228  hypothetical protein  23.01 
 
 
227 aa  52  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.775061  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68800  hypothetical protein  23.36 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5953  hypothetical protein  22.95 
 
 
225 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0565  hypothetical protein  23.74 
 
 
226 aa  48.9  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00863  hypothetical protein  27.62 
 
 
228 aa  48.5  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2019  hypothetical protein  29.33 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582127  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004528  phosphate transport regulator  25.42 
 
 
195 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.327148  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1052  hypothetical protein  19.63 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170442  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0351  hypothetical protein  25 
 
 
225 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0618  hypothetical protein  30 
 
 
223 aa  45.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0634  hypothetical protein  32.86 
 
 
223 aa  45.4  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2188  hypothetical protein  23.74 
 
 
226 aa  45.1  0.0009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.839701  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0138  putative pit accessory protein  25 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1625  hypothetical protein  21.49 
 
 
217 aa  43.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.109704  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3320  hypothetical protein  20.86 
 
 
225 aa  42.7  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1923  hypothetical protein  22.02 
 
 
223 aa  41.6  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00116502  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0141  Putitive phosphate transport regulator  21.94 
 
 
226 aa  41.6  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.572504  normal  0.330321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>