67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0228 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0228  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  456  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.775061  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0351  hypothetical protein  45.74 
 
 
225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2188  hypothetical protein  45.41 
 
 
226 aa  187  9e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.839701  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5953  hypothetical protein  43.75 
 
 
225 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0138  putative pit accessory protein  44.95 
 
 
238 aa  185  6e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68800  hypothetical protein  44 
 
 
225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0717  hypothetical protein  44 
 
 
226 aa  182  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000253337  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3843  hypothetical protein  44 
 
 
226 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000724256  hitchhiker  0.0000000283379 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0917  hypothetical protein  44.89 
 
 
226 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00343614  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0883  hypothetical protein  44.89 
 
 
226 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0618  hypothetical protein  44 
 
 
226 aa  176  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.357102  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3455  hypothetical protein  44.89 
 
 
226 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000227297  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0907  protein of unknown function DUF47  44.89 
 
 
226 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000556938  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3638  hypothetical protein  44.2 
 
 
226 aa  175  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1465  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3096  hypothetical protein  44.44 
 
 
226 aa  175  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000106475  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2673  hypothetical protein  42.67 
 
 
226 aa  174  8e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0618  hypothetical protein  40.09 
 
 
223 aa  174  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0634  hypothetical protein  40.09 
 
 
223 aa  174  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3487  hypothetical protein  43.56 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126131  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3770  hypothetical protein  44 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0141  Putitive phosphate transport regulator  40.97 
 
 
226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.572504  normal  0.330321 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0565  hypothetical protein  43.11 
 
 
226 aa  172  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1052  hypothetical protein  41.18 
 
 
224 aa  171  7.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170442  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0822  hypothetical protein  43.56 
 
 
226 aa  170  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000109083  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3119  hypothetical protein  43.56 
 
 
226 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000717729  normal  0.542025 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0853  hypothetical protein  43.56 
 
 
226 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000459273  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0711  hypothetical protein  41.85 
 
 
226 aa  169  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0692  hypothetical protein  41.33 
 
 
226 aa  167  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130211  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0181  hypothetical protein  40.81 
 
 
226 aa  166  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2681  hypothetical protein  40.62 
 
 
226 aa  165  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0612362  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2827  hypothetical protein  39.82 
 
 
224 aa  166  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245918  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00863  hypothetical protein  38.84 
 
 
228 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3320  hypothetical protein  38.84 
 
 
225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2019  hypothetical protein  38.39 
 
 
228 aa  159  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582127  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2470  hypothetical protein  37 
 
 
226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1190  phosphate transport regulator  37.22 
 
 
226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.967179  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004528  phosphate transport regulator  40.1 
 
 
195 aa  145  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.327148  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0063  hypothetical protein  34.88 
 
 
224 aa  134  9e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1146  Putitive phosphate transport regulator  29.6 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.266401  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2044  hypothetical protein  33.18 
 
 
228 aa  115  6e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000405279  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3224  hypothetical protein  29.82 
 
 
222 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1923  hypothetical protein  28.37 
 
 
223 aa  78.2  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00116502  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0688  hypothetical protein  29.17 
 
 
222 aa  68.2  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000115743  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0664  hypothetical protein  26.79 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000019589  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0013  hypothetical protein  28.82 
 
 
213 aa  59.3  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0013  hypothetical protein  28.82 
 
 
213 aa  59.3  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1625  hypothetical protein  25.12 
 
 
217 aa  56.6  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.109704  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0788  hypothetical protein  22.39 
 
 
212 aa  56.2  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04040  phosphate transport regulator related to PhoU  23.81 
 
 
209 aa  55.5  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.679526 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0493  hypothetical protein  22.07 
 
 
224 aa  55.1  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000213235  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0285  hypothetical protein  24.17 
 
 
217 aa  52.4  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3780  phosphate transport regulator-like  23.01 
 
 
226 aa  52  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0036  Putitive phosphate transport regulator  22.97 
 
 
218 aa  51.2  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  23.47 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3884  hypothetical protein  26.67 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  21.03 
 
 
215 aa  46.2  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  25.42 
 
 
205 aa  45.1  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  22.55 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2716  protein of unknown function DUF47  18.89 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4359  protein of unknown function DUF47  28.32 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.547523  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  28.99 
 
 
211 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  20.38 
 
 
215 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  23.31 
 
 
208 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  24.07 
 
 
208 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  24.07 
 
 
208 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  25 
 
 
205 aa  41.6  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  24.86 
 
 
205 aa  41.6  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>