53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0181 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0181  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  458  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3843  hypothetical protein  64 
 
 		 226 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000724256  hitchhiker  0.0000000283379 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0717  hypothetical protein  63.11 
 
 		 226 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000253337  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2673  hypothetical protein  64 
 
 		 226 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3487  hypothetical protein  62.22 
 
 		 226 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126131  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0618  hypothetical protein  62.22 
 
 		 226 aa  299  3e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.357102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0565  hypothetical protein  60.62 
 
 		 226 aa  295  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3638  hypothetical protein  61.78 
 
 		 226 aa  292  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1465  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3770  hypothetical protein  60.89 
 
 		 226 aa  292  3e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2019  hypothetical protein  59.29 
 
 		 228 aa  291  6e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582127  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00863  hypothetical protein  58.85 
 
 		 228 aa  289  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3096  hypothetical protein  59.56 
 
 		 226 aa  289  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0917  hypothetical protein  60 
 
 		 226 aa  288  4e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00343614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0883  hypothetical protein  60 
 
 		 226 aa  288  4e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2681  hypothetical protein  57.96 
 
 		 226 aa  288  4e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0612362  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0907  protein of unknown function DUF47  60 
 
 		 226 aa  288  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000556938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3455  hypothetical protein  60 
 
 		 226 aa  288  4e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000227297  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0692  hypothetical protein  59.29 
 
 		 226 aa  288  4e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130211  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0822  hypothetical protein  59.56 
 
 		 226 aa  287  8e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000109083  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3119  hypothetical protein  59.56 
 
 		 226 aa  287  8e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000717729  normal  0.542025 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0853  hypothetical protein  59.56 
 
 		 226 aa  287  8e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000459273  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3320  hypothetical protein  56.7 
 
 		 225 aa  270  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1190  phosphate transport regulator  55.31 
 
 		 226 aa  268  5.9999999999999995e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.967179  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004528  phosphate transport regulator  59.49 
 
 		 195 aa  252  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.327148  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0351  hypothetical protein  50.67 
 
 		 225 aa  241  5e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68800  hypothetical protein  47.56 
 
 		 225 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5953  hypothetical protein  47.11 
 
 		 225 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0634  hypothetical protein  49.33 
 
 		 223 aa  231  8.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0618  hypothetical protein  48.88 
 
 		 223 aa  230  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0138  putative pit accessory protein  49.32 
 
 		 238 aa  221  7e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2827  hypothetical protein  47.25 
 
 		 224 aa  218  7.999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2188  hypothetical protein  47.51 
 
 		 226 aa  214  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.839701  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2470  hypothetical protein  46.43 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0141  Putitive phosphate transport regulator  43.3 
 
 		 226 aa  201  6e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.572504  normal  0.330321 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0711  hypothetical protein  43.5 
 
 		 226 aa  185  6e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1052  hypothetical protein  39.73 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170442  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0228  hypothetical protein  40.81 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.775061  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0063  hypothetical protein  29.67 
 
 		 224 aa  113  3e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1146  Putitive phosphate transport regulator  28.18 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.266401  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2044  hypothetical protein  29.78 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000405279  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3224  hypothetical protein  24.89 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0788  hypothetical protein  25.11 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0013  hypothetical protein  26.48 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0013  hypothetical protein  26.48 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1625  hypothetical protein  24.2 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.109704  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0285  hypothetical protein  24.09 
 
 		 217 aa  62  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0664  hypothetical protein  21.95 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000019589  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0688  hypothetical protein  23.17 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000115743  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3780  phosphate transport regulator-like  22.27 
 
 		 226 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0036  Putitive phosphate transport regulator  25.11 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1923  hypothetical protein  22.73 
 
 		 223 aa  52  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00116502  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0493  hypothetical protein  20.37 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000213235  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1332  hypothetical protein  21.47 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>