79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5953 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5953  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68800  hypothetical protein  98.67 
 
 
225 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0351  hypothetical protein  81.33 
 
 
225 aa  381  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3843  hypothetical protein  52.89 
 
 
226 aa  267  8e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000724256  hitchhiker  0.0000000283379 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0618  hypothetical protein  53.33 
 
 
226 aa  264  8.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.357102  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3487  hypothetical protein  52.89 
 
 
226 aa  264  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126131  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0717  hypothetical protein  53.33 
 
 
226 aa  262  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000253337  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3320  hypothetical protein  52.68 
 
 
225 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2673  hypothetical protein  52.89 
 
 
226 aa  259  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3638  hypothetical protein  52.44 
 
 
226 aa  256  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1465  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0917  hypothetical protein  52.44 
 
 
226 aa  255  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00343614  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3455  hypothetical protein  52.44 
 
 
226 aa  255  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000227297  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0883  hypothetical protein  52.44 
 
 
226 aa  255  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0907  protein of unknown function DUF47  52.44 
 
 
226 aa  255  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000556938  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00863  hypothetical protein  51.11 
 
 
228 aa  255  5e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0565  hypothetical protein  51.56 
 
 
226 aa  254  5e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3096  hypothetical protein  52 
 
 
226 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2019  hypothetical protein  50.67 
 
 
228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582127  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3770  hypothetical protein  51.56 
 
 
226 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3119  hypothetical protein  51.56 
 
 
226 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000717729  normal  0.542025 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0853  hypothetical protein  51.56 
 
 
226 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000459273  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0822  hypothetical protein  51.56 
 
 
226 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000109083  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2681  hypothetical protein  49.33 
 
 
226 aa  249  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0612362  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0692  hypothetical protein  50.67 
 
 
226 aa  249  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130211  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2827  hypothetical protein  53.18 
 
 
224 aa  246  3e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245918  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0618  hypothetical protein  49.54 
 
 
223 aa  245  4.9999999999999997e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0634  hypothetical protein  50 
 
 
223 aa  245  4.9999999999999997e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0181  hypothetical protein  47.11 
 
 
226 aa  239  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2470  hypothetical protein  54.46 
 
 
226 aa  238  5e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1190  phosphate transport regulator  48.44 
 
 
226 aa  238  6.999999999999999e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.967179  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0711  hypothetical protein  52.02 
 
 
226 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0138  putative pit accessory protein  48.86 
 
 
238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0141  Putitive phosphate transport regulator  51.34 
 
 
226 aa  231  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.572504  normal  0.330321 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2188  hypothetical protein  48.86 
 
 
226 aa  231  8.000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.839701  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004528  phosphate transport regulator  52.06 
 
 
195 aa  218  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.327148  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1052  hypothetical protein  48.64 
 
 
224 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170442  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0228  hypothetical protein  43.75 
 
 
227 aa  186  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.775061  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0063  hypothetical protein  31.65 
 
 
224 aa  126  3e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1146  Putitive phosphate transport regulator  28.89 
 
 
227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.266401  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2044  hypothetical protein  28.31 
 
 
228 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000405279  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3224  hypothetical protein  26.13 
 
 
222 aa  92.8  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0013  hypothetical protein  29.91 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0013  hypothetical protein  29.91 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0788  hypothetical protein  23.18 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1625  hypothetical protein  24.19 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.109704  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1332  hypothetical protein  25.23 
 
 
215 aa  64.3  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0285  hypothetical protein  23.72 
 
 
217 aa  63.9  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0493  hypothetical protein  22.49 
 
 
224 aa  60.1  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000213235  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0664  hypothetical protein  22.22 
 
 
222 aa  59.3  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000019589  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1923  hypothetical protein  22.58 
 
 
223 aa  58.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00116502  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0688  hypothetical protein  22.22 
 
 
222 aa  55.8  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000115743  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  26.82 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1747  hypothetical protein  25.76 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  25.42 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3780  phosphate transport regulator-like  22.95 
 
 
226 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  23.63 
 
 
208 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  25.99 
 
 
215 aa  50.1  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  25.99 
 
 
215 aa  50.1  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  21.59 
 
 
205 aa  48.5  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  19.35 
 
 
208 aa  48.5  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  22.87 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  24.86 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3394  hypothetical protein  21.91 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103625  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0036  Putitive phosphate transport regulator  20.09 
 
 
218 aa  47  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  25.86 
 
 
215 aa  46.2  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  19.35 
 
 
208 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  19.35 
 
 
208 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  23.73 
 
 
215 aa  45.1  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1084  Putitive phosphate transport regulator  24 
 
 
211 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  19.78 
 
 
208 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  19.78 
 
 
208 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  19.78 
 
 
208 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  19.08 
 
 
390 aa  42.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3016  hypothetical protein  23.89 
 
 
215 aa  43.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.25831  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3836  hypothetical protein  21.47 
 
 
206 aa  42  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.103602  hitchhiker  0.0000000000851308 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1377  hypothetical protein  21.47 
 
 
206 aa  42  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000152766  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  19.23 
 
 
208 aa  42  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  20.61 
 
 
206 aa  42  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  26.34 
 
 
205 aa  41.6  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>