83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0351 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0351  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  456  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5953  hypothetical protein  81.33 
 
 		 225 aa  381  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68800  hypothetical protein  81.78 
 
 		 225 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3843  hypothetical protein  56.89 
 
 		 226 aa  278  5e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000724256  hitchhiker  0.0000000283379 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0717  hypothetical protein  56.89 
 
 		 226 aa  276  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000253337  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0618  hypothetical protein  57.33 
 
 		 226 aa  275  5e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.357102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3487  hypothetical protein  56.44 
 
 		 226 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126131  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3638  hypothetical protein  56.89 
 
 		 226 aa  268  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1465  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00863  hypothetical protein  55.11 
 
 		 228 aa  266  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2673  hypothetical protein  54.22 
 
 		 226 aa  265  4e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0692  hypothetical protein  54.67 
 
 		 226 aa  261  6e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130211  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0565  hypothetical protein  54.22 
 
 		 226 aa  259  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3455  hypothetical protein  54.22 
 
 		 226 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000227297  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0907  protein of unknown function DUF47  54.22 
 
 		 226 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000556938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0883  hypothetical protein  54.22 
 
 		 226 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0917  hypothetical protein  54.22 
 
 		 226 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00343614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3096  hypothetical protein  53.78 
 
 		 226 aa  257  8e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000106475  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3770  hypothetical protein  54.22 
 
 		 226 aa  257  8e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2019  hypothetical protein  52.44 
 
 		 228 aa  253  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582127  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0822  hypothetical protein  53.33 
 
 		 226 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000109083  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0853  hypothetical protein  53.33 
 
 		 226 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000459273  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3119  hypothetical protein  53.33 
 
 		 226 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000717729  normal  0.542025 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0634  hypothetical protein  52.75 
 
 		 223 aa  252  3e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0618  hypothetical protein  52.29 
 
 		 223 aa  252  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2681  hypothetical protein  51.56 
 
 		 226 aa  252  4.0000000000000004e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0612362  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3320  hypothetical protein  50.45 
 
 		 225 aa  246  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1190  phosphate transport regulator  51.11 
 
 		 226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.967179  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0181  hypothetical protein  50.67 
 
 		 226 aa  241  5e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0138  putative pit accessory protein  52.29 
 
 		 238 aa  241  7.999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0711  hypothetical protein  52.7 
 
 		 226 aa  240  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2188  hypothetical protein  52.05 
 
 		 226 aa  240  1e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.839701  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2827  hypothetical protein  52.27 
 
 		 224 aa  238  5e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2470  hypothetical protein  53.54 
 
 		 226 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0141  Putitive phosphate transport regulator  51.34 
 
 		 226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.572504  normal  0.330321 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004528  phosphate transport regulator  56.7 
 
 		 195 aa  229  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.327148  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1052  hypothetical protein  48.18 
 
 		 224 aa  214  7e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170442  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0228  hypothetical protein  45.74 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.775061  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0063  hypothetical protein  33.49 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1146  Putitive phosphate transport regulator  27.03 
 
 		 227 aa  111  8.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.266401  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2044  hypothetical protein  27.8 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000405279  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3224  hypothetical protein  28.38 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0013  hypothetical protein  28.5 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0013  hypothetical protein  28.5 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0788  hypothetical protein  23.64 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1625  hypothetical protein  24.88 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.109704  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1332  hypothetical protein  24.77 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0688  hypothetical protein  22.58 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000115743  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0285  hypothetical protein  23.5 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0664  hypothetical protein  21.43 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000019589  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1923  hypothetical protein  24.09 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00116502  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0493  hypothetical protein  22.22 
 
 		 224 aa  52  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000213235  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1747  hypothetical protein  24.78 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1509  hypothetical protein  24.48 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0044058  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3001  hypothetical protein  25.44 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000863551  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3884  hypothetical protein  26.4 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3836  hypothetical protein  24.48 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.103602  hitchhiker  0.0000000000851308 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1377  hypothetical protein  24.48 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000152766  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  25.82 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3780  phosphate transport regulator-like  25 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  23.84 
 
 		 390 aa  46.2  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1615  hypothetical protein  23.96 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000502331  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1577  hypothetical protein  23.96 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000193859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1335  hypothetical protein  23.96 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652491  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3394  hypothetical protein  23.03 
 
 		 214 aa  45.8  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0036  Putitive phosphate transport regulator  20.19 
 
 		 218 aa  45.4  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1179  hypothetical protein  21.88 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000750489  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  24.19 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1472  hypothetical protein  23.96 
 
 		 206 aa  45.4  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121556  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1362  hypothetical protein  23.96 
 
 		 206 aa  45.4  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000180581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1546  hypothetical protein  23.96 
 
 		 206 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000312847 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1336  hypothetical protein  23.96 
 
 		 206 aa  45.4  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0728144  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  31.32 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  21.28 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  31.84 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  26.11 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  26.11 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  29.41 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3162  hypothetical protein  22.86 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3760  putative low-affinity phosphate transport accessory protein  20.93 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  25.14 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  24.88 
 
 		 205 aa  42  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04040  phosphate transport regulator related to PhoU  22.75 
 
 		 209 aa  42  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.679526 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  29.61 
 
 		 211 aa  41.6  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>