47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0688 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0688  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000115743  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0664  hypothetical protein  93.24 
 
 		 222 aa  414  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000019589  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1923  hypothetical protein  38.01 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00116502  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0493  hypothetical protein  36.28 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000213235  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1146  Putitive phosphate transport regulator  28.32 
 
 		 227 aa  95.9  5e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.266401  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0618  hypothetical protein  27.54 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.357102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0228  hypothetical protein  29.17 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.775061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0717  hypothetical protein  25.75 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000253337  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3843  hypothetical protein  26.35 
 
 		 226 aa  72  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000724256  hitchhiker  0.0000000283379 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2827  hypothetical protein  26.13 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0692  hypothetical protein  26.79 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130211  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2019  hypothetical protein  25 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582127  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2681  hypothetical protein  23.84 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0612362  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2470  hypothetical protein  23.98 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0565  hypothetical protein  24.4 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004528  phosphate transport regulator  24.42 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.327148  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00863  hypothetical protein  24.42 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3320  hypothetical protein  25.41 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0822  hypothetical protein  24.74 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000109083  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3487  hypothetical protein  25.57 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126131  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0853  hypothetical protein  24.74 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000459273  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3119  hypothetical protein  24.74 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000717729  normal  0.542025 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0618  hypothetical protein  24.71 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2673  hypothetical protein  25.15 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3096  hypothetical protein  24.74 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000106475  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0634  hypothetical protein  24.12 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0351  hypothetical protein  22.58 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3770  hypothetical protein  23.71 
 
 		 226 aa  62  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1190  phosphate transport regulator  25 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.967179  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0883  hypothetical protein  23.47 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0907  protein of unknown function DUF47  23.47 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000556938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3455  hypothetical protein  23.47 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000227297  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0917  hypothetical protein  23.47 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00343614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5953  hypothetical protein  22.22 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0181  hypothetical protein  23.17 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68800  hypothetical protein  21.64 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3638  hypothetical protein  25 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1465  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0141  Putitive phosphate transport regulator  22.87 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.572504  normal  0.330321 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0711  hypothetical protein  25 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1052  hypothetical protein  21.97 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170442  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2188  hypothetical protein  22.22 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.839701  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2044  hypothetical protein  24.88 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000405279  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0138  putative pit accessory protein  22.02 
 
 		 238 aa  52  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3224  hypothetical protein  20.69 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0788  hypothetical protein  28.57 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0716  hypothetical protein  21.17 
 
 		 214 aa  42.7  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5203  protein of unknown function DUF47  25 
 
 		 213 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177281 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>