13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0369 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_0369  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  450  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000496164  unclonable  0.0000000000477389 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3884  hypothetical protein  70.72 
 
 
222 aa  324  7e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0788  hypothetical protein  30.25 
 
 
212 aa  89  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0013  hypothetical protein  28.64 
 
 
213 aa  85.1  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0013  hypothetical protein  28.64 
 
 
213 aa  85.1  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1625  hypothetical protein  29.86 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.109704  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0285  hypothetical protein  28.91 
 
 
217 aa  79  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1332  hypothetical protein  27.33 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2827  hypothetical protein  25 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245918  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2673  hypothetical protein  24.1 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3320  hypothetical protein  26.9 
 
 
225 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0692  hypothetical protein  24.69 
 
 
226 aa  43.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130211  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68800  hypothetical protein  23.03 
 
 
225 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>