More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0429 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 122 aa  246  1e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  54.39 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  54.1 
 
 		 122 aa  124  6e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  53.26 
 
 		 130 aa  97.1  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  38.21 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0073  GntR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 127 aa  88.2  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138424  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  42.61 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  38.02 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  38.02 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0664  GntR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  37.19 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  35.77 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1357  regulatory protein GntR, HTH  41.18 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  37.19 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  36.67 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 321 aa  80.9  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  37.8 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  50.68 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  38.02 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3017  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11827  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  38.39 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  38.98 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1390  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000697536  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  38.14 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  42.57 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 126 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 126 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 126 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 126 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  38.39 
 
 		 126 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  38.39 
 
 		 126 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  31.53 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  31.2 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  38.39 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0430  transcriptional regulator, GntR family  37.72 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0960  transcriptional regulator, GntR family  42.57 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  39.32 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  37.07 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  34.68 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  39.32 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  39.09 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  39.32 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  39.09 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0938  GntR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  39.32 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  39.32 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  39.32 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  34.71 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  45 
 
 		 321 aa  73.6  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0374  GntR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0541  regulatory protein GntR HTH  35.04 
 
 		 125 aa  73.6  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000336324  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  42.5 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1998  transcriptional regulator, GntR family  39.8 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  45.1 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  45 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  35.04 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  31.93 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 496 aa  70.1  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1108  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0952489  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2572  transcriptional regulator, GntR family  43.9 
 
 		 120 aa  70.1  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  30.17 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0225  transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3903  GntR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000301963  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  30.43 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0882  transcriptional regulator, GntR family  28.69 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.905481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  35.45 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3873  GntR family transcriptional regulator  44 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3464  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>