More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0199 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0199  thioredoxin reductase  100 
 
 
315 aa  655    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1354  thioredoxin reductase  75.24 
 
 
313 aa  482  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  68.05 
 
 
315 aa  430  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  63.67 
 
 
322 aa  414  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  64.13 
 
 
326 aa  410  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  64.19 
 
 
320 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  63.11 
 
 
314 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  63.41 
 
 
323 aa  402  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7121  thioredoxin reductase  61.29 
 
 
327 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1134  thioredoxin reductase  58.12 
 
 
313 aa  370  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.788555 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0015  thioredoxin reductase  57.83 
 
 
315 aa  367  1e-100  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  53.55 
 
 
319 aa  340  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  52.13 
 
 
334 aa  333  3e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  51.49 
 
 
314 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  51.49 
 
 
314 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  51.58 
 
 
335 aa  325  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  57.19 
 
 
325 aa  325  7e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  50.66 
 
 
331 aa  325  9e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  50.48 
 
 
311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  49.84 
 
 
331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  51.31 
 
 
317 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  50 
 
 
323 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  53.77 
 
 
319 aa  319  3.9999999999999996e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  50 
 
 
323 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  50.17 
 
 
311 aa  318  5e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  50.64 
 
 
336 aa  319  5e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  51.12 
 
 
311 aa  318  5e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  51.31 
 
 
312 aa  318  5e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  52.15 
 
 
314 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  50.94 
 
 
314 aa  314  9.999999999999999e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  50.65 
 
 
314 aa  314  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2762  thioredoxin-disulfide reductase  52.83 
 
 
315 aa  313  1.9999999999999998e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117857  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  51.94 
 
 
460 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  49.84 
 
 
313 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1762  thioredoxin reductase  51.75 
 
 
317 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.422622  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  48.73 
 
 
330 aa  311  9e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  50 
 
 
333 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  50 
 
 
333 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  51.74 
 
 
314 aa  310  2e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  50 
 
 
333 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59792  Thioredoxin reductase  48.26 
 
 
319 aa  309  4e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  50.33 
 
 
314 aa  309  5e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  48.51 
 
 
311 aa  308  9e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5364  thioredoxin reductase  51.71 
 
 
337 aa  307  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2721  thioredoxin reductase  51.72 
 
 
317 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  50.94 
 
 
316 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01640  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding protein  53.09 
 
 
310 aa  306  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00689976  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3383  thioredoxin reductase  51.72 
 
 
317 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.281365 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  48.22 
 
 
331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4671  thioredoxin reductase 2  50.62 
 
 
316 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2370  thioredoxin reductase  50.8 
 
 
316 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  52.81 
 
 
319 aa  306  3e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2342  thioredoxin reductase oxidoreductase protein  51.27 
 
 
318 aa  306  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  51.74 
 
 
318 aa  306  3e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  50.96 
 
 
316 aa  306  3e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  49.17 
 
 
311 aa  306  3e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  50.32 
 
 
456 aa  306  3e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  48.51 
 
 
311 aa  306  3e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  47 
 
 
332 aa  306  3e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2153  thioredoxin reductase  51.54 
 
 
318 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.969122  normal  0.900366 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  49.52 
 
 
324 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  50.96 
 
 
316 aa  305  6e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  49.51 
 
 
332 aa  305  6e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3442  thioredoxin reductase  52.26 
 
 
333 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  52.52 
 
 
319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  46.56 
 
 
320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2991  thioredoxin-disulfide reductase  52.2 
 
 
320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  51.91 
 
 
320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2123  thioredoxin-disulfide reductase  52.2 
 
 
320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  51.57 
 
 
320 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2601  thioredoxin reductase  51.75 
 
 
321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3078  thioredoxin-disulfide reductase  52.2 
 
 
320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1991  thioredoxin-disulfide reductase  52.2 
 
 
320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3045  thioredoxin-disulfide reductase  52.2 
 
 
320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  46.96 
 
 
330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  51.91 
 
 
320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  51.91 
 
 
320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0789  thioredoxin-disulfide reductase  52.2 
 
 
320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  51.9 
 
 
346 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  48.84 
 
 
311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2621  thioredoxin-disulfide reductase  52.2 
 
 
320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105399  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0820  thioredoxin reductase  51.91 
 
 
320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  51.57 
 
 
320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  49.37 
 
 
345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  46.89 
 
 
335 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  46.93 
 
 
361 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  51.9 
 
 
320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2557  thioredoxin reductase  51.23 
 
 
318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  51.57 
 
 
320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  51.57 
 
 
320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  47.88 
 
 
310 aa  302  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  49.19 
 
 
324 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  49.21 
 
 
325 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  47.48 
 
 
324 aa  302  4.0000000000000003e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  49.67 
 
 
321 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  48.69 
 
 
310 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1119  thioredoxin reductase  51.61 
 
 
316 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.202817  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0634  thioredoxin reductase  51.92 
 
 
333 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  51.89 
 
 
320 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1178  thioredoxin reductase  51.57 
 
 
320 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>