157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3092 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3092  cytochrome c assembly protein  100 
 
 
288 aa  580  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000526591  normal  0.131985 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02500  predicted inner membrane protein  85.07 
 
 
288 aa  481  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.048331  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1063  cytochrome c assembly protein  85.07 
 
 
288 aa  481  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000502411  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2763  putative cytochrome C assembly protein  85.07 
 
 
288 aa  481  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0166622  normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02464  hypothetical protein  85.07 
 
 
288 aa  481  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0370315  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3000  putative cytochrome C assembly protein  85.07 
 
 
288 aa  481  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000509297  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1072  cytochrome c assembly protein  85.07 
 
 
288 aa  481  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00835827  normal  0.0177644 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3850  putative cytochrome C assembly protein  85.07 
 
 
288 aa  481  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000010196  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2770  putative cytochrome C assembly protein  85.07 
 
 
288 aa  481  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000534415  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2895  putative cytochrome C assembly protein  85.07 
 
 
288 aa  481  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297657  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0850  cytochrome c assembly protein  74.62 
 
 
284 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00175266  hitchhiker  0.0000187767 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3205  cytochrome c assembly protein  72.08 
 
 
264 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00378275  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1122  cytochrome c assembly protein  71.32 
 
 
264 aa  366  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0765442  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3366  cytochrome c assembly protein  71.92 
 
 
263 aa  357  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0757452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0885  hypothetical protein  71.92 
 
 
263 aa  357  9.999999999999999e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.215466  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3231  putative cytochrome C assembly protein  71.92 
 
 
263 aa  357  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00112943  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2862  cytochrome c assembly protein  67.8 
 
 
264 aa  347  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0989  cytochrome c assembly protein  69.06 
 
 
264 aa  332  3e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00443363  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002534  CcsA-related protein  53.28 
 
 
264 aa  275  5e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03482  hypothetical protein  53.28 
 
 
264 aa  258  6e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0093  hypothetical protein  49.42 
 
 
267 aa  245  8e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0647  inner membrane protein, putative cytochrome c assembly protein  48.65 
 
 
264 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.650824  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2922  cytochrome c assembly protein  38.93 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1157  cytochrome c assembly protein  40.08 
 
 
262 aa  198  7e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000603609  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3369  cytochrome c assembly protein  40.68 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1047  cytochrome c assembly protein  40.84 
 
 
262 aa  193  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00493417  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1252  cytochrome c assembly protein  41.22 
 
 
262 aa  192  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000544074  hitchhiker  0.00000156209 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1428  permease  42.11 
 
 
265 aa  189  5e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1166  cytochrome c assembly protein  39.31 
 
 
262 aa  186  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00369516  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2756  cytochrome c assembly protein  38.17 
 
 
262 aa  185  6e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000043762  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0887  hypothetical protein  39.31 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.8995  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3019  cytochrome c assembly protein  38.93 
 
 
262 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000524804  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3105  cytochrome c assembly protein  38.55 
 
 
262 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000197765  normal  0.104427 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1208  cytochrome c assembly protein  38.55 
 
 
262 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214986  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1252  cytochrome c assembly protein  38.55 
 
 
262 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1285  cytochrome c assembly protein  38.55 
 
 
262 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000446299  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2840  cytochrome c assembly protein  38.55 
 
 
262 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000354809  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2922  cytochrome c assembly protein  38.55 
 
 
262 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.140112  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1355  hypothetical protein  38.93 
 
 
262 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1669  cytochrome c assembly protein  37.07 
 
 
262 aa  178  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1061  cytochrome c assembly protein  39.31 
 
 
262 aa  175  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000186655  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01689  cytochrome c assembly protein  37.24 
 
 
265 aa  170  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000413644  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4075  cytochrome C assembly family protein  37.13 
 
 
265 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186491  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1017  cytochrome c assembly protein  30.21 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  0.587271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4159  cytochrome c assembly protein  30.86 
 
 
269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.25819  normal  0.436154 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1065  cytochrome c assembly protein  32.66 
 
 
269 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4261  cytochrome c assembly protein  30.86 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.99902  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1460  cytochrome c assembly protein  30.29 
 
 
283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.164878 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1371  hypothetical protein  31.46 
 
 
266 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1280  cytochrome c assembly protein  32.77 
 
 
284 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0445  cytochrome c assembly protein  33 
 
 
289 aa  105  9e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1471  hypothetical protein  32.77 
 
 
270 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3403  cytochrome c assembly protein  31.3 
 
 
266 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.887838  normal  0.688779 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0672  cytochrome c assembly protein  28.31 
 
 
269 aa  102  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2262  cytochrome c assembly protein  30.29 
 
 
282 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15940  hypothetical protein  32.75 
 
 
266 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.182655  normal  0.371616 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0843  cytochrome c assembly protein  38.3 
 
 
269 aa  99.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2312  cytochrome c assembly protein  31.56 
 
 
268 aa  99  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3772  cytochrome c assembly protein  29.15 
 
 
255 aa  99  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0034021  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1939  cytochrome c assembly protein  33.49 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.664487 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0997  cytochrome c assembly protein  26.27 
 
 
269 aa  93.2  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1201  metal dependent phosphohydrolase  33 
 
 
261 aa  90.1  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2133  cytochrome c assembly protein  34.03 
 
 
275 aa  88.2  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.324766  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39590  Cytochrome c assembly-like protein  34.39 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.208055  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0641  cytochrome c assembly protein  29.65 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1177  cytochrome c assembly protein  31.11 
 
 
276 aa  87.8  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.262716  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0521  cytochrome c assembly protein  32.03 
 
 
269 aa  87  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312653  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1337  hypothetical protein  34.07 
 
 
273 aa  86.7  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0591  cytochrome c assembly protein  29 
 
 
263 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0046  cytochrome c assembly protein  34.33 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.975637  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0127  cytochrome c assembly protein  34.33 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.496419  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0144  hypothetical protein  34.33 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.772264  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0056  hypothetical protein  34.33 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.046398  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3018  cytochrome c assembly protein  35.95 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00647598  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1149  cytochrome c assembly protein  37.96 
 
 
264 aa  82  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0961  cytochrome c assembly protein  29.77 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3343  cytochrome c assembly protein  31.48 
 
 
267 aa  75.5  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2937  cytochrome c assembly protein  31.76 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.390266  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3627  cytochrome c assembly protein  31.76 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.470506  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2372  transmembrane protein  31.21 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.34584 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1708  hypothetical protein  27.78 
 
 
268 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.61279  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1986  cytochrome c assembly protein  26.99 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0425  cytochrome c assembly protein  32.45 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2671  cytochrome c assembly protein  35.82 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000343586  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3093  cytochrome c assembly protein  26.97 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349808  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0560  cytochrome C assembly protein  29.45 
 
 
178 aa  68.6  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000010432  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3219  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  29.36 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1623  cytochrome c assembly protein family  29.45 
 
 
182 aa  68.9  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0256537  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0377  cytochrome c assembly protein  30 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.015203 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0220  cytochrome c assembly protein  28.4 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.141329  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0202  cytochrome c assembly protein  28.1 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.848267  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  27.63 
 
 
271 aa  62.4  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1506  cytochrome c assembly protein  29.03 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1501  cytochrome c assembly protein  28.95 
 
 
224 aa  61.2  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02262  putative cytochrome C assembly protein  28.9 
 
 
263 aa  60.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2946  cytochrome c assembly protein  25.38 
 
 
315 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3378  cytochrome c assembly protein  27.64 
 
 
268 aa  58.9  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00167911  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  24.07 
 
 
271 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1150  cytochrome C assembly family protein  27.66 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  27.6 
 
 
271 aa  57  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>