More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2936 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2936  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
311 aa  628  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00477843  normal  0.111677 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2683  OsmT protein  80.46 
 
 
308 aa  498  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.567691  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2617  OsmT protein  80.46 
 
 
308 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2568  OsmT protein  80.46 
 
 
308 aa  498  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0008695  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2789  OsmT protein  80.46 
 
 
308 aa  498  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2659  OsmT protein  80.13 
 
 
308 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2563  LysR family transcriptional regulator  81.37 
 
 
308 aa  478  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00385912  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3638  transcriptional regulator, LysR family  81.37 
 
 
308 aa  478  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.59787e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2694  LysR family transcriptional regulator  81.05 
 
 
308 aa  475  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  2.01069e-12  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1253  transcriptional regulator, LysR family  81.05 
 
 
308 aa  475  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0013481  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2773  transcriptional regulator, LysR family  81.05 
 
 
308 aa  475  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.07011e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1270  LysR family transcriptional regulator  80.72 
 
 
308 aa  474  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  1.0142e-07  hitchhiker  0.000508597 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02269  hypothetical protein  80.72 
 
 
308 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  6.58143e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2543  LysR family transcriptional regulator  80.72 
 
 
308 aa  474  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.81621e-13  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02308  predicted DNA-binding transcriptional regulator  80.72 
 
 
308 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  8.41101e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3441  LysR family transcriptional regulator  68.51 
 
 
306 aa  400  1e-110  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.985803  hitchhiker  0.000545962 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1376  LysR family transcriptional regulator  51.49 
 
 
300 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.809674  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1416  LysR family transcriptional regulator  51.49 
 
 
300 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.691659 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1761  LysR family transcriptional regulator  52.76 
 
 
300 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.982692  normal  0.0243449 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2569  LysR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
300 aa  293  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0243965  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2826  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 
300 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1626  transcriptional regulator, LysR family  50.34 
 
 
300 aa  286  3e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0614386 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4635  LysR family transcriptional regulator  52.15 
 
 
300 aa  286  3e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.646338  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1470  LysR family transcriptional regulator  52.15 
 
 
300 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0586  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  49.84 
 
 
304 aa  284  1e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0528  LysR family transcriptional regulator  52.07 
 
 
301 aa  282  5e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  4.54001e-05 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1757  LysR family transcriptional regulator  51.16 
 
 
300 aa  282  6e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233098  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1910  OsmT protein  51.16 
 
 
300 aa  282  6e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0986  LysR family transcriptional regulator  51.16 
 
 
300 aa  282  6e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1735  LysR family transcriptional regulator  51.16 
 
 
300 aa  282  6e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0864805  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0180  LysR family transcriptional regulator  51.16 
 
 
300 aa  282  6e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  9.07778e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1013  LysR family transcriptional regulator  51.82 
 
 
300 aa  282  6e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1512  LysR family transcriptional regulator  51.16 
 
 
300 aa  282  6e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1494  LysR family transcriptional regulator  51.82 
 
 
300 aa  282  6e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1067  LysR family transcriptional regulator  51.16 
 
 
300 aa  282  6e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1735  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 
300 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26615  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2504  transcriptional regulator, LysR family  46.08 
 
 
298 aa  274  2e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3178  LysR family transcriptional regulator  48.53 
 
 
305 aa  268  7e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.0310919 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2537  transcription regulator transcription regulator protein  51.19 
 
 
297 aa  266  3e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2812  transcriptional regulator, LysR family  49.83 
 
 
297 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.260123  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2406  transcriptional regulator, LysR family  49.83 
 
 
298 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237707  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4367  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
309 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.764337  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4655  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 
310 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0129573  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2261  LysR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
327 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015207  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6026  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 
323 aa  178  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.306271 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3479  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
306 aa  173  3e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35259  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02400  transcriptional regulator  34.02 
 
 
300 aa  172  5e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
297 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
297 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4699  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
340 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.254912  normal  0.0113206 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
297 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0298  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
313 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.202952 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2421  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
312 aa  170  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.324279 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3164  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
297 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  37.9 
 
 
305 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3165  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.93 
 
 
302 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4412  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 
300 aa  163  4e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.481295  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1268  putative HTH-type transcriptional regulator YbhD  36.04 
 
 
297 aa  162  5e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
305 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
305 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3334  transcriptional regulator, LysR family  30.93 
 
 
302 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2894  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
317 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0369741  normal  0.204254 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0871  transcriptional regulator, LysR family  31.72 
 
 
317 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2874  transcriptional regulator, LysR family  32.86 
 
 
317 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.30864e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2590  transcriptional regulator, LysR family  31.72 
 
 
317 aa  161  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0822  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
317 aa  161  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.835428  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0791  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 
317 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5879  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
299 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.927972  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5523  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 
322 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.553864 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
305 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0795  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 
317 aa  159  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6260  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
307 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6427  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
307 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6662  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
307 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3181  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 
299 aa  154  3e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4552  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
307 aa  152  6e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1913  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
298 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0283777  normal  0.375382 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
307 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4982  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 
307 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.960154 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0545  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 
305 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5626  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 
316 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0807108 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6374  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
313 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.436439 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0532  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 
305 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5397  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.13 
 
 
297 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3073  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 
304 aa  145  7e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5504  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 
300 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3294  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
294 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.438685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5255  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 
295 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294771  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3338  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 
295 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714315  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5029  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 
295 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.534863  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3512  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
304 aa  142  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.069263  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6009  LysR family transcriptional regulator  35.08 
 
 
322 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.853275 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2001  transcriptional regulator, LysR family  31.36 
 
 
298 aa  142  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.536649 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4958  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
295 aa  140  2e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.468232 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4438  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
295 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000948245 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4012  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
298 aa  139  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5612  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
294 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0884  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 
298 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1366  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 
298 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
298 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.391554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>