More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0060 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03508  tRNA (Guanosine-2'-O-)-methyltransferase  100 
 
 
229 aa  477  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3862  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  100 
 
 
229 aa  477  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0060  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  100 
 
 
229 aa  477  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232977 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03460  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  477  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5023  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  100 
 
 
229 aa  477  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0054  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  100 
 
 
229 aa  477  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4102  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  99.56 
 
 
229 aa  474  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4154  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  99.56 
 
 
229 aa  476  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3986  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  99.56 
 
 
229 aa  475  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4130  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  96.51 
 
 
229 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3960  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  96.51 
 
 
229 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3951  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  96.07 
 
 
229 aa  459  1e-128  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.339816  normal  0.0254174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4023  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  96.07 
 
 
229 aa  459  1e-128  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4069  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  96.07 
 
 
229 aa  459  1e-128  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351215  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0088  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  88.21 
 
 
229 aa  424  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0042  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  82.82 
 
 
230 aa  395  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0038  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  82.82 
 
 
230 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4870  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  82.38 
 
 
231 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0115429 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4495  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  79.82 
 
 
230 aa  384  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4212  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  79.39 
 
 
230 aa  384  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4148  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  80.62 
 
 
230 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3951  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  78.85 
 
 
230 aa  374  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.545722  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4179  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  82.87 
 
 
219 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00626  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  64.6 
 
 
227 aa  313  1e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001865  tRNA (Guanosine18-2'-O-)-methyltransferase  63.88 
 
 
227 aa  307  7e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3496  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  60.53 
 
 
234 aa  294  6e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  3.29165e-05 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0351  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  59.47 
 
 
250 aa  290  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00157  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  62.39 
 
 
235 aa  290  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3501  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  56.83 
 
 
234 aa  280  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0262  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  56.58 
 
 
241 aa  279  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.132081  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4975  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  56.64 
 
 
235 aa  279  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0332  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  57.71 
 
 
231 aa  276  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.124649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4585  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  56.83 
 
 
231 aa  275  6e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0102229  unclonable  2.88798e-08 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3881  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  56.83 
 
 
228 aa  273  2e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0312373  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3115  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  54.19 
 
 
233 aa  261  6e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.749527  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2942  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  53.74 
 
 
233 aa  257  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2234  tRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  53.24 
 
 
216 aa  221  9e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0074  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  50.89 
 
 
228 aa  218  5e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1198  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  51.96 
 
 
224 aa  216  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0536  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  48.84 
 
 
220 aa  210  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.0365793 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2737  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  47.3 
 
 
244 aa  206  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0929  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  46.98 
 
 
216 aa  206  3e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04831  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.07 
 
 
224 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04731  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.58 
 
 
223 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0125765  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1213  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  48.37 
 
 
216 aa  199  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0817  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  46.26 
 
 
219 aa  199  3e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1255  tRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  48.84 
 
 
219 aa  199  4e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.87838  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0197  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  53.51 
 
 
210 aa  198  5e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04421  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.12 
 
 
223 aa  196  2e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.961343  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04211  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.48 
 
 
229 aa  196  2e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0802  tRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  46.48 
 
 
229 aa  196  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.681579  hitchhiker  0.00885649 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2003  tRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  44.69 
 
 
224 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0418  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.52 
 
 
223 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20701  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.51 
 
 
229 aa  192  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.355106 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1577  tRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  46.01 
 
 
229 aa  191  6e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1756  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.66 
 
 
229 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04781  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.72 
 
 
229 aa  188  7e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.4365  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1727  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  47.55 
 
 
212 aa  187  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2876  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  47.62 
 
 
201 aa  163  2e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0312  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  47.06 
 
 
212 aa  162  5e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0597  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  46.43 
 
 
250 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00512531  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0906  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  40.98 
 
 
196 aa  144  9e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  2.38079e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1484  tRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  43.45 
 
 
196 aa  142  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  5.4837e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2170  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  45.56 
 
 
202 aa  142  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1972  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.08 
 
 
197 aa  135  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0293079 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3524  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.88 
 
 
247 aa  131  7e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3388  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.02 
 
 
237 aa  128  9e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11883  spoU protein (spoU)  36.08 
 
 
238 aa  119  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4325  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.32 
 
 
239 aa  118  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.282082 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3141  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  41.48 
 
 
187 aa  117  1e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4332  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.23 
 
 
225 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4310  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.7 
 
 
225 aa  113  2e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4179  tRNA/rRNA methyltransferase, SpoU  37.5 
 
 
225 aa  113  2e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0240712  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2160  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.99 
 
 
256 aa  109  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1528  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.91 
 
 
220 aa  105  5e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.16942  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5009  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.24 
 
 
220 aa  104  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0053  tRNA/rRNA methyltransferase  32.04 
 
 
218 aa  104  1e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4434  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.73 
 
 
231 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.18455  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2638  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.93 
 
 
259 aa  102  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1800  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.81 
 
 
265 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2249  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.49 
 
 
234 aa  98.6  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1616  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.91 
 
 
248 aa  95.5  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.439996 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3173  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.77 
 
 
261 aa  94  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0121288  normal  0.209756 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0092  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.53 
 
 
245 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  6.07271e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2661  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.91 
 
 
256 aa  92.8  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf131  SpoU class tRNA/rRNA methyltransferase  28.03 
 
 
229 aa  92  6e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01710  rRNA methylase  36.97 
 
 
271 aa  91.3  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.43805 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.53 
 
 
246 aa  89.7  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0590  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.67 
 
 
247 aa  90.1  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0629521 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0572  RNA methyltransferase  35.29 
 
 
252 aa  89.7  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2224  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.93 
 
 
262 aa  88.6  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0414  rRNA methylase  36.99 
 
 
294 aa  87.8  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1903  RNA methyltransferase  37.42 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0247051 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.82 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5165  predicted protein  32.32 
 
 
216 aa  87  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0398587 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_5166  predicted protein  32.32 
 
 
216 aa  87  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000100906  normal  0.0342071 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1199  tRNA/rRNA methyltransferase  32.95 
 
 
234 aa  87.4  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354486  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5040  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34 
 
 
260 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0086  RNA methyltransferase  30.82 
 
 
247 aa  86.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0091  RNA methyltransferase  30.19 
 
 
247 aa  85.9  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  2.27809e-07  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>