More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0057 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4073  uracil-xanthine permease  95.24 
 
 
463 aa  877  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.853642 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4158  xanthine permease  100 
 
 
463 aa  915  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4214  uracil-xanthine permease  87.53 
 
 
462 aa  765  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0073  uracil-xanthine permease  92.89 
 
 
464 aa  857  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.134664  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4105  xanthine permease  99.78 
 
 
463 aa  914  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5027  xanthine permease  100 
 
 
463 aa  915  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4873  uracil-xanthine permease  85.78 
 
 
466 aa  776  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0034  xanthine permease  84.42 
 
 
461 aa  785  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.830973  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3989  xanthine permease  99.78 
 
 
463 aa  913  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0057  uracil-xanthine permease  100 
 
 
463 aa  915  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0676705 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4182  uracil-xanthine permease  84.2 
 
 
472 aa  780  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4497  uracil-xanthine permease  87.53 
 
 
462 aa  764  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0039  xanthine permease  83.77 
 
 
461 aa  776  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3865  xanthine permease  100 
 
 
463 aa  915  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4133  uracil-xanthine permease  95.24 
 
 
463 aa  877  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.297531  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03464  hypothetical protein  100 
 
 
463 aa  915  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.514946  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03512  predicted transporter  100 
 
 
463 aa  915  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.508451  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4027  uracil-xanthine permease  95.24 
 
 
463 aa  877  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0051  uracil-xanthine permease  100 
 
 
463 aa  915  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4150  uracil-xanthine permease  88.34 
 
 
462 aa  786  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3954  uracil-xanthine permease  95.24 
 
 
463 aa  877  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3953  uracil-xanthine permease  87.69 
 
 
462 aa  806  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3964  uracil-xanthine permease  95.24 
 
 
463 aa  877  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2284  xanthine/uracil permease family protein  67.26 
 
 
466 aa  621  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001868  xanthine/uracil permease family protein  65.62 
 
 
462 aa  612  1e-174  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00623  hypothetical protein  67.12 
 
 
463 aa  604  1e-172  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0538  purine/xanthine transport protein  66.22 
 
 
453 aa  585  1e-166  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2088  xanthine/uracil transporter  54.8 
 
 
462 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.365471  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1007  xanthine/uracil permease family protein subfamily  55.2 
 
 
462 aa  482  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3408  uracil-xanthine permease  54.97 
 
 
462 aa  481  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  0.0616677 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3521  xanthine permease  54.13 
 
 
462 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.964115  normal  0.563042 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3915  xanthine permease  55.18 
 
 
462 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.53056 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04610  putative transporter  55.8 
 
 
461 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4364  uracil-xanthine permease  54.13 
 
 
462 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4002  uracil-xanthine permease  54.13 
 
 
462 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0445  putative transporter  55.8 
 
 
461 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0801  xanthine/uracil permease family protein  54.57 
 
 
462 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3396  xanthine permease  54.37 
 
 
459 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.559771 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0349  xanthine/uracil permease family protein  54.57 
 
 
462 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1066  xanthine/uracil permease family protein  54.57 
 
 
462 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1892  xanthine/uracil permease family protein  54.57 
 
 
462 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1222  xanthine permease  54.57 
 
 
462 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.622756  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1231  xanthine permease  54.57 
 
 
462 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3597  xanthine permease  53.93 
 
 
459 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.243938 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1841  uracil-xanthine permease  53.93 
 
 
459 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000895635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3992  xanthine/uracil permease family protein  53.71 
 
 
459 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1376  xanthine/uracil permease family protein  54.34 
 
 
509 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.108395  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4581  xanthine permease  54 
 
 
462 aa  469  1e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2762  uracil-xanthine permease  47.83 
 
 
500 aa  416  1e-115  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.648328  normal  0.727682 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3698  uracil-xanthine permease  47.56 
 
 
458 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2148  xanthine/uracil permease family protein  48.88 
 
 
445 aa  409  1e-113  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2223  uracil-xanthine permease  45.62 
 
 
486 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9529  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0772  xanthine/uracil permease family protein  47.44 
 
 
465 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0676  xanthine/uracil permease family protein  47.76 
 
 
465 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02070  putative transporter  46.07 
 
 
468 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2573  xanthine/uracil permease  44.82 
 
 
488 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.837533 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02501  xanthine/uracil permease family protein  46.26 
 
 
517 aa  387  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29700  Xanthine/uracil permease family  45.77 
 
 
434 aa  364  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440339  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1913  uracil-xanthine permease  42.38 
 
 
468 aa  360  2e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00677424  normal  0.0587093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0246  putative transporter  44.54 
 
 
468 aa  359  6e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1726  uracil-xanthine permease  41.48 
 
 
452 aa  355  1e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4172  xanthine/uracil permease family protein  45.15 
 
 
466 aa  349  5e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0810  uracil-xanthine permease  45.15 
 
 
466 aa  349  5e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3042  xanthine/uracil permease family protein  45.15 
 
 
466 aa  349  5e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0826  uracil-xanthine permease  45.15 
 
 
466 aa  349  5e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3208  xanthine/uracil permease family protein  45.15 
 
 
466 aa  349  5e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02715  predicted transporter  44.92 
 
 
466 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02677  hypothetical protein  44.92 
 
 
466 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92624  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3015  xanthine/uracil permease family protein  44.92 
 
 
466 aa  347  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1785  uracil-xanthine permease  43.94 
 
 
484 aa  342  1e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  34.44 
 
 
451 aa  264  3e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2522  xanthine permease  36.43 
 
 
449 aa  239  8e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0140814  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1592  xanthine permease  35.36 
 
 
438 aa  233  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  33.86 
 
 
452 aa  233  6e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0384  xanthine permease  33.94 
 
 
452 aa  233  7e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3202  uracil permease  34.84 
 
 
474 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324856  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3109  uracil-xanthine permease  33.92 
 
 
470 aa  231  3e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.74503  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3928  xanthine permease  36.1 
 
 
461 aa  228  3e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.570861  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3473  uracil-xanthine permease  33.71 
 
 
479 aa  223  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.179383  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2606  uracil-xanthine permease  32.96 
 
 
478 aa  223  5e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.03048  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  32.64 
 
 
825 aa  218  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3725  uracil-xanthine permease  36.2 
 
 
445 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  32 
 
 
489 aa  206  8e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  33.87 
 
 
505 aa  206  9e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0228  xanthine/uracil permease  32.3 
 
 
442 aa  205  1e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  5.15312e-08  decreased coverage  6.1863e-25 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4290  xanthine/uracil permease family protein  35.83 
 
 
451 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3854  xanthine permease  35.15 
 
 
451 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00662261  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0426  uracil-xanthine permease  29.42 
 
 
458 aa  204  4e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1578  uracil-xanthine permease  35.83 
 
 
451 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3616  xanthine permease  34.93 
 
 
451 aa  202  1e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267738  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  31.77 
 
 
468 aa  202  1e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2003  uracil-xanthine permease  32.44 
 
 
466 aa  201  2e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4637  xanthine permease  33.18 
 
 
505 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4505  uracil-xanthine permease  33.18 
 
 
505 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.552965  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2118  uracil-xanthine permease  31.94 
 
 
438 aa  200  4e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.398858  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1425  xanthine permease  31.79 
 
 
449 aa  200  5e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  4.66476e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1667  xanthine permease  28.44 
 
 
450 aa  199  7e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1668  uracil-xanthine permease  29.17 
 
 
465 aa  199  8e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4854  xanthine permease  32.81 
 
 
497 aa  199  8e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0536  xanthine/uracil permease  31.84 
 
 
448 aa  199  9e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>