More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2393 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02167  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase (anaerobic), large subunit, FAD/NAD(P)-binding  99.26 
 
 
542 aa  1095    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1418  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  99.26 
 
 
542 aa  1095    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.556923  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02126  hypothetical protein  99.26 
 
 
542 aa  1095    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2382  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  99.26 
 
 
542 aa  1095    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2512  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  92.44 
 
 
542 aa  1004    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0227  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  78.32 
 
 
551 aa  823    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0686  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  67.35 
 
 
547 aa  716    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2469  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  92.62 
 
 
542 aa  1008    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.357992 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0200  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  72.96 
 
 
547 aa  778    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207234  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2628  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  92.8 
 
 
542 aa  1008    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.710716  normal  0.455755 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3378  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  99.26 
 
 
542 aa  1095    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2623  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  99.26 
 
 
542 aa  1095    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2420  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  92.8 
 
 
542 aa  1008    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4148  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  71.97 
 
 
556 aa  786    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00376439  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0200  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  76.63 
 
 
547 aa  812    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0341607 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2393  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  100 
 
 
542 aa  1104    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0397  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  64.64 
 
 
560 aa  688    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3957  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  72.15 
 
 
556 aa  786    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2805  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  85.37 
 
 
542 aa  928    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.701913 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0248  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  72.52 
 
 
552 aa  773    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0402203  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0512  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  69.92 
 
 
562 aa  729    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000682192  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2539  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  99.26 
 
 
542 aa  1095    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2524  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  92.62 
 
 
542 aa  1006    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3991  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  77.54 
 
 
551 aa  812    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.172557  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1410  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  99.08 
 
 
542 aa  1092    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1021  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  54.82 
 
 
552 aa  592  1e-168  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3299  FAD dependent oxidoreductase  42.91 
 
 
559 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2622  FAD dependent oxidoreductase  42.64 
 
 
514 aa  416  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0001851  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2844  FAD dependent oxidoreductase  41.59 
 
 
533 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676215  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4111  FAD dependent oxidoreductase  42.97 
 
 
556 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0402229 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3499  FAD dependent oxidoreductase  42.51 
 
 
522 aa  391  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.426927 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1521  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  42.13 
 
 
535 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0946096  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1228  FAD dependent oxidoreductase  41.12 
 
 
516 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.677137  normal  0.683893 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0071  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  41.46 
 
 
556 aa  376  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2962  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  41.48 
 
 
556 aa  376  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0933  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  41.78 
 
 
556 aa  375  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0218972  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2516  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  42.42 
 
 
572 aa  372  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.191896 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2102  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  39.77 
 
 
512 aa  365  1e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.150536 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1438  FAD dependent oxidoreductase  40.15 
 
 
539 aa  365  1e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.198287  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1471  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  40.33 
 
 
585 aa  363  3e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.390324  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1123  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  40.92 
 
 
582 aa  349  9e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0332  FAD dependent oxidoreductase  40.34 
 
 
445 aa  296  7e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2572  FAD dependent oxidoreductase  45.13 
 
 
407 aa  289  7e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.22049 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1127  FAD dependent oxidoreductase  43.48 
 
 
384 aa  288  2e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46832  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1177  FAD dependent oxidoreductase  41.88 
 
 
435 aa  286  7e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.624502 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1126  FAD dependent oxidoreductase  39.08 
 
 
392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3076  FAD dependent oxidoreductase  43.59 
 
 
408 aa  254  3e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0583  FAD dependent oxidoreductase  37.87 
 
 
389 aa  248  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.6721  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5204  FAD dependent oxidoreductase  41.63 
 
 
424 aa  244  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1799  FAD dependent oxidoreductase  35.69 
 
 
432 aa  244  3e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000252779  normal  0.373628 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0880  FAD dependent oxidoreductase  33.9 
 
 
486 aa  236  6e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1336  FAD dependent oxidoreductase  33.83 
 
 
545 aa  236  8e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2532  FAD dependent oxidoreductase  34.81 
 
 
545 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.941625  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1419  FAD dependent oxidoreductase  34.44 
 
 
545 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1317  FAD dependent oxidoreductase  34.07 
 
 
545 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  32.05 
 
 
556 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  32.67 
 
 
543 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 
545 aa  161  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  34.11 
 
 
547 aa  156  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 
574 aa  147  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 
519 aa  145  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.68 
 
 
525 aa  144  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  31.87 
 
 
559 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  32.64 
 
 
582 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.83 
 
 
551 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 
581 aa  135  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.69 
 
 
591 aa  134  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 
546 aa  133  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3664  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.37 
 
 
526 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0488098  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 
533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.33 
 
 
532 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.03 
 
 
585 aa  131  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 
546 aa  131  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 
528 aa  131  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 
576 aa  130  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 
579 aa  130  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 
525 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  32.61 
 
 
559 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2576  FAD dependent oxidoreductase  30.55 
 
 
508 aa  127  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 
582 aa  126  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 
603 aa  126  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 
543 aa  126  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0304  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 
511 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0184959  normal  0.333505 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 
579 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  31.43 
 
 
552 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 
579 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 
579 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  29.75 
 
 
537 aa  125  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3759  FAD dependent oxidoreductase  31.26 
 
 
517 aa  124  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146678  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  31.5 
 
 
516 aa  124  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 
559 aa  123  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 
550 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.17 
 
 
605 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 
562 aa  123  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.16 
 
 
530 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  31.5 
 
 
532 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.16 
 
 
554 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 
575 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 
531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2773  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 
507 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114338  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>