More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1632 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1632  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  481  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.367647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  98.71 
 
 		 232 aa  474  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1621  GntR family transcriptional regulator  97.83 
 
 		 239 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00823964  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0020  transcriptional regulator, GntR family  35.78 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5116  transcriptional regulator, GntR family  35.78 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4235  transcriptional regulator, GntR family  35.78 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0019  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4049  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.855147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4192  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 238 aa  176  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3895  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 238 aa  175  6e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 248 aa  175  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  33.48 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  32.83 
 
 		 240 aa  115  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  32.83 
 
 		 240 aa  115  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  32.83 
 
 		 240 aa  115  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  32.83 
 
 		 240 aa  115  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  32.83 
 
 		 240 aa  115  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 225 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  32.83 
 
 		 240 aa  115  7.999999999999999e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  32.83 
 
 		 240 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  30.8 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  31.48 
 
 		 240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  31.48 
 
 		 240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 256 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 256 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  30.73 
 
 		 240 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  29.57 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2301  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  26.75 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  27.63 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 258 aa  102  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 242 aa  101  8e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  28.24 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  30.5 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  26.15 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  27.83 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0745  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 235 aa  99.4  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  28.88 
 
 		 252 aa  99.4  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.5 
 
 		 246 aa  98.6  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0724  transcriptional regulator, GntR family  32.6 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 249 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  28.24 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4392  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 257 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  31.73 
 
 		 245 aa  96.3  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 248 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  25.64 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  25.64 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 258 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 258 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 232 aa  95.9  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  27.54 
 
 		 258 aa  95.9  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  27.54 
 
 		 269 aa  95.9  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 248 aa  95.1  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 248 aa  95.1  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 248 aa  95.1  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 262 aa  95.1  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3424  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 245 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014089  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5849  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499759  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0456  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0420  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.330179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1687  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  28.97 
 
 		 270 aa  93.6  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3820  transcriptional regulator, GntR family  30.62 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0228383  hitchhiker  0.00324252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  29.02 
 
 		 248 aa  93.2  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1211  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 241 aa  93.2  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 264 aa  92.8  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3111  GntR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 245 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0076  transcriptional regulator, GntR family  27.39 
 
 		 233 aa  92.4  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  23.77 
 
 		 243 aa  92  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  23.77 
 
 		 243 aa  92  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 244 aa  92.4  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3204  GntR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 245 aa  92.4  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264865  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  23.77 
 
 		 243 aa  92  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3458  GntR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 245 aa  92.4  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  23.77 
 
 		 265 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  23.77 
 
 		 243 aa  92  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 284 aa  92  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  23.77 
 
 		 243 aa  92  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  23.77 
 
 		 243 aa  92  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  23.77 
 
 		 243 aa  92  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 245 aa  92.4  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 248 aa  92  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>