More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2344 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01279  GABA aminotransferase, PLP-dependent  100 
 
 
421 aa  863  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01290  hypothetical protein  100 
 
 
421 aa  863  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2323  4-aminobutyrate transaminase  100 
 
 
421 aa  863  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1512  4-aminobutyrate transaminase  100 
 
 
421 aa  863  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1820  4-aminobutyrate transaminase  98.81 
 
 
421 aa  854  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.144249 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2344  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 
421 aa  863  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00720647  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1538  4-aminobutyrate transaminase  99.52 
 
 
421 aa  857  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.535334  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1944  4-aminobutyrate transaminase  98.57 
 
 
421 aa  850  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.991898 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1417  4-aminobutyrate transaminase  99.29 
 
 
421 aa  858  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4306  4-aminobutyrate aminotransferase  72.14 
 
 
421 aa  631  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  70.48 
 
 
421 aa  632  1e-180  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2233  4-aminobutyrate aminotransferase  68.81 
 
 
421 aa  622  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4744  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1784  4-aminobutyrate aminotransferase  70.95 
 
 
421 aa  622  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.988641  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2545  4-aminobutyrate aminotransferase  68.57 
 
 
421 aa  617  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1867  4-aminobutyrate aminotransferase  71.19 
 
 
421 aa  620  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  70.55 
 
 
427 aa  611  1e-174  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  70.07 
 
 
429 aa  608  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  69.83 
 
 
446 aa  605  1e-172  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  70.07 
 
 
427 aa  607  1e-172  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  69.83 
 
 
429 aa  605  1e-172  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  69.83 
 
 
429 aa  605  1e-172  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  69.6 
 
 
429 aa  604  1e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  69.83 
 
 
427 aa  602  1e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  69.36 
 
 
430 aa  601  1e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  69.62 
 
 
426 aa  598  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  69.86 
 
 
426 aa  598  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1335  4-aminobutyrate aminotransferase  65.5 
 
 
429 aa  592  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3106  4-aminobutyrate aminotransferase  65.5 
 
 
429 aa  592  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  68.81 
 
 
420 aa  593  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1218  4-aminobutyrate aminotransferase  65.5 
 
 
429 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4519  4-aminobutyrate aminotransferase  70.07 
 
 
427 aa  588  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  69.6 
 
 
429 aa  588  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0029  4-aminobutyrate aminotransferase protein  70.1 
 
 
426 aa  584  1e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1978  4-aminobutyrate aminotransferase  64.61 
 
 
425 aa  571  1e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2119  4-aminobutyrate aminotransferase  69.83 
 
 
427 aa  571  1e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.22947  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1480  4-aminobutyrate aminotransferase  69.6 
 
 
427 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285314  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0494  4-aminobutyrate transaminase  69.6 
 
 
427 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141268  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0810  4-aminobutyrate transaminase  69.6 
 
 
427 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.622888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2127  4-aminobutyrate transaminase  69.83 
 
 
427 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.815383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1822  4-aminobutyrate transaminase  69.36 
 
 
427 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2371  4-aminobutyrate aminotransferase  65.55 
 
 
440 aa  565  1e-160  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0827884  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0396  4-aminobutyrate transaminase  69.36 
 
 
427 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.925328  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1910  4-aminobutyrate aminotransferase  63.88 
 
 
426 aa  546  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.692445  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5049  4-aminobutyrate aminotransferase  64.92 
 
 
436 aa  530  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  0.62875 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4356  4-aminobutyrate aminotransferase  61.81 
 
 
426 aa  515  1e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363071 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  60.83 
 
 
422 aa  512  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4026  4-aminobutyrate aminotransferase  60.38 
 
 
426 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35866  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4677  4-aminobutyrate aminotransferase  60.83 
 
 
422 aa  502  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300302  normal  0.0763833 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3262  4-aminobutyrate aminotransferase  60.86 
 
 
425 aa  501  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.129895 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0848  4-aminobutyrate aminotransferase  58.81 
 
 
425 aa  500  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4167  4-aminobutyrate aminotransferase  58.22 
 
 
434 aa  494  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  58.39 
 
 
428 aa  492  1e-138  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  57.01 
 
 
430 aa  487  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6300  4-aminobutyrate aminotransferase  58.91 
 
 
426 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437284  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  55.48 
 
 
430 aa  478  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  55 
 
 
425 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  54.87 
 
 
432 aa  478  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  55 
 
 
425 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  55 
 
 
425 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2259  4-aminobutyrate aminotransferase  56.37 
 
 
426 aa  476  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.418729  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7694  4-aminobutyrate aminotransferase  57.04 
 
 
426 aa  478  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.788415  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  56.65 
 
 
430 aa  476  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  55.11 
 
 
425 aa  469  1e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  54.76 
 
 
425 aa  468  1e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  54.16 
 
 
426 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  55.11 
 
 
426 aa  461  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.888156 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  54.87 
 
 
426 aa  460  1e-128  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0429  4-aminobutyrate aminotransferase  56.59 
 
 
433 aa  459  1e-128  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.286831  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  55.11 
 
 
426 aa  461  1e-128  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  54.87 
 
 
426 aa  461  1e-128  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  53.92 
 
 
426 aa  461  1e-128  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  55.11 
 
 
426 aa  461  1e-128  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  55.11 
 
 
426 aa  461  1e-128  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  54.87 
 
 
426 aa  461  1e-128  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  54.39 
 
 
426 aa  456  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  53.68 
 
 
440 aa  453  1e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2972  4-aminobutyrate aminotransferase  53.44 
 
 
427 aa  452  1e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109466  normal  0.025416 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2989  4-aminobutyrate aminotransferase  53.21 
 
 
427 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0883038 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0090  4-aminobutyrate aminotransferase  55.11 
 
 
426 aa  448  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2937  4-aminobutyrate aminotransferase  53.21 
 
 
427 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2905  4-aminobutyrate aminotransferase  53.98 
 
 
427 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0301  4-aminobutyrate aminotransferase  55.34 
 
 
426 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2567  4-aminobutyrate aminotransferase  54.25 
 
 
424 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78639  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1532  4-aminobutyrate aminotransferase  52.27 
 
 
419 aa  448  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3137  4-aminobutyrate aminotransferase  54.95 
 
 
424 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46670  4-aminobutyrate transaminase  53.9 
 
 
426 aa  446  1e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3494  4-aminobutyrate aminotransferase  54.48 
 
 
424 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.782932  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3070  4-aminobutyrate aminotransferase  55.58 
 
 
433 aa  441  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2002  4-aminobutyrate aminotransferase  54.19 
 
 
434 aa  440  1e-122  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.07298e-05 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4414  4-aminobutyrate aminotransferase  55.85 
 
 
426 aa  441  1e-122  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  55.87 
 
 
426 aa  440  1e-122  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0809  4-aminobutyrate aminotransferase  50.84 
 
 
419 aa  439  1e-122  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.615332  normal  0.0671712 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2602  4-aminobutyrate aminotransferase  54.12 
 
 
433 aa  438  1e-122  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4211  4-aminobutyrate aminotransferase  54.5 
 
 
425 aa  437  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.225868  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0819  4-aminobutyrate aminotransferase  50.36 
 
 
446 aa  435  1e-121  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.798552  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  55.53 
 
 
427 aa  434  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  55.77 
 
 
427 aa  429  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1889  4-aminobutyrate aminotransferase  56.59 
 
 
435 aa  430  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148357  normal  0.0202633 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3003  4-aminobutyrate aminotransferase  53.14 
 
 
424 aa  427  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48796  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_4664  4-aminobutyrate aminotransferase  53.79 
 
 
428 aa  427  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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