More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1960 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1960  CinA domain-containing protein  100 
 
 		 164 aa  323  7e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  61.84 
 
 		 218 aa  184  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0971  CinA domain protein  51.9 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00476179  hitchhiker  0.00000668573 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2477  CinA domain protein  53.1 
 
 		 156 aa  148  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1458  CinA-like  50.31 
 
 		 161 aa  147  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0695046  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0622  CinA-like protein  51.88 
 
 		 174 aa  145  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.550403  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  44.87 
 
 		 419 aa  142  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  48.7 
 
 		 408 aa  141  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  50.31 
 
 		 162 aa  142  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  48.7 
 
 		 408 aa  141  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  52.35 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  50.97 
 
 		 184 aa  140  8e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  46.81 
 
 		 156 aa  140  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  50.97 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3733  CinA domain-containing protein  50 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000115453 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0067  competence/damage inducible protein CinA  49.34 
 
 		 162 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0055  CinA domain-containing protein  49.34 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  50.97 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00153  competence/damage-inducible protein CinA domain protein  54.55 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  50.35 
 
 		 418 aa  138  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  49.69 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  46.79 
 
 		 175 aa  138  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0995  competence damage-inducible protein A  48.75 
 
 		 172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108193  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  55.8 
 
 		 173 aa  137  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  53.42 
 
 		 159 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  50.34 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  49.68 
 
 		 165 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  49.68 
 
 		 165 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  49.68 
 
 		 165 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  53.42 
 
 		 179 aa  136  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  49.03 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4031  CinA domain-containing protein  52.32 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306417  unclonable  0.0000000000000327829 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  49.03 
 
 		 165 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  44.81 
 
 		 159 aa  133  8e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3016  CinA domain-containing protein  50.67 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633216  hitchhiker  0.000000000145641 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1285  CinA domain protein  50.31 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.982148  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  48.39 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  48.39 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  48.39 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  48.39 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  48.39 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  48.39 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  47.1 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  48.39 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  52.48 
 
 		 413 aa  132  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  48.39 
 
 		 165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  45 
 
 		 415 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  48.39 
 
 		 165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1473  CinA domain protein  52.41 
 
 		 166 aa  130  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  43.33 
 
 		 413 aa  130  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0429  CinA domain-containing protein  51.09 
 
 		 156 aa  130  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.962415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1287  CinA-like  45.91 
 
 		 166 aa  130  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4089  CinA domain-containing protein  51.66 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1593  CinA-like  43.95 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  51.43 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  48.94 
 
 		 420 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17520  hypothetical protein  48.47 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1522  hypothetical protein  50.31 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2083  CinA domain-containing protein  54.01 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1628  CinA domain-containing protein  50.99 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4034  cinA domain protein  49.67 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.344001  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  48.92 
 
 		 412 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  44.79 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  44.44 
 
 		 166 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1704  CinA domain protein  46.06 
 
 		 200 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.28377  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  46.98 
 
 		 203 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  45.39 
 
 		 168 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  50 
 
 		 413 aa  124  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  40.46 
 
 		 401 aa  124  5e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0069  CinA family protein  42.95 
 
 		 168 aa  124  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1174  CinA-like  47.97 
 
 		 177 aa  124  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3262  CinA-like  47.3 
 
 		 170 aa  124  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  46.31 
 
 		 160 aa  124  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1230  CinA domain-containing protein  50.33 
 
 		 160 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000125807 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  48.03 
 
 		 429 aa  124  7e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  39.87 
 
 		 412 aa  124  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  50.35 
 
 		 371 aa  124  8.000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_002950  PG1725  competence/damage inducible protein CinA  45.52 
 
 		 160 aa  123  9e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1113  competence damage-inducible protein A  46.45 
 
 		 164 aa  123  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383683  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1660  CinA domain protein  46.84 
 
 		 162 aa  123  9e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000802014  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  42.33 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  47.37 
 
 		 414 aa  123  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  47.37 
 
 		 414 aa  123  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  50.36 
 
 		 430 aa  122  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  48.97 
 
 		 422 aa  122  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  42.33 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1656  CinA domain-containing protein  46.94 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.329769  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1377  CinA, C-terminal  48.08 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.368331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  43.42 
 
 		 415 aa  122  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  42.94 
 
 		 165 aa  121  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  39.24 
 
 		 412 aa  122  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0922  CinA-like protein  48.34 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  43.53 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  46.81 
 
 		 415 aa  121  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  42.07 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  41.88 
 
 		 411 aa  121  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  47.92 
 
 		 181 aa  121  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3214  competence damage-inducible protein A  44.65 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  46.48 
 
 		 413 aa  121  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  44.17 
 
 		 184 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>