More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1153 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  72.85 
 
 
432 aa  681  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  75.76 
 
 
432 aa  680  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 
434 aa  889  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  81.94 
 
 
432 aa  755  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  67.21 
 
 
430 aa  627  1e-178  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  66.9 
 
 
428 aa  618  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  59.43 
 
 
436 aa  533  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  51.42 
 
 
434 aa  446  1e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  49.3 
 
 
433 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  48.82 
 
 
432 aa  433  1e-120  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  48 
 
 
435 aa  428  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  50.86 
 
 
432 aa  428  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  49.06 
 
 
435 aa  428  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  47.58 
 
 
434 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  47.16 
 
 
428 aa  427  1e-118  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  47.81 
 
 
434 aa  425  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.65841e-12 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  49.54 
 
 
434 aa  425  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  50.12 
 
 
434 aa  426  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  49.65 
 
 
435 aa  425  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  49.06 
 
 
433 aa  422  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  46.7 
 
 
433 aa  422  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  48.13 
 
 
431 aa  421  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  48.14 
 
 
435 aa  422  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  49.06 
 
 
438 aa  422  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  45.79 
 
 
429 aa  421  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  46.7 
 
 
433 aa  421  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  48.15 
 
 
433 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  48.37 
 
 
433 aa  418  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  46.06 
 
 
434 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  46.93 
 
 
433 aa  421  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  47.04 
 
 
430 aa  419  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  48.96 
 
 
433 aa  419  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  47.55 
 
 
434 aa  417  1e-115  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  48.7 
 
 
439 aa  417  1e-115  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  46.46 
 
 
433 aa  416  1e-115  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  48.18 
 
 
432 aa  417  1e-115  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  48.24 
 
 
433 aa  412  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  46.35 
 
 
433 aa  414  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  51.05 
 
 
441 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  46.37 
 
 
429 aa  414  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  46.4 
 
 
432 aa  409  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  45.98 
 
 
434 aa  410  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  46.17 
 
 
432 aa  410  1e-113  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  46.17 
 
 
432 aa  409  1e-113  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  45.75 
 
 
433 aa  410  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  45.26 
 
 
423 aa  409  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  47.91 
 
 
435 aa  406  1e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  3.76262e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  48.01 
 
 
434 aa  407  1e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  45.24 
 
 
433 aa  407  1e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  45.52 
 
 
433 aa  407  1e-112  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  50.23 
 
 
441 aa  408  1e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  46.95 
 
 
434 aa  407  1e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  47.23 
 
 
432 aa  406  1e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  50 
 
 
441 aa  405  1e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  45.28 
 
 
433 aa  406  1e-112  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  50 
 
 
441 aa  405  1e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  46.23 
 
 
433 aa  405  1e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  49.18 
 
 
444 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  47.79 
 
 
446 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  46.1 
 
 
436 aa  399  1e-110  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  1.90319e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  47.04 
 
 
430 aa  401  1e-110  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  2.41897e-05 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  44.63 
 
 
439 aa  400  1e-110  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  44.78 
 
 
432 aa  398  1e-110  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  44 
 
 
433 aa  396  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  45.18 
 
 
436 aa  397  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  48.47 
 
 
444 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  43.46 
 
 
439 aa  397  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  45.67 
 
 
441 aa  396  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  46.82 
 
 
437 aa  395  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  44.68 
 
 
434 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  43.46 
 
 
439 aa  395  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  48.94 
 
 
444 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  43.06 
 
 
433 aa  393  1e-108  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  43.06 
 
 
436 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  43.63 
 
 
433 aa  391  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  44.34 
 
 
433 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58285e-15 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  43.5 
 
 
435 aa  388  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  46.03 
 
 
439 aa  391  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  44.71 
 
 
432 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  44.1 
 
 
433 aa  388  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  45.41 
 
 
433 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  44.91 
 
 
435 aa  387  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  47.09 
 
 
434 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  45.06 
 
 
433 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  45.12 
 
 
436 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2480  phenylacetate-CoA ligase  46.17 
 
 
439 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3279  phenylacetate-CoA ligase  45.94 
 
 
439 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  44.26 
 
 
415 aa  383  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2617  phenylacetate-CoA ligase  45.71 
 
 
439 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.174416 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2630  phenylacetate-CoA ligase  46.17 
 
 
439 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460145  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  45.92 
 
 
434 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  45.65 
 
 
432 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  46.12 
 
 
432 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  44.77 
 
 
443 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  44.84 
 
 
431 aa  378  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  46.03 
 
 
439 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  42.59 
 
 
432 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2883  phenylacetate-CoA ligase  47.39 
 
 
427 aa  374  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  45.77 
 
 
434 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  45.88 
 
 
433 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>