More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3239 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3239  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
405 aa  783    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1518  sodium/hydrogen exchanger  85.15 
 
 
411 aa  622  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2065  Sodium/hydrogen exchanger  79 
 
 
408 aa  604  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0630296 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4884  sodium/hydrogen exchanger family protein  61.19 
 
 
407 aa  474  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5187  sodium/hydrogen exchanger family protein  63.68 
 
 
399 aa  473  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4911  sodium/hydrogen exchanger family protein  63.84 
 
 
399 aa  472  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5286  sodium/hydrogen exchanger family protein  63.84 
 
 
399 aa  472  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5201  sodium/hydrogen exchanger family protein  63.93 
 
 
399 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5156  sodium/hydrogen exchanger family protein  63.84 
 
 
399 aa  472  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3609399999999994e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4474  Na+/H+ antiporter  60.95 
 
 
407 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4756  Na+/H+ antiporter  63.59 
 
 
399 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.586497  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4492  Na+/H+ antiporter  61.19 
 
 
407 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4775  Na+/H+ antiporter  63.59 
 
 
399 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.169433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4863  sodium/hydrogen exchanger family protein  61.19 
 
 
407 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4572  sodium/hydrogen exchanger  60.95 
 
 
407 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4871  sodium/hydrogen exchanger  63.54 
 
 
399 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.813703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0056  sodium/hydrogen exchanger family protein  63.18 
 
 
399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0399092  hitchhiker  0.000000129264 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4877  sodium/hydrogen exchanger family protein  60.95 
 
 
407 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5193  sodium/hydrogen exchanger family protein  63.18 
 
 
399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.147358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0384  sodium/hydrogen exchanger family protein  60.2 
 
 
407 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4853  sodium/hydrogen exchanger family protein  60.45 
 
 
407 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4639  sodium/hydrogen exchanger family protein  61.89 
 
 
393 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4993  sodium/hydrogen exchanger family protein  61.89 
 
 
393 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.850719  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0232  sodium/hydrogen exchanger  58.66 
 
 
412 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.568377  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3108  sodium/hydrogen exchanger  55.86 
 
 
400 aa  429  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.315718  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1207  sodium/hydrogen exchanger  42.04 
 
 
399 aa  265  1e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000156939  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0798  sodium/hydrogen exchanger  37.53 
 
 
403 aa  241  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.539065  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4477  sodium/hydrogen exchanger  40.21 
 
 
400 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92242  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1889  hypothetical protein  39.67 
 
 
403 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993371  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0363  sodium/hydrogen exchanger  36.72 
 
 
414 aa  188  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624328 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2190  sodium/hydrogen exchanger  33.91 
 
 
427 aa  176  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  30.66 
 
 
585 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  30.9 
 
 
585 aa  166  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0918  sodium/hydrogen exchanger  36.91 
 
 
394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272174  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  30.41 
 
 
585 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1752  sodium/hydrogen exchanger  33.25 
 
 
409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0084  sodium/hydrogen exchanger  32.4 
 
 
436 aa  159  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.4 
 
 
587 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.4 
 
 
587 aa  156  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  28.35 
 
 
586 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1555  sodium/hydrogen exchanger  31.54 
 
 
391 aa  155  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000544506  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2225  sodium/hydrogen exchanger  34.1 
 
 
404 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  28.1 
 
 
586 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  27.85 
 
 
586 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  27.85 
 
 
586 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3880  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.97 
 
 
386 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1612  sodium/hydrogen exchanger  31.17 
 
 
393 aa  152  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.716831  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1893  sodium/hydrogen exchanger  34.45 
 
 
395 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.285532  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3663  sodium/hydrogen exchanger  32.19 
 
 
393 aa  150  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13265  integral membrane transport protein  31.38 
 
 
385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.53552 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  27.16 
 
 
585 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  27.41 
 
 
585 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1158  sodium/hydrogen exchanger  31.93 
 
 
388 aa  147  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.637442  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0408  sodium/hydrogen exchanger  34.86 
 
 
388 aa  146  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2892  sodium/hydrogen exchanger  33.07 
 
 
384 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  26.67 
 
 
587 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19020  Kef-type K+ transport system, membrane component  35.1 
 
 
415 aa  145  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2906  sodium/hydrogen exchanger  32.81 
 
 
384 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894257  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2862  sodium/hydrogen exchanger  32.81 
 
 
384 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2649  sodium/hydrogen exchanger  33.99 
 
 
399 aa  143  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0119  sodium/hydrogen exchanger  33.95 
 
 
401 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3876  sodium/hydrogen exchanger  33.12 
 
 
396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0118  sodium/hydrogen exchanger  32.98 
 
 
401 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2800  sodium/hydrogen exchanger  33.24 
 
 
387 aa  132  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  27.23 
 
 
586 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4657  sodium/hydrogen exchanger  33.68 
 
 
436 aa  132  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4597  sodium/hydrogen exchanger  29.41 
 
 
777 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0861  sodium/hydrogen exchanger  31.14 
 
 
395 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3551  sodium/hydrogen exchanger  29.64 
 
 
741 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.994377  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2651  sodium/hydrogen exchanger  30.81 
 
 
373 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172671  decreased coverage  0.000202867 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  30.3 
 
 
710 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  27.13 
 
 
741 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0554  putative cation:proton antiport protein  31.81 
 
 
558 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.556541  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0539  putative cation:proton antiport protein  31.81 
 
 
558 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0544  putative cation:proton antiport protein  31.81 
 
 
558 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.890116  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0538  putative cation:proton antiport protein  31.81 
 
 
558 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  30.89 
 
 
562 aa  124  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0599  putative cation:proton antiport protein  31.81 
 
 
558 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.18338  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1390  sodium/hydrogen exchanger  29.06 
 
 
782 aa  124  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0446  sodium/hydrogen exchanger  26.15 
 
 
441 aa  123  5e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000379549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  28.69 
 
 
747 aa  123  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00429  predicted transporter with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  31.52 
 
 
558 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00434  hypothetical protein  31.52 
 
 
558 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3138  putative cation:proton antiport protein  31.52 
 
 
558 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000511667 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0555  putative cation:proton antiport protein  31.52 
 
 
558 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0570  putative cation:proton antiport protein  31.23 
 
 
558 aa  121  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.861339  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0522  putative cation:proton antiport protein  31.23 
 
 
558 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4112  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0517  putative cation:proton antiport protein  31.23 
 
 
558 aa  121  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0410  putative cation:proton antiport protein  31.23 
 
 
558 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3132  potassium efflux system protein  31.52 
 
 
558 aa  120  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  32.57 
 
 
775 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  27.72 
 
 
745 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  28.38 
 
 
556 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.08 
 
 
579 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0957  putative cation:proton antiport protein  30.66 
 
 
558 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0754  sodium/hydrogen exchanger  27.01 
 
 
598 aa  115  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835162  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  28 
 
 
575 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  28.82 
 
 
563 aa  114  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  30.46 
 
 
563 aa  113  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0891  sodium/hydrogen exchanger  28.14 
 
 
381 aa  113  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.155242  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>