230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3031 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3031  gas vesicle protein GvpN  100 
 
 		 307 aa  627  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2836  gas vesicle protein GvpN  59.73 
 
 		 340 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1815  gas vesicle protein GvpN  55.02 
 
 		 308 aa  366  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0692  ATPase  53.69 
 
 		 299 aa  352  2.9999999999999997e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1495  gas vesicle protein GvpN  48.81 
 
 		 304 aa  310  2e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1750  gas vesicle protein GvpN  45.71 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1255  gas vesicle protein GvpN  45.91 
 
 		 334 aa  262  4e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.396031 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0076  ATPase associated with various cellular activities  45.36 
 
 		 418 aa  262  6e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0615822  decreased coverage  0.000700861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2329  gas vesicle protein GvpN  40.14 
 
 		 311 aa  243  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000399542 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2334  gas vesicle protein GvpN  40.49 
 
 		 311 aa  242  5e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0330  hypothetical protein  41.55 
 
 		 437 aa  227  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.608164 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0058  gas vesicle protein GvpN  39.44 
 
 		 351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0714681  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2375  gas vesicle protein GvpN  39.93 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3267  ATPase  39.06 
 
 		 316 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0883928  normal  0.16657 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3582  ATPase  36.54 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0333  gas vesicle protein GvpN  37.5 
 
 		 373 aa  169  6e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  26.44 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  25.97 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.61 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  24.19 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  27.31 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  27.14 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  26.67 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  24.88 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2637  rubisco activation protein CbbQ  24.08 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  27.01 
 
 		 263 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  24.24 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  23.83 
 
 		 272 aa  68.9  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  24.24 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  25.26 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  24.41 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  25.77 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  22.84 
 
 		 268 aa  67  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  25.74 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  23.25 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  24.31 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.09 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2766  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.87 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  25.37 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1094  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  22.77 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  24.64 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  25 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2838  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  24.5 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  26.12 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  26.12 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0824  nitric oxide reductase activation protein NorQ  24.75 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  24.12 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  24.17 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  23.04 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  27.13 
 
 		 269 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.79 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  24.23 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1044  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  23.94 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3134  ATPase  22.17 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  23 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  23 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1978  ATPase  22.49 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  23.2 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4155  ATPase  23.04 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4418  ATPase  26.47 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0850  ATPase  28.37 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4505  ATPase  26.47 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.2 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.2 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  22 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1915  ATPase  29.41 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  21.72 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  22.42 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4388  ATPase  25.23 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0269278  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  23.29 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4196  ATPase  22.65 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  22.01 
 
 		 265 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2458  ATPase  21.57 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1403  ATPase  27.41 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0954  ATPase  27.78 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  21.08 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0226  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  23.33 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.36 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  21.08 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  21.08 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.12 
 
 		 286 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  23.47 
 
 		 271 aa  57  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.21 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3069  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  25.51 
 
 		 343 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51378  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  25.21 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  23.76 
 
 		 280 aa  57  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3591  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.79 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.244464  normal  0.721519 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0287  cobalt chelatase, pCobS small subunit  25.35 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4799  ATPase  25.98 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0106  AAA family ATPase  28.05 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0687561  normal  0.0739465 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0541  cobalt chelatase, pCobS small subunit  25.35 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1877  cobalt chelatase, pCobS small subunit  25.26 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0965153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0322  NorQ protein required for nitric oxide reductase activity  23.63 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1967  ATPase  23.63 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7565  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  25.2 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0403  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.73 
 
 		 332 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.154081  normal  0.524708 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6496  cobalt chelatase, pCobS small subunit  25 
 
 		 327 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0251136  decreased coverage  0.00405526 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  26.2 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0318  cobalt chelatase, pCobS small subunit  25.59 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0350783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>