93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1279 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1279  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  100 
 
 		 317 aa  650    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.290847 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0146  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  61.15 
 
 		 314 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0139  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  61.15 
 
 		 314 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1972  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.98 
 
 		 316 aa  322  4e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1355  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.27 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.420984  normal  0.358131 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2313  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.06 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0194  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.06 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0814  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.11 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592821 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0400  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.36 
 
 		 300 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0852  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  39.8 
 
 		 318 aa  220  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0567  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.87 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0829  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  34.7 
 
 		 494 aa  210  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.330153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0325  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  34.38 
 
 		 501 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393409 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2660  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.74 
 
 		 339 aa  202  6e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.403976  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0088  heterodisulfide reductase subunit  34.48 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80358  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1211  hydrogenase, iron-sulfur cluster-binding subunit, putative  32.8 
 
 		 323 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0866  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.65 
 
 		 308 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1258  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.48 
 
 		 276 aa  195  8.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3585  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.44 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0028  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.64 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0027  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.64 
 
 		 314 aa  195  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0147  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.44 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17790  4Fe-4S protein  33.75 
 
 		 284 aa  194  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3428  heterodisulfide reductase subunit  33.96 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2101  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  34.59 
 
 		 482 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.212274  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3528  hydrogenase, iron-sulfur cluster-binding subunit, putative  33.55 
 
 		 320 aa  189  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1331  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.96 
 
 		 318 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.66 
 
 		 277 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.94097  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1111  hydrogenase, iron-sulfur binding protein, putative  31.76 
 
 		 276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.346236 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1031  hydrogenase, iron-sulfur binding protein, putative  32.08 
 
 		 278 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1304  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.76 
 
 		 276 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1330  formate dehydrogenase  29.43 
 
 		 370 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.342648  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2346  Formate dehydrogenase  26.08 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2147  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.21 
 
 		 261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0607  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  25.63 
 
 		 387 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1377  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  24.51 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00118672  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0542  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  24.79 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0296  formate dehydrogenase, beta subunit (F420)  24.51 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.510341  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1832  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  24.86 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0822  formate dehydrogenase  25.97 
 
 		 379 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1797  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.76 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.812757  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0924  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  24.8 
 
 		 417 aa  103  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000725534 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0980  Formate dehydrogenase  25.42 
 
 		 355 aa  102  7e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000894314  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2020  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  24.51 
 
 		 414 aa  102  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0577  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  23.5 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1814  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  24.93 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0577  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  25.84 
 
 		 413 aa  99.4  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1044  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  24.93 
 
 		 412 aa  98.6  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0606051  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0195  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  24.29 
 
 		 417 aa  96.7  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0550447  decreased coverage  0.000288361 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0462  formate dehydrogenase, beta subunit (F420)  23.1 
 
 		 414 aa  96.3  5e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.522633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1144  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  22.68 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.592396  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1623  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  23.89 
 
 		 421 aa  94.7  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1138  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  21.86 
 
 		 375 aa  94  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0419  Formate dehydrogenase  25.52 
 
 		 382 aa  94  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1537  formate dehydrogenase, beta subunit (F420)  22.28 
 
 		 375 aa  93.6  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0761099  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1378  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  23.01 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0813  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  21.58 
 
 		 375 aa  89.7  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1380  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  21.88 
 
 		 383 aa  79.3  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2022  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  23.81 
 
 		 383 aa  75.9  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.307444  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3237  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  21.94 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0217745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1562  formate dehydrogenase, beta subunit (F420)  20.75 
 
 		 401 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1058  hypothetical protein  28.85 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.550841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0406  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.83 
 
 		 431 aa  46.6  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0694601 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0167  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  31.43 
 
 		 264 aa  46.6  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0339  hypothetical protein  28.83 
 
 		 534 aa  46.2  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.495442  normal  0.0503197 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.83 
 
 		 534 aa  46.2  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0261  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  29.55 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.234537 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0305  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  28.15 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112135  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1463  hypothetical protein  36.14 
 
 		 470 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1870  electron transport complex protein RnfC  28.21 
 
 		 716 aa  44.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00517809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1393  iron-sulfur cluster-binding protein  30.11 
 
 		 473 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3989  iron-sulfur cluster-binding protein  30.11 
 
 		 473 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.638276  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1417  iron-sulfur cluster-binding protein  30.11 
 
 		 473 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1457  iron-sulfur cluster-binding protein  30.11 
 
 		 473 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0884  hydrogenase large subunit domain protein  36.36 
 
 		 507 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.139599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1219  iron-sulfur cluster binding protein  30.11 
 
 		 473 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.394191  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2252  electron transport complex protein RnfC  25 
 
 		 659 aa  43.9  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00637467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1355  iron-sulfur cluster-binding protein  30.11 
 
 		 473 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1896  electron transport complex protein RnfC  25 
 
 		 698 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.813056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1217  iron-sulfur cluster-binding protein  30.11 
 
 		 473 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.387258  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25 
 
 		 431 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0678003 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1195  iron-sulfur cluster-binding protein  30.11 
 
 		 473 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1197  iron-sulfur cluster-binding protein  30.11 
 
 		 473 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.208704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1316  iron-sulfur cluster-binding protein  30.11 
 
 		 473 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2008  electron transport complex protein RnfC  25 
 
 		 698 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0391  iron-sulfur cluster binding protein  27.65 
 
 		 475 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0574  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.46 
 
 		 531 aa  43.9  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.158943  normal  0.0218676 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1438  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  28.57 
 
 		 232 aa  43.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.289291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2401  electron transport complex protein RnfC  26.8 
 
 		 745 aa  43.5  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1025  iron-sulfur cluster-binding protein  30.11 
 
 		 473 aa  43.1  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0784  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  29.52 
 
 		 232 aa  43.1  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1061  electron transport complex protein RnfC  23.64 
 
 		 659 aa  42.7  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0610  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  30.12 
 
 		 440 aa  42.4  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0321334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>