90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1111 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1111  hydrogenase, iron-sulfur binding protein, putative  100 
 
 
276 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.346236 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1258  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  67.75 
 
 
276 aa  414  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  64.98 
 
 
277 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.94097  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1031  hydrogenase, iron-sulfur binding protein, putative  65.94 
 
 
278 aa  397  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1304  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  63.41 
 
 
276 aa  388  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0088  heterodisulfide reductase subunit  36.95 
 
 
309 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80358  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0147  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.31 
 
 
315 aa  206  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3585  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.31 
 
 
315 aa  206  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0866  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.95 
 
 
308 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0028  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.71 
 
 
314 aa  202  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0027  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.37 
 
 
314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3428  heterodisulfide reductase subunit  36.59 
 
 
305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0814  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.97 
 
 
303 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000592821 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1355  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.4 
 
 
320 aa  175  9e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.420984  normal  0.358131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1279  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  31.76 
 
 
317 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.290847 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0139  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.29 
 
 
314 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0146  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.29 
 
 
314 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0400  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.89 
 
 
300 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1972  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.79 
 
 
316 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1211  hydrogenase, iron-sulfur cluster-binding subunit, putative  30.31 
 
 
323 aa  149  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2660  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.96 
 
 
339 aa  149  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.403976  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17790  4Fe-4S protein  30.51 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0852  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  32.66 
 
 
318 aa  142  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1331  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.32 
 
 
318 aa  141  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2313  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.21 
 
 
318 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0194  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.21 
 
 
318 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3528  hydrogenase, iron-sulfur cluster-binding subunit, putative  30.07 
 
 
320 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0829  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  30.6 
 
 
494 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.330153  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0325  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  29.06 
 
 
501 aa  132  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393409 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0567  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.01 
 
 
328 aa  132  6.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1797  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.91 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.812757  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2101  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  28.25 
 
 
482 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.212274  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2147  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.58 
 
 
261 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0607  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  32.28 
 
 
387 aa  87.8  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2346  Formate dehydrogenase  30.51 
 
 
380 aa  85.5  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0462  formate dehydrogenase, beta subunit (F420)  36.04 
 
 
414 aa  84  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.522633  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1377  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  30.84 
 
 
387 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00118672  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2020  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  31.82 
 
 
414 aa  83.6  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641041  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1814  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  31.1 
 
 
414 aa  82.8  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0542  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  29.91 
 
 
387 aa  82.4  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.428653  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0924  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  37.86 
 
 
417 aa  82.4  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000725534 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0296  formate dehydrogenase, beta subunit (F420)  29.91 
 
 
387 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.510341  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0577  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  40.59 
 
 
413 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1832  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  30.26 
 
 
425 aa  81.6  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000318663  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0822  formate dehydrogenase  30.92 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1330  formate dehydrogenase  31.17 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.342648  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0577  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  29.85 
 
 
374 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1378  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  34.82 
 
 
412 aa  78.6  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1138  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  31 
 
 
375 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1058  hypothetical protein  38.39 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.550841  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1144  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  28.36 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.592396  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0419  Formate dehydrogenase  34.13 
 
 
382 aa  77  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0813  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  29.85 
 
 
375 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0195  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  36.84 
 
 
417 aa  76.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0550447  decreased coverage  0.000288361 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0980  Formate dehydrogenase  30.65 
 
 
355 aa  75.9  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000894314  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1044  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  34.82 
 
 
412 aa  76.3  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0606051  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1537  formate dehydrogenase, beta subunit (F420)  29.1 
 
 
375 aa  75.9  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0761099  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1623  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  30.63 
 
 
421 aa  68.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1380  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  34.83 
 
 
383 aa  61.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1562  formate dehydrogenase, beta subunit (F420)  30.77 
 
 
401 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2022  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  30.77 
 
 
383 aa  55.8  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.307444  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3237  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  31.46 
 
 
392 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0217745  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3297  iron-sulfur cluster-binding protein  33.33 
 
 
421 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1870  electron transport complex protein RnfC  28.28 
 
 
716 aa  47.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00517809  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02966  electron transport complex protein RnfC  30.21 
 
 
912 aa  46.6  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2967  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  27.37 
 
 
890 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.390488  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002947  electron transport complex protein RnfC  32.5 
 
 
916 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.703595  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1311  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.58 
 
 
470 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1207  Iron-sulfur cluster binding protein  31.58 
 
 
470 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.03 
 
 
470 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350099  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1638  electron transport complex protein RnfC  39.13 
 
 
776 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2147  hypothetical protein  28.03 
 
 
470 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68355  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5436  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.03 
 
 
470 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0384157  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2040  hypothetical protein  28.03 
 
 
470 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2156  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  32.18 
 
 
673 aa  43.1  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.261031  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5947  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.03 
 
 
470 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127817  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3955  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  23.6 
 
 
281 aa  42.7  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0798721 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02321  NADH dehydrogenase subunit I  28.91 
 
 
218 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1543  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  31.88 
 
 
981 aa  42.7  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0195747 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0688  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  24.47 
 
 
605 aa  42.7  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0508448  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3823  protein of unknown function DUF162  36.47 
 
 
463 aa  42.7  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207305  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1526  NADH dehydrogenase subunit I  28.91 
 
 
218 aa  42.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2167  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.27 
 
 
470 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14350  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  29.17 
 
 
441 aa  42.4  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000459992  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1201  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  22.7 
 
 
260 aa  42.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000209042 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1034  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  33.73 
 
 
704 aa  42.4  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.321702  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2174  electron transport complex protein RnfC  31.76 
 
 
846 aa  42.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.234957  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1934  iron-sulfur cluster binding protein  31.58 
 
 
469 aa  42  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.628498  normal  0.020498 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2079  iron-sulfur cluster binding protein  25.74 
 
 
482 aa  42  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1612  putative iron-sulfur binding protein  31.58 
 
 
469 aa  42  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>