87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0400 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0400  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  100 
 
 		 300 aa  618  1e-176  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0814  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  46.71 
 
 		 303 aa  285  8e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592821 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1972  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.38 
 
 		 316 aa  238  8e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2660  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.62 
 
 		 339 aa  238  9e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.403976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1355  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.38 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.420984  normal  0.358131 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17790  4Fe-4S protein  37.75 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0146  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.2 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0139  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.2 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1279  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  36.36 
 
 		 317 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.290847 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0852  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  38.59 
 
 		 318 aa  205  8e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0088  heterodisulfide reductase subunit  37.42 
 
 		 309 aa  205  8e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80358  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0567  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.46 
 
 		 328 aa  202  6e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3428  heterodisulfide reductase subunit  35.76 
 
 		 305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3528  hydrogenase, iron-sulfur cluster-binding subunit, putative  35.55 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3585  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.97 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0147  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.97 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1331  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.86 
 
 		 318 aa  189  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1211  hydrogenase, iron-sulfur cluster-binding subunit, putative  34.67 
 
 		 323 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0028  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.16 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0027  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.83 
 
 		 314 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0194  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.36 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0866  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.21 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2313  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.36 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0829  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  33.88 
 
 		 494 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.330153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0325  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  32.79 
 
 		 501 aa  175  7e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393409 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2101  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  31.42 
 
 		 482 aa  172  9e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.212274  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1258  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.12 
 
 		 276 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.34 
 
 		 277 aa  165  9e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.94097  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1304  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.93 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1111  hydrogenase, iron-sulfur binding protein, putative  32.89 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.346236 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1031  hydrogenase, iron-sulfur binding protein, putative  30.13 
 
 		 278 aa  152  8e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1797  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.17 
 
 		 268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.812757  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2147  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.24 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1330  formate dehydrogenase  28.08 
 
 		 370 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.342648  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2346  Formate dehydrogenase  25.76 
 
 		 380 aa  96.7  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0822  formate dehydrogenase  25.68 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0419  Formate dehydrogenase  34.19 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0607  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  34.04 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1832  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  35.64 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1138  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  33.6 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2020  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  30.77 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0813  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  36.89 
 
 		 375 aa  76.3  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1537  formate dehydrogenase, beta subunit (F420)  36.89 
 
 		 375 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0761099  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1378  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  35.78 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1144  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  37.74 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.592396  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0577  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  33.6 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0980  Formate dehydrogenase  19.61 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000894314  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0577  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  29.63 
 
 		 413 aa  72.8  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2022  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  33.06 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.307444  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0924  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  30.6 
 
 		 417 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000725534 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0462  formate dehydrogenase, beta subunit (F420)  31.67 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.522633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1623  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  32.99 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1044  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  34.86 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0606051  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0542  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  35.87 
 
 		 387 aa  69.3  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1377  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  35.29 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00118672  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0296  formate dehydrogenase, beta subunit (F420)  38.46 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.510341  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0195  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  36.96 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0550447  decreased coverage  0.000288361 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3237  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  30.7 
 
 		 392 aa  65.5  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0217745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1814  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  35.44 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1058  hypothetical protein  36.78 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.550841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1380  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  32.73 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1562  formate dehydrogenase, beta subunit (F420)  29.41 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1555  electron transport complex protein RnfC  38.57 
 
 		 732 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.555385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1627  electron transport complex protein RnfC  38.57 
 
 		 735 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0777449  normal  0.304577 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1717  electron transport complex protein RnfC  38.57 
 
 		 735 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1885  electron transport complex protein RnfC  38.57 
 
 		 704 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07500  aldo/keto reductase  41.3 
 
 		 376 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1567  electron transport complex protein RnfC  38.57 
 
 		 735 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0379557 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3531  DNA binding domain-containing protein  27.34 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.635038  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01599  electron transport complex protein RnfC  37.14 
 
 		 740 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0105357  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1837  electron transport complex protein RnfC  37.14 
 
 		 740 aa  43.5  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2341  electron transport complex protein RnfC  35.71 
 
 		 772 aa  43.5  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01589  hypothetical protein  37.14 
 
 		 694 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00945839  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1705  electron transport complex protein RnfC  37.14 
 
 		 740 aa  43.5  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0365167  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2012  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  37.14 
 
 		 740 aa  43.5  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000275301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2000  electron transport complex protein RnfC  37.14 
 
 		 740 aa  43.5  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000227688  normal  0.287278 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1818  electron transport complex protein RnfC  37.14 
 
 		 708 aa  43.5  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.243946  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1570  electron transport complex protein RnfC  37.14 
 
 		 676 aa  43.5  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1918  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  35.71 
 
 		 673 aa  42.7  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2023  electron transport complex protein RnfC  35.71 
 
 		 747 aa  42.7  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1521  NADH dehydrogenase subunit I  31.11 
 
 		 231 aa  42.4  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00088837  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1922  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 		 213 aa  42.7  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000283263  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2323  electron transport complex protein RnfC  35.71 
 
 		 737 aa  42.7  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2156  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  35.71 
 
 		 673 aa  42.7  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.261031  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1556  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 		 213 aa  42.4  0.009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000101443  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1742  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 		 213 aa  42.4  0.009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0368  iron-sulfur cluster binding protein  33.33 
 
 		 478 aa  42.4  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>