More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4145 on replicon NC_009958
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 334 aa  685    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  58.31 
 
 		 317 aa  361  8e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  44.92 
 
 		 714 aa  276  3e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  45.45 
 
 		 340 aa  270  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  44.16 
 
 		 313 aa  265  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  43.51 
 
 		 329 aa  263  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  40.53 
 
 		 298 aa  180  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  38.28 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  35 
 
 		 324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  37.13 
 
 		 312 aa  172  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  34.06 
 
 		 324 aa  169  4e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  38.49 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  33.1 
 
 		 310 aa  162  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  32.45 
 
 		 334 aa  160  4e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  34.1 
 
 		 705 aa  158  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  37.4 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  31.91 
 
 		 652 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  37.39 
 
 		 299 aa  153  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  34.26 
 
 		 306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  38.37 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  35.59 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  35.34 
 
 		 318 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 		 318 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 		 318 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  29.54 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  33 
 
 		 299 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  34.35 
 
 		 313 aa  139  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  36.11 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.82 
 
 		 311 aa  136  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  33.55 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  35.16 
 
 		 317 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 		 387 aa  133  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.17 
 
 		 355 aa  132  6.999999999999999e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 		 361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  32.92 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  36.14 
 
 		 318 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  30.55 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 		 293 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 		 310 aa  126  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  34.01 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  34.11 
 
 		 340 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.87 
 
 		 379 aa  121  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  31.45 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  33.89 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  32.58 
 
 		 1837 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  37.05 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 		 360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  33.21 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 		 691 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  37.05 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 		 304 aa  116  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  35.02 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.89 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 		 691 aa  113  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 		 318 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 		 691 aa  112  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 		 679 aa  112  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  28.46 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  30.24 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2884  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379417  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  26.44 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  34.67 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 		 327 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 		 314 aa  109  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 		 298 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 1152 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  29.83 
 
 		 308 aa  109  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 		 1739 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 		 683 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 		 303 aa  106  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 		 318 aa  105  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  30.19 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  29.82 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  29.15 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0130  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 		 352 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0102341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 		 306 aa  103  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  31.95 
 
 		 322 aa  102  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0524  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0688  glycosyl transferase protein  31.3 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 		 624 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 892 aa  100  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  29.51 
 
 		 320 aa  99.8  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 		 297 aa  99.4  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 		 305 aa  99  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6339  glycosyl transferase family 2  30.16 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>