More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2691 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_2691  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 
256 aa  528  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25235  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  54.37 
 
 
257 aa  278  7e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.37 
 
 
260 aa  278  8e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3080  beta-lactamase-like  51.97 
 
 
255 aa  278  8e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120215  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0923  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.35 
 
 
260 aa  277  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.319486  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2552  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.36 
 
 
256 aa  260  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.964384  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2381  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.59 
 
 
256 aa  257  1e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.239292 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1578  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.41 
 
 
256 aa  251  7e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.156565 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0373  beta-lactamase-like protein  50.83 
 
 
255 aa  249  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.717136 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0069  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.41 
 
 
255 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0343  metallo-beta-lactamase family protein  49.21 
 
 
256 aa  247  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  50 
 
 
255 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4036  glyoxalase II  49.38 
 
 
256 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0614  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.79 
 
 
255 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362443  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0508  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.59 
 
 
255 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11609  normal  0.0226917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7609  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  49.17 
 
 
255 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0185313  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0466  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.24 
 
 
255 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.991116  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.83 
 
 
278 aa  234  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1042  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.55 
 
 
256 aa  229  4e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2206  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.06 
 
 
255 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1898  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.69 
 
 
256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3582  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.21 
 
 
256 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0430  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.44 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2019  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.08 
 
 
282 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.612705  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3875  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.21 
 
 
256 aa  218  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16683  glyoxalase  42.91 
 
 
262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2294  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II) (GLX II) protein  45.1 
 
 
255 aa  215  5e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.198098  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0969  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.1 
 
 
255 aa  215  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1321  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.67 
 
 
254 aa  213  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1663  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.06 
 
 
242 aa  212  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.23 
 
 
256 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3813  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.06 
 
 
248 aa  206  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0378  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.67 
 
 
248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2438  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.08 
 
 
259 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2798  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.69 
 
 
272 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.233678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2063  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.5 
 
 
255 aa  193  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136922  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  50.25 
 
 
265 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.08 
 
 
257 aa  190  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  43.55 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0448  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.5 
 
 
255 aa  188  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2091  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.67 
 
 
271 aa  187  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.700035  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2510  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.67 
 
 
259 aa  186  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.91 
 
 
258 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2733  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.67 
 
 
259 aa  185  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1999  metallo-beta-lactamase family protein  42.52 
 
 
265 aa  183  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0917  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.6 
 
 
258 aa  182  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6889  predicted protein  42.54 
 
 
227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.359449  normal  0.106822 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.49 
 
 
259 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.89 
 
 
259 aa  181  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1665  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.44 
 
 
256 aa  181  7e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1587  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.72 
 
 
255 aa  181  9.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.325978  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3064  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.08 
 
 
242 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00018038  normal  0.0339192 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01981  Hydroxyacylglutathione hydrolase  41.7 
 
 
263 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0160657  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4875  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.93 
 
 
257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2206  beta-lactamase-like protein  44.09 
 
 
266 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00363789  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.34 
 
 
258 aa  178  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3483  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.51 
 
 
258 aa  178  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1761  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.7 
 
 
259 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.49 
 
 
259 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2187  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.31 
 
 
266 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1996  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.09 
 
 
263 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0422138  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5360  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.48 
 
 
263 aa  175  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.04 
 
 
250 aa  174  9e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0684  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.42 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2327  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.31 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000811011  hitchhiker  0.0000970016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2011  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.86 
 
 
263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000146784  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1702  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.73 
 
 
257 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0461199  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  41.15 
 
 
252 aa  171  7.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0422  metallo-beta-lactamase family protein  39.84 
 
 
257 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0543677  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.51 
 
 
257 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.51 
 
 
257 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1994  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.56 
 
 
256 aa  171  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.452581  normal  0.438487 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1765  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.84 
 
 
257 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2184  Beta-lactamase-like  43.27 
 
 
255 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.08 
 
 
259 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1536  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.11 
 
 
263 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0733967  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2529  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.75 
 
 
259 aa  169  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.31 
 
 
256 aa  170  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2059  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.86 
 
 
263 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000134001  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2114  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.27 
 
 
260 aa  169  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000176506  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2338  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.6 
 
 
259 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1884  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.13 
 
 
258 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000396006  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3786  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.37 
 
 
257 aa  166  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.554974 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2291  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.37 
 
 
257 aa  165  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.276958  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2871  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.13 
 
 
263 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00247676  normal  0.571794 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.82 
 
 
252 aa  165  8e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.43 
 
 
252 aa  164  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.37 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2445  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.43 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1299  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.74 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1364  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.74 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3665  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.02 
 
 
257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.952724  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0842  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.45 
 
 
254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2021  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.55 
 
 
258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000360558  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.66 
 
 
257 aa  162  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0870  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.51 
 
 
267 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139904  normal  0.346308 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.11 
 
 
258 aa  161  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1462  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.48 
 
 
240 aa  160  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0144845  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1972  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.52 
 
 
245 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293472 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2207  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.06 
 
 
259 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.181464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>