242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0296 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0296  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  596  1e-169  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2721  hypothetical protein  44.37 
 
 
293 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.151584  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2086  hypothetical protein  45.73 
 
 
293 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0249545 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2900  hypothetical protein  43.69 
 
 
293 aa  248  7e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1404  hypothetical protein  43.34 
 
 
293 aa  248  7e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1140  hypothetical protein  45.39 
 
 
293 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0011  YicC domain protein  36.95 
 
 
292 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.272506  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2402  hypothetical protein  36.27 
 
 
293 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0682346  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1599  hypothetical protein  34.69 
 
 
292 aa  171  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000017463  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2239  hypothetical protein  35 
 
 
292 aa  170  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0890  hypothetical protein  35.33 
 
 
292 aa  170  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000147276  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2328  hypothetical protein  34.69 
 
 
292 aa  168  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0372766  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2287  hypothetical protein  35.84 
 
 
291 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3163  hypothetical protein  32.99 
 
 
292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0449219  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2607  hypothetical protein  34.01 
 
 
291 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.034124  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1488  domain of unknown function DUF1732  36.15 
 
 
291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.283341 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1284  hypothetical protein  35.35 
 
 
292 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00734721  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1317  hypothetical protein  30.98 
 
 
294 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.269981  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1049  hypothetical protein  36.15 
 
 
292 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3214  hypothetical protein  34.88 
 
 
292 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2693  hypothetical protein  32.99 
 
 
291 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1698  hypothetical protein  33.67 
 
 
292 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.466508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3896  hypothetical protein  33.1 
 
 
289 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000579804  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2788  hypothetical protein  32.65 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1239  hypothetical protein  31.29 
 
 
292 aa  150  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.369152  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2525  hypothetical protein  33.89 
 
 
291 aa  149  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2690  hypothetical protein  34.56 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.886781  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3632  hypothetical protein  33.33 
 
 
293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.101055 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2320  hypothetical protein  31.33 
 
 
292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000274769  hitchhiker  0.00243432 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2574  hypothetical protein  32.97 
 
 
291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3972  hypothetical protein  33.22 
 
 
291 aa  146  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00569731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1271  hypothetical protein  33.22 
 
 
291 aa  146  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00975001  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3921  hypothetical protein  33.11 
 
 
291 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.831608  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2881  hypothetical protein  31.63 
 
 
292 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000426445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3916  hypothetical protein  33.11 
 
 
291 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3632  hypothetical protein  33.11 
 
 
291 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3887  hypothetical protein  33.11 
 
 
291 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000222822 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3724  hypothetical protein  33.11 
 
 
291 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3614  hypothetical protein  33.11 
 
 
291 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4011  hypothetical protein  33.11 
 
 
291 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0783  domain of unknown function DUF1732  31.63 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000478658  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1327  protein of unknown function DUF1732  28.52 
 
 
291 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0133754  normal  0.451646 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1469  domain of unknown function DUF1732  32.9 
 
 
287 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000162947  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  32.77 
 
 
288 aa  136  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1684  hypothetical protein  31.44 
 
 
295 aa  136  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2441  hypothetical protein  29.79 
 
 
294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000733927 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1763  hypothetical protein  31.21 
 
 
290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1033  domain of unknown function DUF1732  32.67 
 
 
293 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3696  hypothetical protein  32.23 
 
 
291 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2003  hypothetical protein  28.72 
 
 
294 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1316  domain of unknown function DUF1732  31.29 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  31.86 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1721  hypothetical protein  28.72 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1774  hypothetical protein  30.59 
 
 
295 aa  133  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.593354  normal  0.167904 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1793  hypothetical protein  28.47 
 
 
293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  30.61 
 
 
288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  30.27 
 
 
288 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0406  hypothetical protein  31.08 
 
 
287 aa  133  5e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.71757  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2051  YicC domain protein  32.56 
 
 
293 aa  132  6e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.974794  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  29.25 
 
 
288 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02195  hypothetical protein  30.14 
 
 
281 aa  132  6.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  29.69 
 
 
287 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1781  hypothetical protein  31.08 
 
 
287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.843974  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3026  hypothetical protein  30.33 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  30.61 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0065  hypothetical protein  29.9 
 
 
297 aa  130  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0138  hypothetical protein  31.23 
 
 
293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0296876 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0838  YicC domain protein  31.62 
 
 
293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.422723  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0403  hypothetical protein  30.92 
 
 
295 aa  129  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0196247  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2588  hypothetical protein  29.63 
 
 
288 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  30.03 
 
 
287 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0562  yicC family protein  30.98 
 
 
287 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0716  domain of unknown function DUF1732  30.98 
 
 
287 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637431  hitchhiker  0.00000131074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0322  domain of unknown function DUF1732  28.62 
 
 
295 aa  129  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2055  hypothetical protein  29.79 
 
 
287 aa  128  9.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000329302  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1457  hypothetical protein  31.67 
 
 
295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500736  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  29.25 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2167  hypothetical protein  29.45 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  29.69 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  30.03 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0989  YicC domain protein  32.77 
 
 
294 aa  126  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0120989 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1912  hypothetical protein  31.76 
 
 
294 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0397702  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  29.49 
 
 
287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0975  hypothetical protein  29.8 
 
 
293 aa  126  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.538355  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0741  hypothetical protein  28.77 
 
 
286 aa  126  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0046  hypothetical protein  28.33 
 
 
288 aa  125  6e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  28.67 
 
 
287 aa  125  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  31.08 
 
 
287 aa  125  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  29.69 
 
 
287 aa  125  9e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4569  hypothetical protein  29.35 
 
 
287 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000202204 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1993  hypothetical protein  28.72 
 
 
288 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4405  hypothetical protein  29.43 
 
 
287 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  29.39 
 
 
288 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.465243 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4021  hypothetical protein  29.43 
 
 
288 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0372  hypothetical protein  29.53 
 
 
291 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.816164  normal  0.284607 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0417  hypothetical protein  30.43 
 
 
295 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  29.15 
 
 
287 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  29.15 
 
 
287 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  29.15 
 
 
287 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  29.15 
 
 
287 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>